More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2360 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2360  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  100 
 
 		 446 aa  915    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.28939 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0278  WD40 domain-containing protein  77.03 
 
 		 463 aa  717    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00000605867  unclonable  0.0000100324 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0858  WD40 domain protein beta Propeller  64.66 
 
 		 439 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000315652  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3632  tolB protein, putative  58.43 
 
 		 441 aa  530  1e-149  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000231281  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0588  WD40 domain protein beta Propeller  46.7 
 
 		 439 aa  396  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000301748  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1585  WD40 domain protein beta Propeller  46.58 
 
 		 437 aa  397  1e-109  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.637887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  29.53 
 
 		 443 aa  204  2e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0614  TolB protein, putative  31.7 
 
 		 449 aa  194  4e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00377452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1910  TolB protein, putative  30.14 
 
 		 440 aa  180  4.999999999999999e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0747  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  30.18 
 
 		 444 aa  177  3e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000257607  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0755  TolB domain-containing protein  31.03 
 
 		 457 aa  174  3.9999999999999995e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2210  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  30.4 
 
 		 438 aa  170  6e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000769838  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2161  WD40 domain protein beta Propeller  31.31 
 
 		 440 aa  168  2e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000041437  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0750  WD40 domain protein beta Propeller  33.65 
 
 		 441 aa  166  5.9999999999999996e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000257042  normal  0.0548288 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  28.47 
 
 		 427 aa  164  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0859  WD40 domain-containing protein  27.49 
 
 		 442 aa  159  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.318178  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  27.25 
 
 		 432 aa  150  6e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  27.39 
 
 		 441 aa  149  8e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3540  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  31.2 
 
 		 429 aa  145  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000000050948  normal  1 
 
 
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  31.41 
 
 		 430 aa  145  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1711  WD40 domain protein beta Propeller  28.94 
 
 		 444 aa  143  7e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000750977  decreased coverage  0.0000915698 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1723  translocation protein TolB  26.23 
 
 		 443 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0502645 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  28.06 
 
 		 407 aa  141  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  28.66 
 
 		 407 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1011  translocation protein TolB  27.13 
 
 		 421 aa  139  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0133  WD40 domain protein beta Propeller  32.92 
 
 		 445 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  26.03 
 
 		 438 aa  134  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  26.57 
 
 		 435 aa  134  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2692  translocation protein TolB  26.97 
 
 		 408 aa  133  6e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1981  translocation protein TolB  26.03 
 
 		 440 aa  133  7.999999999999999e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2050  translocation protein TolB  25.69 
 
 		 429 aa  132  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1394  translocation protein TolB  29.93 
 
 		 442 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000203609  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1279  WD40 domain-containing protein  28.35 
 
 		 428 aa  130  7.000000000000001e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  26.48 
 
 		 436 aa  129  8.000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0242  translocation protein TolB  24.94 
 
 		 428 aa  128  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  26.19 
 
 		 426 aa  127  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  27.71 
 
 		 435 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2368  translocation protein TolB  30.03 
 
 		 442 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000751795  normal  0.188875 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2440  translocation protein TolB  30.03 
 
 		 442 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000137237  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2531  translocation protein TolB  30.03 
 
 		 442 aa  127  5e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000171266  normal  0.044306 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2748  translocation protein TolB  28.42 
 
 		 442 aa  124  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1944  translocation protein TolB  25.86 
 
 		 427 aa  124  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.526613 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1462  translocation protein TolB  29.35 
 
 		 442 aa  124  4e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000134108  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0659  TolB-like protein  27.23 
 
 		 434 aa  123  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.481566  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2092  translocation protein TolB  25.85 
 
 		 425 aa  122  9e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626129  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1346  translocation protein TolB  26.96 
 
 		 421 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1857  translocation protein TolB  28.42 
 
 		 442 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00113428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0694  TolB domain protein  26.96 
 
 		 434 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1607  translocation protein TolB  29.01 
 
 		 442 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000108344  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1527  translocation protein TolB  29.01 
 
