More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2382 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2382  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 
349 aa  721    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0328  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  85.96 
 
 
349 aa  632  1e-180  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0254  aspartate semialdehyde dehydrogenase  81.03 
 
 
348 aa  586  1e-166  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1757  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  80.6 
 
 
341 aa  546  1e-154  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.783502  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2274  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  74.71 
 
 
348 aa  545  1e-154  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1106  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  74.55 
 
 
340 aa  526  1e-148  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0598378  normal  0.0183621 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0910  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  66.67 
 
 
339 aa  448  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000070881  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3351  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  66.97 
 
 
339 aa  449  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0830053 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0604  aspartate semialdehyde dehydrogenase  67.87 
 
 
339 aa  443  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000271293  hitchhiker  0.00940362 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1047  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  65.17 
 
 
339 aa  436  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00486598  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2990  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  63.13 
 
 
339 aa  433  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.478455  normal  0.64702 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3032  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  63.13 
 
 
339 aa  433  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.59861 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1903  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  64.56 
 
 
339 aa  428  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116797  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2220  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  59.53 
 
 
340 aa  413  1e-114  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.763212  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08670  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  58.23 
 
 
351 aa  405  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0724448  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3166  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  58.63 
 
 
340 aa  404  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0961  aspartate semialdehyde dehydrogenase  58.56 
 
 
332 aa  391  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1066  aspartate semialdehyde dehydrogenase  61.68 
 
 
335 aa  391  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.058115  hitchhiker  0.00506315 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1135  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  57.36 
 
 
333 aa  392  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0972  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  58.13 
 
 
338 aa  389  1e-107  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2250  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  59.82 
 
 
340 aa  390  1e-107  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2221  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  59.36 
 
 
340 aa  391  1e-107  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_845  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  58.43 
 
 
338 aa  389  1e-107  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.514485  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2183  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  59.57 
 
 
329 aa  390  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0945  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  60.24 
 
 
336 aa  388  1e-107  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1941  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  57.83 
 
 
340 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.733379  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1186  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  58.81 
 
 
344 aa  389  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1808  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  58.75 
 
 
340 aa  389  1e-107  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.996773  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0887  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  58.81 
 
 
344 aa  386  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0831  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  58.81 
 
 
344 aa  386  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5289  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  58.58 
 
 
347 aa  385  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0237  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  58.46 
 
 
344 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00833547 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2062  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  58.73 
 
 
340 aa  381  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2214  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  58.16 
 
 
344 aa  381  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.244055  normal  0.319963 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2793  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  56.38 
 
 
344 aa  381  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.430867  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2074  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  56.01 
 
 
340 aa  384  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3593  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  56.68 
 
 
344 aa  381  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0687  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  57.23 
 
 
337 aa  384  1e-105  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3384  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  57.91 
 
 
344 aa  384  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3570  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  55.75 
 
 
348 aa  381  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00136281  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1731  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  56.01 
 
 
340 aa  384  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0683511  hitchhiker  0.00261875 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1782  aspartate semialdehyde dehydrogenase  59.64 
 
 
339 aa  384  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.017997  hitchhiker  0.00498224 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0863  aspartate semialdehyde dehydrogenase  56.93 
 
 
338 aa  383  1e-105  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3182  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  57.86 
 
 
344 aa  384  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3838  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  55.75 
 
 
348 aa  379  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.747438  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3652  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  55.75 
 
 
349 aa  381  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0452792  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3542  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  55.75 
 
 
349 aa  381  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000959699  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3560  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  55.75 
 
 
349 aa  379  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0433298  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1400  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  55.75 
 
 
348 aa  380  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00002128  hitchhiker  5.26638e-21 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3812  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  55.75 
 
 
348 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.82392e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3937  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  55.75 
 
 
348 aa  380  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00621767  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3908  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  56.97 
 
 
344 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.117901 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3848  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  55.75 
 
 
348 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000145815  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3899  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  55.75 
 
 
348 aa  380  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00229604  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3660  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  56.88 
 
 
329 aa  378  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.487501  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1731  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  55.1 
 
 
358 aa  378  1e-104  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000172647  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4232  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  56.97 
 
 
344 aa  378  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0846709 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0344  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  57.57 
 
 
344 aa  380  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.034026 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0238  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  58.68 
 
 
344 aa  377  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3185  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  58.68 
 
 
344 aa  375  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00609082 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0800  aspartate-semialdehyde dehydrogenase, USG-1 related  54.38 
 
 
340 aa  374  1e-103  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000180575  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0338  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  56.97 
 
 
344 aa  378  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1248  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  57.02 
 
 
340 aa  376  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.207297  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3363  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  57.01 
 
 
338 aa  377  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.81581  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0410  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  54.98 
 
 
335 aa  375  1e-103  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.133119  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1231  aspartate semialdehyde dehydrogenase  56.67 
 
 
340 aa  376  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.160291 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0229  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  57.57 
 
 
344 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2824  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  58.98 
 
 
344 aa  377  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.163926  normal  0.649951 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1168  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  53.45 
 
 
348 aa  372  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000189528  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0122  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  58.81 
 
 
345 aa  372  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2929  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  58.08 
 
 
344 aa  373  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.047306 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1051  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  55.2 
 
 
358 aa  374  1e-102  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000545446  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2453  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  54.89 
 
 
348 aa  374  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000194693  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2392  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  53.03 
 
 
347 aa  373  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0493  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  56.38 
 
 
344 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.60024  normal  0.710301 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3514  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  57.19 
 
 
357 aa  373  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000101086 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2702  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  58.08 
 
 
344 aa  373  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.347697  normal  0.305752 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4363  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  56.12 
 
 
344 aa  372  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3290  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  56.72 
 
 
344 aa  373  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.378777  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2986  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  54.95 
 
 
332 aa  369  1e-101  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0787481  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2939  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  53.03 
 
 
347 aa  371  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0514925  hitchhiker  0.00000205933 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3654  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  57.53 
 
 
330 aa  370  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00566269  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2701  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  57.57 
 
 
343 aa  370  1e-101  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0139  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  56.59 
 
 
330 aa  369  1e-101  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0283298 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0350  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  56.63 
 
 
334 aa  370  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1101  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  55.22 
 
 
343 aa  370  1e-101  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0640  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  55.83 
 
 
344 aa  365  1e-100  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2228  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  52.16 
 
 
347 aa  366  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0790084  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2185  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.87 
 
 
347 aa  366  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.132113  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1715  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  58.21 
 
 
340 aa  366  1e-100  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0537  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  57.36 
 
 
329 aa  365  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2452  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  52.16 
 
 
347 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1016  aspartate-semialdehyde dehydrogenase, USG-1 related  55.99 
 
 
340 aa  368  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1410  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  56.97 
 
 
341 aa  365  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.308974  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0724  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  55.83 
 
 
344 aa  366  1e-100  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.675858  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2530  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.87 
 
 
347 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00134439  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04100  aspartate semialdehyde dehydrogenase  55.36 
 
 
346 aa  364  1e-99  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.917016 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2664  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  56.68 
 
 
341 aa  364  1e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2775  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  58.04 
 
 
340 aa  364  1e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3732  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  55.19 
 
 
336 aa  363  2e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357313  normal  0.740513 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>