167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2342 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2342  protein of unknown function DUF81  100 
 
 
350 aa  688    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2818  hypothetical protein  92.84 
 
 
350 aa  581  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0626  hypothetical protein  78.98 
 
 
356 aa  507  9.999999999999999e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1641  protein of unknown function DUF81  72.13 
 
 
354 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.407514  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1975  hypothetical protein  48.88 
 
 
394 aa  264  1e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000141125  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1316  hypothetical protein  39.64 
 
 
339 aa  192  8e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.919916  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4296  protein of unknown function DUF81  37.04 
 
 
346 aa  176  6e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0285  protein of unknown function DUF81  38.85 
 
 
350 aa  175  9.999999999999999e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0253252 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0264  protein of unknown function DUF81  36.78 
 
 
345 aa  168  1e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0638  hypothetical protein  34.33 
 
 
355 aa  164  3e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.328833  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1044  protein of unknown function DUF81  35.71 
 
 
349 aa  150  2e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.161703  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1011  protein of unknown function DUF81  31.6 
 
 
362 aa  146  5e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0652909 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3721  protein of unknown function DUF81  34.21 
 
 
346 aa  146  5e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.766072  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1799  protein of unknown function DUF81  30.74 
 
 
356 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0315  protein of unknown function DUF81  29.67 
 
 
415 aa  139  7e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.24542  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  32.95 
 
 
307 aa  137  3.0000000000000003e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0967  protein of unknown function DUF81  32.58 
 
 
303 aa  135  8e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000092207  normal  0.442745 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  28.67 
 
 
305 aa  132  7.999999999999999e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1512  hypothetical protein  29.55 
 
 
360 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.864681  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0095  hypothetical protein  30 
 
 
356 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.571557  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  30.77 
 
 
307 aa  130  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  30.53 
 
 
306 aa  130  3e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0534  hypothetical protein  29.2 
 
 
310 aa  127  3e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.736309  normal  0.683051 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0703  protein of unknown function DUF81  31.74 
 
 
312 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.619223 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2103  protein of unknown function DUF81  31.15 
 
 
352 aa  125  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1353  hypothetical protein  30.22 
 
 
427 aa  125  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000251364  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0357  protein of unknown function DUF81  29.35 
 
 
420 aa  125  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.968564  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  30.08 
 
 
306 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1032  protein of unknown function DUF81  33.56 
 
 
329 aa  125  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  32.28 
 
 
307 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  30.08 
 
 
306 aa  122  8e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4256  protein of unknown function DUF81  33.21 
 
 
330 aa  122  8e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  28.57 
 
 
315 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2613  hypothetical protein  32.13 
 
 
361 aa  120  3e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.303309 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  31.36 
 
 
307 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1793  protein of unknown function DUF81  36.71 
 
 
348 aa  120  3e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1425  hypothetical protein  29.05 
 
 
426 aa  119  7e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0163769  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2642  hypothetical protein  29.24 
 
 
304 aa  119  7.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0148  hypothetical protein  29.87 
 
 
308 aa  119  9e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.171694 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1984  protein of unknown function DUF81  31.65 
 
 
415 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1427  hypothetical protein  32.14 
 
 
428 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000425148  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2100  hypothetical protein  34.45 
 
 
307 aa  117  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2673  protein of unknown function DUF81  29.55 
 
 
349 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.970315  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2287  hypothetical protein  30.77 
 
 
306 aa  116  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3098  hypothetical protein  30.51 
 
 
330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.075635  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0529  protein of unknown function DUF81  34.44 
 
 
301 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.639681  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0644  hypothetical protein  29.35 
 
 
417 aa  112  6e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2732  hypothetical protein  30.5 
 
 
307 aa  112  7.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.990455  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3547  hypothetical protein  30.16 
 
 
304 aa  112  8.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0800  hypothetical protein  28.47 
 
 
307 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.979856  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  28.37 
 
