More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2401 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2401  nickel transporter permease NikB  100 
 
 		 313 aa  616  1e-175  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6075  nickel transporter permease NikB  63.31 
 
 		 319 aa  391  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2276  nickel transporter permease NikB  60.7 
 
 		 314 aa  385  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.293593  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7614  nickel transporter permease NikB  60.06 
 
 		 314 aa  384  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0803  nickel transporter permease NikB  56.55 
 
 		 314 aa  379  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.226349  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0753  nickel transporter permease NikB  56.23 
 
 		 314 aa  377  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03326  nickel transporter subunit  55.7 
 
 		 314 aa  362  4e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0238  nickel ABC transporter, permease subunit NikB  55.7 
 
 		 314 aa  362  4e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0239  nickel transporter permease NikB  55.7 
 
 		 314 aa  362  4e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3676  nickel transporter permease NikB  55.7 
 
 		 314 aa  362  4e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3959  nickel transporter permease NikB  55.7 
 
 		 314 aa  362  4e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3844  nickel transporter permease NikB  55.7 
 
 		 314 aa  362  4e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03279  hypothetical protein  55.7 
 
 		 314 aa  362  4e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4817  nickel transporter permease NikB  55.7 
 
 		 314 aa  362  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3761  nickel transporter permease NikB  55.7 
 
 		 314 aa  361  8e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1031  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.18 
 
 		 312 aa  360  1e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0169288  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3006  nickel transporter permease NikB  59.67 
 
 		 313 aa  348  7e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0438476  normal  0.3014 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3343  nickel transporter permease NikB  59.34 
 
 		 313 aa  346  3e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0350  nickel ABC transporter, permease subunit NikB  52.26 
 
 		 310 aa  346  4e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1322  nickel transport system permease protein NikB  50.81 
 
 		 310 aa  343  2e-93  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00196564  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1835  nickel transporter permease NikB  56.77 
 
 		 314 aa  340  2e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.829834  hitchhiker  0.0019148 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0386  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.35 
 
 		 312 aa  300  2e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0369  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.28 
 
 		 316 aa  279  4e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0021  nickel ABC transporter, permease subunit NikB  42.53 
 
 		 311 aa  276  3e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00143513  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1223  Nickel-transporting ATPase  41.47 
 
 		 339 aa  251  1e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0308435 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2031  ABC transporter, permease protein  44.34 
 
 		 313 aa  246  2e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.381274  normal  0.768388 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.74 
 
 		 306 aa  246  4.9999999999999997e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0511  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.03 
 
 		 314 aa  241  1e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0627  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.56 
 
 		 306 aa  240  2e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.579769  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2404  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.72 
 
 		 308 aa  240  2.9999999999999997e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.99 
 
 		 306 aa  239  5e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.333133  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3142  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.36 
 
 		 326 aa  239  6.999999999999999e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.115178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13220  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  43.51 
 
 		 308 aa  238  9e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.444748  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1517  peptide ABC transporter, permease protein  39.42 
 
 		 314 aa  238  1e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0892192  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.86 
 
 		 334 aa  237  1e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.32 
 
 		 311 aa  238  1e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.184188  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.49 
 
 		 334 aa  236  3e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000955673 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3675  oligopeptide ABC transporter, permease  40.58 
 
 		 316 aa  236  4e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0490538 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.6 
 
 		 334 aa  234  1.0000000000000001e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0719  hypothetical protein  39.61 
 
 		 316 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.870853 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.64 
 
 		 335 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.948745  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6293  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.52 
 
 		 323 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.740453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0984  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.09 
 
 		 313 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.422815  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.91 
 
 		 311 aa  231  1e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.642024 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00798  predicted peptide transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  40.91 
 
 		 306 aa  230  2e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472093  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2811  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.91 
 
 		 306 aa  230  2e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.473558  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0902  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  40.91 
 
 		 306 aa  230  2e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0808  oligopeptide ABC transporter, permease  36.59 
 
 		 316 aa  230  2e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.282065  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00815  hypothetical protein  40.91 
 
 		 306 aa  230  2e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.558182  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0889  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  40.91 
 
 		 306 aa  230  2e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.952014  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0856  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  40.91 
 
 		 306 aa  230  2e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0982  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  40.91 
 
 		 306 aa  230  2e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2813  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.91 
 
 		 306 aa  230  2e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3004  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.58 
 
 		 306 aa  230  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0891  glutathione ABC transporter, permease protein  41.23 
 
 		 306 aa  229  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.976092  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1001  glutathione ABC transporter permease  41.23 
 
 		 306 aa  229  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.58 
 
 		 306 aa  229  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14841  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.58 
 
 		 306 aa  229  4e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.740963 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.94 
 
 		 306 aa  229  5e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.91 
 
 		 307 aa  229  5e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.237541  normal  0.589028 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0644  oligopeptide ABC transporter, permease protein  38.46 
 
 		 314 aa  228  7e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1320  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.58 
 
 		 307 aa  229  7e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.525141  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1444  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.15 
 
 		 323 aa  228  8e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0980  glutathione ABC transporter permease  40.91 
 
 		 306 aa  228  8e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.73 
 
 		 324 aa  228  8e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0951  glutathione ABC transporter permease  40.91 
 
 		 306 aa  228  8e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.258662  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1001  oligopeptide ABC transporter, permease protein  36.59 
 
 		 316 aa  228  9e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0946  oligopeptide ABC transporter, permease protein  36.91 
 
 		 316 aa  228  9e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170303  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2517  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  40.58 
 
 		 306 aa  228  1e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503163  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1381  transmembrane ABC transporter protein  40.84 
 
 		 307 aa  228  1e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.796345  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0823  oligopeptide ABC transporter, permease  36.59 
 
 		 316 aa  228  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.164685  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0469  nickel ABC transporter, permease protein  40.59 
 
 		 309 aa  228  1e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0804  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.59 
 
 		 316 aa  228  1e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00583871  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0918  inner membrane ABC transporter permease protein YddR  40.91 
 
 		 306 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2408  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.48 
 
 		 316 aa  228  1e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4093  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.36 
 
 		 321 aa  228  1e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.21 
 
 		 306 aa  228  1e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0997  oligopeptide ABC transporter, permease protein  36.28 
 
 		 316 aa  227  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.28482e-62 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2789  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.47 
 
 		 306 aa  227  2e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4385  oligopeptide ABC transporter, permease protein  36.91 
 
 		 316 aa  227  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.02052e-22 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1552  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.88 
 
 		 306 aa  226  3e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1814  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.63 
 
 		 326 aa  227  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.443976  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1434  peptide ABC transporter, permease protein  40.06 
 
 		 326 aa  226  4e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.393954  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0270  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.85 
 
 		 321 aa  226  4e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2958  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.96 
 
 		 315 aa  226  4e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.82 
 
 		 328 aa  226  4e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.52 
 
 		 306 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3989  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.91 
 
 		 306 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3257  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  40.91 
 
 		 306 aa  225  7e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0859  oligopeptide ABC transporter permease  36.28 
 
 		 316 aa  225  8e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0909  oligopeptide ABC transporter permease protein  36.28 
 
 		 316 aa  225  8e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0836804  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4475  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.66 
 
 		 326 aa  225  9e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.195389 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.03 
 
 		 322 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.59 
 
 		 317 aa  224  1e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3392  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.03 
 
 		 322 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0066  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.75 
 
 		 334 aa  224  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0998  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.02 
 
 		 308 aa  224  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.03 
 
 		 322 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0476049  normal  0.20897 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.58 
 
 		 306 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.819891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.42 
 
 		 311 aa  224  2e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000854239  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>