More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2384 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2384  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
374 aa  741    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0256  glycosyl transferase, group 1 family protein  55.04 
 
 
355 aa  352  7e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1108  glycosyl transferase group 1  43.51 
 
 
357 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0280638  normal  0.0326528 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1755  glycosyl transferase group 1  44.59 
 
 
358 aa  237  3e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.289237  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0330  glycosyl transferase, group 1  36.31 
 
 
368 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.152516 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.2 
 
 
366 aa  124  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.71 
 
 
365 aa  114  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0112  glycosyl transferase, group 1  29.66 
 
 
367 aa  113  5e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  27.78 
 
 
360 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1923  glycosyl transferase, group 1  25.58 
 
 
368 aa  108  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.80295  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  27.22 
 
 
374 aa  106  6e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2253  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.08 
 
 
371 aa  104  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.531555  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2752  glycosyl transferase, group 1  30.65 
 
 
401 aa  103  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  32.03 
 
 
379 aa  102  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2276  glycosyl transferase group 1  26.38 
 
 
447 aa  100  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 
393 aa  100  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  28.07 
 
 
376 aa  99.8  7e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  28.32 
 
 
380 aa  99.4  9e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.56 
 
 
419 aa  99  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3953  glycosyl transferase group 1  27.2 
 
 
374 aa  99.4  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  26.77 
 
 
394 aa  99  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0577  glycosyl transferase, group 1  27.89 
 
 
355 aa  95.1  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3481  glycosyl transferase group 1  25.66 
 
 
344 aa  94.7  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1355  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.33 
 
 
413 aa  94.4  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  28.39 
 
 
377 aa  93.6  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  30.35 
 
 
371 aa  93.6  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  26.85 
 
 
382 aa  93.2  7e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2364  Glycosyltransferase-like protein  26.76 
 
 
395 aa  92.4  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  31.79 
 
 
377 aa  92  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  28.77 
 
 
369 aa  92.4  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2129  glycosyl transferase group 1  26.72 
 
 
364 aa  91.7  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 
398 aa  91.7  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  33.61 
 
 
381 aa  91.3  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0158  glycosyl transferase, group 1  27.52 
 
 
398 aa  90.9  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  26.75 
 
 
377 aa  90.1  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  27.09 
 
 
390 aa  89.7  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3107  glycosyl transferase group 1  29.9 
 
 
426 aa  89.7  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5117  glycosyltransferase group 1 family protein  24.55 
 
 
366 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000816463  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  27.03 
 
 
361 aa  87.8  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  30.37 
 
 
389 aa  87.8  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  26.29 
 
 
390 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4708  glycosyl transferase group 1  36.11 
 
 
418 aa  87  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.514087 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  26.48 
 
 
403 aa  86.7  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  28.29 
 
 
427 aa  86.7  5e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  34.78 
 
 
367 aa  86.7  7e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3432  glycosyl transferase group 1  31.98 
 
 
419 aa  86.7  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4198  glycosyl transferase group 1  27.95 
 
 
405 aa  86.3  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  29.86 
 
 
398 aa  86.3  9e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1149  glycosyl transferase group 1  29.7 
 
 
389 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5516  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.29 
 
 
366 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5273  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.29 
 
 
366 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0104828  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5100  glycosyltransferase group 1 family protein  24.29 
 
 
366 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000151173  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5670  group 1 family glycosyl transferase  24.29 
 
 
366 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00270519  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  28.96 
 
 
371 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0792  Fis family transcriptional regulator  27.18 
 
 
342 aa  85.5  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  26.86 
 
 
385 aa  84.7  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  29.05 
 
 
392 aa  84  0.000000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5214  glycosyl transferase group 1  25.52 
 
 
369 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00137382  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00458  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.07 
 
 
363 aa  83.6  0.000000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  30.54 
 
 
401 aa  83.2  0.000000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  23.73 
 
 
384 aa  83.2  0.000000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0238  glycosyl tranferase  23.92 
 
 
343 aa  82.4  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  28.8 
 
 
388 aa  82.4  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1934  glycosyl transferase, group 1  29.82 
 
 
367 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.142623 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0879  glycosyl transferase group 1  33.85 
 
 
402 aa  82.8  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0254589  normal  0.0859714 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2778  glycosyl transferase, group 1  33.07 
 
 
413 aa  82  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0185  glycosyl tranferase  23.92 
 
 
343 aa  82.4  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.472574  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4592  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
370 aa  82.8  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3098  glycosyl transferase group 1  22.47 
 
 
363 aa  81.6  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2716  glycosyl transferase group 1  33.19 
 
 
733 aa  81.6  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  31.16 
 
 
409 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0079  glycosyltransferase, putative  30.89 
 
 
403 aa  80.9  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.471525  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5601  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.32 
 
 
369 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000123727  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0082  glycosyl transferase group 1  30.89 
 
 
403 aa  80.9  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1351  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.52 
 
 
390 aa  81.3  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5406  glycosyltransferase  25.58 
 
 
369 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000781684  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  30.45 
 
 
367 aa  80.9  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  29.66 
 
 
413 aa  80.5  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  25.79 
 
 
360 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  25.29 
 
 
406 aa  80.5  0.00000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  27.98 
 
 
378 aa  79.7  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  29.7 
 
 
414 aa  79.7  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1425  glycosyl transferase group 1  25.76 
 
 
468 aa  79.7  0.00000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.703524  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3016  glycosyl transferase group 1  29.61 
 
 
373 aa  79.7  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3376  glycosyl transferase, group 1  28.61 
 
 
432 aa  79.7  0.00000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666648  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  29.1 
 
 
390 aa  79.3  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1803  glycosyl transferase, group 1  32.32 
 
 
409 aa  79  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  23.54 
 
 
369 aa  79.3  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0613  glycosyl transferase, group 1 family protein / moaA/nifB/pqqE family protein  27.51 
 
 
778 aa  78.2  0.0000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.12808  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5549  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.06 
 
 
369 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000141225  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5953  UDP-N-acetylglucosamine  27.81 
 
 
443 aa  78.2  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3935  glycosyl transferase group 1  25.79 
 
 
367 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000241521  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1116  glycosyltransferase  32.68 
 
 
413 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3120  glycosyl transferase, group 1  29.17 
 
 
366 aa  77.4  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0017817  unclonable  0.0000176244 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4016  glycosyl transferase, group 1  32.09 
 
 
378 aa  77.4  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  32.58 
 
 
362 aa  77  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  29.35 
 
 
383 aa  77.4  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4759  glycosyl transferase group 1  24.73 
 
 
374 aa  77  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000028902  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  25.63 
 
 
364 aa  76.6  0.0000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  28.05 
 
 
371 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>