 		 441 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000832022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0693  TolB domain protein  26.96 
 
 		 434 aa  121  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180783  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0898  TolB-like  26.8 
 
 		 432 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336659  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1785  translocation protein TolB  28.33 
 
 		 442 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000978843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2538  translocation protein TolB  28.33 
 
 		 442 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000186682  hitchhiker  0.0000162747 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1742  translocation protein TolB  28.33 
 
 		 442 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000714613  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1746  translocation protein TolB  28.33 
 
 		 442 aa  119  9e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000149314  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2194  translocation protein TolB  25 
 
 		 432 aa  119  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246481  normal  0.294233 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0068  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  25.91 
 
 		 422 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0067  tol-pal system beta propeller repeat protein TolB  25.91 
 
 		 422 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.518188  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1229  translocation protein TolB  25.55 
 
 		 424 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.910184  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3119  translocation protein TolB  25.75 
 
 		 439 aa  117  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1068  translocation protein TolB  26.22 
 
 		 439 aa  117  5e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.360403  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2564  translocation protein TolB  27.4 
 
 		 440 aa  117  6e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000866572  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0467  TolB domain-containing protein  27.87 
 
 		 450 aa  116  6.9999999999999995e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.84052  normal  0.495381 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0727  TolB domain-containing protein  25.34 
 
 		 437 aa  116  6.9999999999999995e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.162759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0303  translocation protein TolB  26.37 
 
 		 403 aa  116  7.999999999999999e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.307961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0694  translocation protein TolB  25.96 
 
 		 431 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2086  translocation protein TolB  27.99 
 
 		 441 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000540509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2731  translocation protein TolB  28.08 
 
 		 442 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00144802  decreased coverage  0.0000043993 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  25.18 
 
 		 450 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  25.96 
 
 		 446 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2217  translocation protein TolB  25.29 
 
 		 436 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01564  translocation protein TolB  24.57 
 
 		 439 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188797  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  27.22 
 
 		 415 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0949  translocation protein TolB  25.94 
 
 		 474 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.400419  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0328  translocation protein TolB  27.62 
 
 		 454 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4053  translocation protein TolB  24.53 
 
 		 437 aa  113  7.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  25.17 
 
 		 427 aa  113  7.000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2529  translocation protein TolB  28.33 
 
 		 445 aa  113  7.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000320948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2627  translocation protein TolB  27.87 
 
 		 436 aa  112  9e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2587  translocation protein TolB  24.88 
 
 		 431 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2717  translocation protein TolB  27.13 
 
 		 450 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.599754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0769  translocation protein TolB  25.35 
 
 		 431 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.103724  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  29.01 
 
 		 434 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3889  translocation protein TolB  25.35 
 
 		 431 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.53422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0677  translocation protein TolB  26.19 
 
 		 431 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814489  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  28.67 
 
 		 434 aa  111  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0317  translocation protein TolB  25.12 
 
 		 431 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0520547  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0800  translocation protein TolB  25.12 
 
 		 431 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.665253  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02684  translocation protein TolB  26.92 
 
 		 451 aa  110  4.0000000000000004e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0273488  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0592  TolB-like protein  26.95 
 
 		 438 aa  110  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2455  translocation protein TolB  24.37 
 
 		 430 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328002  normal  0.860267 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2714  translocation protein TolB  25.11 
 
 		 441 aa  108  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0459045  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0175  TolB protein  26.26 
 
 		 437 aa  108  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.313268  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1853  translocation protein TolB  28.72 
 
 		 428 aa  108  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019  TolB  26.42 
 
 		 440 aa  108  2e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.636869  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2122  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  27.29 
 
 		 446 aa  107  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256883  normal  0.227077 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1311  translocation protein TolB  26.76 
 
 		 444 aa  108  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1529  TolB protein  25.37 
 
 		 419 aa  106  7e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0759  translocation protein TolB  23.27 
 
 		 430 aa  106  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397862  normal  0.413932 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>