151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2445 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2445  HPP family protein  100 
 
 
202 aa  397  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0138  HPP family protein+B94  62.69 
 
 
179 aa  231  7.000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0685098 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4921  HPP family protein  50 
 
 
199 aa  162  3e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99219  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0503  HPP family membrane protein  51 
 
 
186 aa  158  4e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1921  HPP family protein  53.23 
 
 
178 aa  159  4e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0464  HPP family protein+B94  53.71 
 
 
175 aa  157  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.938531 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2508  HPP family protein  46.63 
 
 
231 aa  156  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000920608  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1999  CBS domain-containing protein  47.09 
 
 
199 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.617912 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1127  HPP  42.36 
 
 
184 aa  154  1e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.020454  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2401  HPP  50.85 
 
 
178 aa  147  7e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0730  HPP family protein  46.51 
 
 
194 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6723  HPP family protein  47.98 
 
 
185 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.250369  normal  0.81684 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0632  HPP family protein+B94  43.63 
 
 
183 aa  144  6e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0469  HPP family protein  42.72 
 
 
207 aa  140  9.999999999999999e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0524  HPP family protein  49.16 
 
 
178 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.734133  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3855  HPP family protein  47.29 
 
 
182 aa  134  9e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0081  HPP family protein  46.57 
 
 
182 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0079  HPP family protein  46.57 
 
 
182 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3346  CBS domain-containing protein  51.65 
 
 
182 aa  132  3e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0083  HPP family protein  45.59 
 
 
182 aa  132  5e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.687562 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0078  HPP family protein?  44.61 
 
 
182 aa  131  5e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0083  HPP family protein?  44.61 
 
 
182 aa  131  5e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0064  HPP family protein+B94  44.61 
 
 
182 aa  131  6e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0081  HPP family protein  44.61 
 
 
182 aa  131  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4271  HPP family protein  44.12 
 
 
182 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1207  HPP family protein+B94  42.79 
 
 
176 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3703  HPP family protein+B94  42.86 
 
 
188 aa  124  8.000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.422801  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2943  HPP family protein+B94  39.6 
 
 
189 aa  118  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825304  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3792  HPP family protein  38.89 
 
 
190 aa  118  7e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0666  HPP family protein+B94  40.31 
 
 
174 aa  118  7e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000611096  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1297  HPP family protein  41.58 
 
 
188 aa  114  8.999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000152799 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3150  HPP family protein  41.29 
 
 
164 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.970731  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1896  HPP family protein  41.09 
 
 
190 aa  108  7.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.891291  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3929  CBS domain-containing protein  33.5 
 
 
325 aa  106  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2928  HPP family protein?  41.05 
 
 
188 aa  105  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0299  HPP  39.9 
 
 
175 aa  100  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.618442  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2126  HPP domain-containing protein  40.14 
 
 
173 aa  98.2  7e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.821618  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4307  hypothetical protein  33.17 
 
 
184 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0999  hypothetical protein  33.17 
 
 
184 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1124  hypothetical protein  32.16 
 
 
184 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2162  HPP family protein+B94  41.01 
 
 
169 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.503667  normal  0.0389709 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1037  hypothetical protein  32.16 
 
 
184 aa  95.9  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.86469e-21 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4776  HPP family protein  37.57 
 
 
189 aa  96.3  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5583  CBS domain-containing protein  43.53 
 
 
392 aa  95.9  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.849861  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0895  hypothetical protein  31.16 
 
 
184 aa  95.9  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0953  hypothetical protein  31.16 
 
 
184 aa  95.9  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0871  hypothetical protein  31.66 
 
 
184 aa  95.5  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00388157  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0854  membrane spanning protein  31.16 
 
 
184 aa  94  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0430  HPP family protein?  34.48 
 
 
240 aa  92.4  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.126514  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2325  CBS domain-containing protein  44.83 
 
 
285 aa  91.7  6e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.820911  normal  0.700753 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1488  HPP family/CBS domain-containing protein  39.41 
 
 
397 aa  91.3  8e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1197  HPP family protein  39.41 
 
