More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2324 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2324  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
1162 aa  2323    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0634  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.73 
 
 
1000 aa  694    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.932649  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.57 
 
 
1075 aa  375  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1251  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.64 
 
 
1101 aa  359  1.9999999999999998e-97  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000252838 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.07 
 
 
1055 aa  319  2e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2187  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 
705 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1409  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.71 
 
 
778 aa  309  2.0000000000000002e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.32 
 
 
939 aa  295  2e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.660448  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1426  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.17 
 
 
1079 aa  295  5e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.688315  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2483  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.14 
 
 
1071 aa  283  1e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2628  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.78 
 
 
902 aa  280  1e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.97 
 
 
902 aa  276  1.0000000000000001e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  35.96 
 
 
1014 aa  276  2.0000000000000002e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.88 
 
 
1499 aa  274  7e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0718  sensory box histidine kinase/response regulator  36.16 
 
 
589 aa  274  8.000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.97168  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3479  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.23 
 
 
1078 aa  273  2e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2369  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.34 
 
 
1316 aa  272  2.9999999999999997e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.93 
 
 
993 aa  270  1e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.295041 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2309  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  50.71 
 
 
1055 aa  266  2e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1770  histidine kinase  53.68 
 
 
742 aa  264  8e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01579  Response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like protein  33.08 
 
 
891 aa  263  1e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0181  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.92 
 
 
837 aa  263  1e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.415169  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.28 
 
 
1326 aa  263  2e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0384  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.49 
 
 
1692 aa  263  2e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3749  histidine kinase  35.77 
 
 
935 aa  261  6e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0831  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.32 
 
 
957 aa  260  1e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0588  ATP-binding region ATPase domain protein  30.91 
 
 
1068 aa  259  2e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1769  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.37 
 
 
782 aa  259  2e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.497012  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4322  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.95 
 
 
1245 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.75 
 
 
1193 aa  257  1.0000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5346  PAS  37.53 
 
 
1060 aa  255  4.0000000000000004e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0738  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.43 
 
 
925 aa  255  4.0000000000000004e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1989  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.64 
 
 
1195 aa  254  8.000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2151  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.81 
 
 
963 aa  254  1e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.614764  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.55 
 
 
1287 aa  253  1e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0265  histidine kinase  33.1 
 
 
716 aa  253  2e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.431831 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2677  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  36.22 
 
 
636 aa  253  2e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.068934 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03530  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.08 
 
 
932 aa  251  4e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.21 
 
 
1044 aa  250  1e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227424  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0480  putative PAS/PAC sensor protein  32.46 
 
 
1686 aa  250  1e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1582  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.76 
 
 
788 aa  249  2e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2955  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.55 
 
 
764 aa  249  2e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1353  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.35 
 
 
1029 aa  249  3e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.283316  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3099  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.34 
 
 
918 aa  248  6e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.528607  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3164  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.34 
 
 
918 aa  248  6e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0703153 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0909  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.81 
 
 
876 aa  248  6.999999999999999e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.138917  normal  0.894742 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3238  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.65 
 
 
918 aa  247  6.999999999999999e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.943664  normal  0.0194611 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3117  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.34 
 
 
918 aa  247  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.306406  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3180  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.34 
 
 
918 aa  248  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.359202 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0743  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.08 
 
 
869 aa  247  6.999999999999999e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3278  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.34 
 
 
918 aa  247  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.225719 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.06 
 
 
1499 aa  246  1.9999999999999999e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.97 
 
 
1363 aa  245  3.9999999999999997e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1987  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.64 
 
 
767 aa  244  6e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1820  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
780 aa  244  7e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00145182  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.01 
 
 
676 aa  243  1e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00629905  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4255  PAS/PAC sensor, hybrid histidine kinase  36.86 
 
 
1418 aa  243  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377123  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0067  signal transduction histidine kinase-like protein protein  34.07 
 
 
1021 aa  243  2e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3502  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.1 
 
 
1236 aa  241  4e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02631  hybrid sensory histidine kinase, in two-component regulatory system with UvrY  33.77 
 
 
918 aa  241  5e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.228632  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0902  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.77 
 
 
918 aa  241  5e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.594186  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2924  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.77 
 
 
918 aa  241  5e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.301465  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3087  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.77 
 
 
918 aa  241  5e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000144797  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0926  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.77 
 
 
918 aa  241  5e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0352487  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02593  hypothetical protein  33.77 
 
 
918 aa  241  5e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.252422  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4046  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.77 
 
 
918 aa  241  5e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0239535  normal  0.782421 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3090  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.77 
 
 
918 aa  241  5e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000398111  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2930  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.77 
 
 
918 aa  241  5e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0577629  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1628  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.84 
 
 
1070 aa  240  1e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1424  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  50.36 
 
 
1050 aa  240  1e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.4662  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2520  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.04 
 
 
929 aa  239  2e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.314221  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3723  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  29.8 
 
 
903 aa  239  3e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.803649  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  41.52 
 
 
882 aa  238  4e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4963  two-component sensor response receiver component, histidine kinase  33.39 
 
 
1122 aa  238  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.341676 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0963  histidine kinase  33.51 
 
 
737 aa  238  4e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1425  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.97 
 
 
1096 aa  238  5.0000000000000005e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.579353  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1153  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.67 
 
 
1143 aa  238  6e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648529  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  33.66 
 
 
982 aa  236  2.0000000000000002e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0790  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.78 
 
 
906 aa  236  2.0000000000000002e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.437862  normal  0.397369 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2101  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.87 
 
 
678 aa  236  2.0000000000000002e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.007905  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1047  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.6 
 
 
952 aa  235  4.0000000000000004e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.017027  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3011  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.35 
 
 
1436 aa  234  6e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.701044  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4006  histidine kinase  31.84 
 
 
736 aa  234  7.000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155316  hitchhiker  0.00128379 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3493  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.11 
 
 
1782 aa  234  8.000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0298684  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2536  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.11 
 
 
801 aa  234  8.000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.087707 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0647  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.87 
 
 
790 aa  234  9e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2769  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.26 
 
 
773 aa  234  1e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1285  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.92 
 
 
937 aa  233  1e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000242189 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3038  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.02 
 
 
936 aa  233  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0749319  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3492  Cache sensor hybrid histidine kinase  36.71 
 
 
1041 aa  231  4e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.430212  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3358  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.47 
 
 
1436 aa  230  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.504651  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1875  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.45 
 
 
705 aa  230  1e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2176  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.97 
 
 
1007 aa  229  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2986  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.74 
 
 
1228 aa  229  2e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.387618 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.64 
 
 
995 aa  229  2e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5724  two-component regulatory system sensory histidine kinase  34.61 
 
 
784 aa  229  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1450  histidine kinase  34.6 
 
 
785 aa  229  3e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.106734  normal  0.251272 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5043  PAS  31.99 
 
 
855 aa  228  4e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.563138  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  29.08 
 
 
1763 aa  228  4e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3467  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.46 
 
 
865 aa  228  6e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>