More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2363 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2363  protein TolR  100 
 
 		 139 aa  276  7e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372464 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0281  biopolymer transport protein ExbD/TolR  89.93 
 
 		 139 aa  248  2e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149561  hitchhiker  0.000106063 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0861  protein TolR  77.21 
 
 		 152 aa  211  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000417761  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3630  biopolymer ExbD/TolR family transporter  71.43 
 
 		 146 aa  193  6e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1587  protein TolR  66.41 
 
 		 138 aa  176  9e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.437138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0586  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  64.39 
 
 		 136 aa  169  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0531481  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1460  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  55 
 
 		 158 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0840  biopolymer transport protein ExbD/TolR  51.16 
 
 		 137 aa  134  5e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0352738 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.76 
 
 		 144 aa  124  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0745  protein TolR  46.09 
 
 		 140 aa  117  3.9999999999999996e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000786072  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2977  TolR protein  46.76 
 
 		 144 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1908  ExbD/TolR family protein  47.79 
 
 		 141 aa  116  7.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3511  protein TolR  45.04 
 
 		 139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114553  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0612  ExbD/TolR family protein  46.03 
 
 		 143 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3580  protein TolR  44.27 
 
 		 139 aa  113  6.9999999999999995e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1699  ExbD/TolR family TonB system transport protein  42.57 
 
 		 150 aa  111  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3538  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.86 
 
 		 139 aa  111  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1641  protein TolR  42.57 
 
 		 150 aa  111  3e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1216  biopolymer transport TolR  41.89 
 
 		 150 aa  110  6e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212808  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0027  TolR protein  45.74 
 
 		 139 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200658  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0705  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.52 
 
 		 152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.105618  normal  0.350278 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2163  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.11 
 
 		 131 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0401461  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3498  protein TolR  41.94 
 
 		 151 aa  107  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124794 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3203  protein TolR  41.94 
 
 		 151 aa  107  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.349327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0857  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.97 
 
 		 139 aa  107  7.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.345374  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.58 
 
 		 149 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2901  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.57 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00149833  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2418  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.28 
 
 		 144 aa  103  7e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0695  protein TolR  42.47 
 
 		 150 aa  103  8e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0661  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.47 
 
 		 150 aa  103  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.602006  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0696  protein TolR  42.47 
 
 		 150 aa  103  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.76246  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2212  biopolymer transport TolR  39.26 
 
 		 140 aa  103  8e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000948089  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0748  protein TolR  42.06 
 
 		 155 aa  102  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.031429  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3619  protein TolR  43.31 
 
 		 152 aa  102  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2120  biopolymer transport TolR  40.76 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0523748  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2719  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.03 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.746273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0971  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.19 
 
 		 137 aa  102  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2154  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.09 
 
 		 155 aa  101  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.8914  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1109  biopolymer transport TolR  46.46 
 
 		 134 aa  101  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00176605  normal  0.311844 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1213  protein TolR  43.09 
 
 		 147 aa  101  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3173  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.69 
 
 		 149 aa  101  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.673251  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3058  biopolymer transport TolR  41.27 
 
 		 152 aa  100  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0312035  normal  0.159163 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4538  TolR protein  38.19 
 
 		 146 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2629  biopolymer transport TolR  42.52 
 
 		 149 aa  99.8  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51740  TolR protein  38.19 
 
 		 146 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101841  hitchhiker  0.0000169267 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3514  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.35 
 
 		 151 aa  97.8  4e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262132  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1227  tolR protein  39.42 
 
 		 146 aa  97.4  6e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165973  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2135  biopolymer transport, TolR  39.26 
 
 		 167 aa  97.1  7e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0068  TonB system transport protein ExbD  47.06 
 
 		 141 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2531  biopolymer transport protein  35.51 
 
 		 142 aa  95.9  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000400528  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0150  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40 
 
 		 149 aa  96.3  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000194485  hitchhiker  0.00605756 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0204  biopolymer transport protein ExbD  46.22 
 
 		 141 aa  94.4  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2192  biopolymer transport TolR  35.43 
 
 		 142 aa  94.4  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0164726  normal  0.458286 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2367  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.94 
 
 		 162 aa  94.7  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1092  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.07 
 
 		 166 aa  94  6e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0391  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.98 
 
 		 159 aa  94  6e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0527  protein TolR  39.37 
 
 		 155 aa  94  6e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2231  TolR protein  39.42 
 
 		 148 aa  94  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0135  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.11 
 
 		 156 aa  94  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0205  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.61 
 
 		 139 aa  93.6  8e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000105504  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0470  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.67 
 
 		 141 aa  92.8  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.923665 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0684  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.41 
 
 		 154 aa  92.8  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.508331  normal  0.11063 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0825  TonB system transport protein ExbD  46.61 
 
 		 153 aa  93.2  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.027584 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3239  tolR protein  37.14 
 
 		 148 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24442  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3121  protein TolR  39.01 
 
 		 142 aa  92  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0671  ExbD/TolR family protein  41.73 
 
 		 156 aa  92.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045773  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2324  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.73 
 
 		 156 aa  92.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0663066  normal  0.292388 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2533  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40 
 
 		 144 aa  92.8  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432796  normal  0.100758 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0594  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.62 
 
 		 143 aa  92.4  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0560  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.73 
 
 		 156 aa  92.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2370  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40 
 
 		 144 aa  92.8  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000201992  normal  0.146866 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1238  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.45 
 
 		 137 aa  91.7  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5556  biopolymer transport protein ExbD  44.92 
 
 		 142 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3995  protein TolR  35.81 
 
 		 150 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3136  protein TolR  37.88 
 
 		 146 aa  91.7  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1275  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.46 
 
 		 150 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.146064  normal  0.370968 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0506  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.16 
 
 		 154 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529067  hitchhiker  0.000695312 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4434  protein TolR  40.16 
 
 		 147 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0620039  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2540  protein TolR  42.22 
 
 		 144 aa  90.9  6e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000662541  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1740  biopolymer transport TolR  42.22 
 
 		 144 aa  90.9  6e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000388711  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1744  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.22 
 
 		 144 aa  90.9  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000276409  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4003  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.61 
 
 		 145 aa  90.9  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4210  TonB system transport protein ExbD type-1  41.6 
 
 		 142 aa  90.5  7e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1015  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.13 
 
 		 150 aa  90.5  7e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3325  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.09 
 
 		 137 aa  90.5  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.110206  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1899  protein TolR  42.28 
 
 		 153 aa  90.1  8e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.937922 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1617  protein TolR  42.28 
 
 		 153 aa  90.1  8e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776263  hitchhiker  0.0037279 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0330  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.9 
 
 		 173 aa  90.5  8e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.175992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4198  protein TolR  35.14 
 
 		 150 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.843588  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3974  tolR protein  35.97 
 
 		 154 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0054859  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1531  hypothetical protein  36.11 
 
 		 151 aa  89.7  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1452  hypothetical protein  36.11 
 
 		 151 aa  89.7  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1413  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.97 
 
 		 154 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.039355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3472  protein TolR  46.77 
 
 		 137 aa  89.4  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0578496  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1619  protein TolR  42.28 
 
 		 153 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.1444  normal  0.157176 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5304  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  40 
 
 		 149 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.159444  normal  0.423662 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3389  protein TolR  40.98 
 
 		 145 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.436196  normal  0.250194 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0573  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.98 
 
 		 139 aa  89.4  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.234389  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1783  protein TolR  41.48 
 
 		 144 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000043737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1242  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.76 
 
 		 146 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0853044  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>