 
382 aa  90.5  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.528927  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0159  HPP family/CBS domain-containing protein  39.41 
 
 
397 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0437  HPP family protein  39.41 
 
 
397 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1403  HPP family/CBS domain-containing protein  39.41 
 
 
465 aa  90.5  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.202725  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1140  HPP family/CBS domain-containing protein  39.41 
 
 
382 aa  90.5  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0846  HPP family protein+B94  33.79 
 
 
207 aa  89  4e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.164128 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1960  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
180 aa  88.2  7e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.831698  normal  0.993391 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2629  HPP family protein?  33.33 
 
 
164 aa  87.8  9e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0334543 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1929  HPP  39.13 
 
 
323 aa  87.4  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.171366  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2015  CBS domain containing membrane protein  40.24 
 
 
368 aa  87.4  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00292892  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1070  HPP family protein  35.91 
 
 
301 aa  86.7  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496114  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5455  CBS domain containing membrane protein  34.3 
 
 
379 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4302  HPP family protein  35.79 
 
 
238 aa  86.7  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0007  HPP family protein  40 
 
 
346 aa  85.5  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.730187  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2351  HPP domain-containing protein  32.77 
 
 
324 aa  84.7  8e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64520  predicted protein  31.87 
 
 
286 aa  84.7  8e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0252407  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1392  hypothetical protein  35.21 
 
 
159 aa  84  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2402  CBS domain-containing protein  34.48 
 
 
449 aa  83.6  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1395  HPP family protein  38.75 
 
 
416 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.877198  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4702  CBS domain containing membrane protein  34.3 
 
 
379 aa  82  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0125248  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00020  conserved hypothetical protein  39.46 
 
 
405 aa  82  0.000000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05260  conserved hypothetical protein  39.46 
 
 
405 aa  82  0.000000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.615114  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0583  CBS domain-containing protein  40.35 
 
 
376 aa  81.6  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0461407  normal  0.660708 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3928  CBS domain-containing protein  37.79 
 
 
387 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000126137 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02209  HPP family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G07010)  34.48 
 
 
307 aa  80.9  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.21118  normal  0.252152 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0130  hypothetical protein  40.3 
 
 
378 aa  80.9  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2885  HPP family protein  33.8 
 
 
159 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3090  HPP family protein?  34.51 
 
 
159 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3233  HPP family protein?  34.51 
 
 
159 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2981  HPP family protein  32.93 
 
 
159 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1473  CBS domain-containing protein  41.73 
 
 
390 aa  79.3  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1498  HPP domain protein  38.24 
 
 
284 aa  79  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0190022  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6427  CBS domain-containing protein  34.1 
 
 
361 aa  79  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5317  CBS domain containing membrane protein  34.88 
 
 
376 aa  79  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4053  CBS domain-containing protein  39.33 
 
 
400 aa  79  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.250275  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5364  HPP family protein?  33.91 
 
 
383 aa  78.6  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344775  normal  0.280172 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2361  CBS domain containing membrane protein  32.95 
 
 
379 aa  78.2  0.00000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0859081 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3426  HPP family protein?  35.37 
 
 
373 aa  78.2  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2087  HPP family protein?  33.14 
 
 
379 aa  78.2  0.00000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.211615  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1745  hypothetical protein  32.97 
 
 
181 aa  77.4  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0908487  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2802  HPP family protein  32.34 
 
 
159 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3678  CBS domain containing membrane protein  39.86 
 
 
377 aa  77  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0501093  normal  0.0630387 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2548  HPP family protein?  33.1 
 
 
391 aa  77  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.709048 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4486  CBS domain-containing protein  37.65 
 
 
373 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16132  normal  0.433507 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15991  hypothetical protein  34.09 
 
 
178 aa  75.5  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.456081  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0839  CBS domain containing membrane protein  36.84 
 
 
388 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5035  CBS domain containing membrane protein  34.55 
 
 
344 aa  74.7  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.352033  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1160  HPP family protein+B94  35.71 
 
 
120 aa  73.2  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.925167 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0019  CBS domain-containing protein  38.98 
 
 
410 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>