 
296 aa  110  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0741  hypothetical protein  28.16 
 
 
308 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.610206  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  28.37 
 
 
305 aa  110  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0881  protein of unknown function DUF81  29.24 
 
 
320 aa  109  6e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0602  hypothetical protein  32.24 
 
 
307 aa  109  6e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.116643  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3160  protein of unknown function DUF81  30.1 
 
 
443 aa  109  6e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0823  hypothetical protein  29.24 
 
 
316 aa  109  8.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.580669  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0772  hypothetical protein  29.24 
 
 
316 aa  109  8.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000254854  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2833  hypothetical protein  30.88 
 
 
415 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.260143  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0184  hypothetical protein  27.8 
 
 
343 aa  107  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.249656  normal  0.93927 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4610  hypothetical protein  27.64 
 
 
307 aa  106  6e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.427893  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4039  hypothetical protein  29.96 
 
 
306 aa  106  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.995552  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0807  putative permease  26.35 
 
 
308 aa  103  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0899504 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2487  hypothetical protein  31.18 
 
 
307 aa  99.8  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.741718 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3097  hypothetical protein  29.08 
 
 
307 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0521383  normal  0.0206179 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0758  protein of unknown function DUF81  27.92 
 
 
342 aa  90.5  4e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.154844  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5288  protein of unknown function DUF81  30.47 
 
 
307 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000586578  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  27.07 
 
 
266 aa  86.3  8e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0240  hypothetical protein  26.45 
 
 
313 aa  79.7  0.00000000000007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0364801  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1360  hypothetical protein  25 
 
 
266 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183653  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1470  hypothetical protein  25 
 
 
262 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3838  hypothetical protein  24.67 
 
 
266 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0242257  hitchhiker  0.000000000114081 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1575  hypothetical protein  24.67 
 
 
266 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.02028  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1334  hypothetical protein  25 
 
 
266 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00153027  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1333  hypothetical protein  25 
 
 
262 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105686  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1507  hypothetical protein  24.67 
 
 
266 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131683  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1375  hypothetical protein  24.23 
 
 
266 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1613  hypothetical protein  24.23 
 
 
266 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1910  hypothetical protein  24.51 
 
 
283 aa  73.9  0.000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.199806  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0245  hypothetical protein  27.11 
 
 
308 aa  72.8  0.000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.176673  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1150  hypothetical protein  25.35 
 
 
275 aa  72  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1418  hypothetical protein  25.61 
 
 
300 aa  71.6  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297306  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  27.42 
 
 
255 aa  67  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1182  hypothetical protein  23.18 
 
 
283 aa  65.1  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.801171  normal  0.428536 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1543  hypothetical protein  34.78 
 
 
139 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000133691 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3061  protein of unknown function DUF81  25.75 
 
 
300 aa  62  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0040  protein of unknown function DUF81  25.38 
 
 
309 aa  60.1  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0921  hypothetical protein  24.89 
 
 
275 aa  59.3  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0525574  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0940  hypothetical protein  24.89 
 
 
275 aa  59.3  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2913  protein of unknown function DUF81  27.76 
 
 
272 aa  56.2  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1173  protein of unknown function DUF81  24.19 
 
 
267 aa  55.5  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1097  hypothetical protein  21.48 
 
 
262 aa  54.7  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1672  protein of unknown function DUF81  24.9 
 
 
281 aa  55.1  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.12606  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  29.27 
 
 
2798 aa  54.3  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0031  permease  21.46 
 
 
257 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2483  hypothetical protein  30.17 
 
 
119 aa  54.3  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  30.37 
 
 
255 aa  54.3  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0302  hypothetical protein  23.76 
 
 
269 aa  54.3  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0509  hypothetical protein  23.11 
 
 
275 aa  53.9  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.986413  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0600  protein of unknown function DUF81  29.73 
 
 
278 aa  52.8  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>