More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2313 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2313  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 481 aa  955    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2890  DNA-directed DNA polymerase  72.21 
 
 		 386 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2317  DNA-directed DNA polymerase  65.14 
 
 		 426 aa  445  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3621  DNA-directed DNA polymerase  64.49 
 
 		 385 aa  432  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  58.75 
 
 		 425 aa  375  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1815  DNA-directed DNA polymerase  57.1 
 
 		 412 aa  372  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000272693  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1773  DNA-directed DNA polymerase  51.43 
 
 		 397 aa  351  1e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.49151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  51.49 
 
 		 384 aa  328  9e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5890  DNA-directed DNA polymerase  50.84 
 
 		 409 aa  294  2e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.315723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  43.31 
 
 		 389 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0732  DNA-directed DNA polymerase  48.02 
 
 		 363 aa  288  2e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.833353  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  46.99 
 
 		 419 aa  284  3.0000000000000004e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0145  DNA-directed DNA polymerase  51.31 
 
 		 399 aa  283  6.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0301883  normal  0.226149 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0141  DNA-directed DNA polymerase  49.56 
 
 		 418 aa  282  7.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  47.11 
 
 		 399 aa  282  8.000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  43.5 
 
 		 409 aa  281  2e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5112  DNA-directed DNA polymerase  46.86 
 
 		 420 aa  280  5e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360047  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3277  DNA-directed DNA polymerase  46 
 
 		 402 aa  279  8e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  46.13 
 
 		 419 aa  278  2e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2940  DNA-directed DNA polymerase  47.71 
 
 		 422 aa  277  3e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000325025  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  43.99 
 
 		 393 aa  277  3e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0883  DNA-directed DNA polymerase  43.15 
 
 		 360 aa  276  5e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1132  DNA-directed DNA polymerase  42.63 
 
 		 408 aa  276  8e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  45.56 
 
 		 410 aa  274  3e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1441  UMUC-like DNA-repair protein  43.36 
 
 		 407 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0043  ImpB/MucB/SamB family protein  43.4 
 
 		 413 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2492  DNA-directed DNA polymerase  39.45 
 
 		 409 aa  270  4e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  43.3 
 
 		 371 aa  269  7e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0148  DNA-directed DNA polymerase  47.79 
 
 		 418 aa  269  1e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2024  DNA-directed DNA polymerase  44.74 
 
 		 373 aa  268  1e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0159  DNA-directed DNA polymerase  47.49 
 
 		 418 aa  267  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1756  UMUC domain protein DNA-repair protein  38.71 
 
 		 409 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000481583  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1560  DNA-directed DNA polymerase  42.9 
 
 		 408 aa  267  2.9999999999999995e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3597  DNA-directed DNA polymerase  45 
 
 		 380 aa  266  8.999999999999999e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5353  DNA polymerase IV  44.63 
 
 		 378 aa  265  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198836  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0473  DNA-directed DNA polymerase  44.54 
 
 		 375 aa  265  1e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1547  DNA-directed DNA polymerase  43.18 
 
 		 425 aa  265  2e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153092  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2856  DNA-directed DNA polymerase  43.43 
 
 		 406 aa  263  4e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107741  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5155  DNA polymerase IV  43.79 
 
 		 363 aa  263  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.702969 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0318  DNA-directed DNA polymerase  41.9 
 
 		 372 aa  262  1e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3537  DNA-directed DNA polymerase  42.38 
 
 		 357 aa  262  1e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1574  DNA-directed DNA polymerase  42.34 
 
 		 410 aa  260  4e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1070  DNA-directed DNA polymerase  40.97 
 
 		 409 aa  260  4e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1272  DNA-directed DNA polymerase  43.1 
 
 		 359 aa  259  8e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2808  DNA polymerase IV  44.94 
 
 		 417 aa  258  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2775  DNA-directed DNA polymerase  47.23 
 
 		 355 aa  259  1e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1096  DNA-directed DNA polymerase  44.97 
 
 		 424 aa  258  2e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1640  DNA-directed DNA polymerase  45.13 
 
 		 360 aa  258  2e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.582821 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0068  DNA polymerase IV  45.56 
 
 		 417 aa  257  4e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08990  DNA-directed DNA polymerase  42.65 
 
 		 385 aa  257  4e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1400  DNA polymerase IV  45.56 
 
 		 449 aa  256  5e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.193285  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3604  DNA polymerase IV  42.57 
 
 		 364 aa  256  5e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.85941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0144  DNA-directed DNA polymerase  41.06 
 
 		 354 aa  256  6e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1270  DNA-directed DNA polymerase  43.55 
 
 		 430 aa  256  7e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.725906  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0951  DNA polymerase IV  43.68 
 
 		 379 aa  256  7e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.126406  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0127  DNA polymerase IV  43.92 
 
 		 423 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.314932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2871  DNA polymerase IV  44.19 
 
 		 359 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0762  DNA polymerase IV  41.46 
 
 		 352 aa  254  2.0000000000000002e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.072436 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6682  DNA polymerase IV  43.15 
 
 		 435 aa  254  3e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1867  DNA-directed DNA polymerase  44.64 
 
 		 356 aa  254  3e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1559  DNA-directed DNA polymerase  41.83 
 
 		 408 aa  254  3e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.195396  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0354  DNA polymerase IV  41.29 
 
 		 351 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000360383 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1494  DNA polymerase IV  42.73 
 
 		 418 aa  253  5.000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1904  DNA-directed DNA polymerase  39.44 
 
 		 411 aa  253  5.000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5784  DNA-directed DNA polymerase  44.17 
 
 		 430 aa  252  9.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108507  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0343  DNA polymerase IV  41.29 
 
 		 351 aa  252  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.663031 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0362  DNA polymerase IV  41.01 
 
 		 351 aa  252  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.933253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0347  DNA polymerase IV  41.01 
 
 		 351 aa  252  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0380  DNA-directed DNA polymerase  45.75 
 
 		 360 aa  251  1e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.158929  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2656  DNA polymerase IV  44.51 
 
 		 378 aa  251  2e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0662  DNA-directed DNA polymerase  41.93 
 
 		 353 aa  251  2e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0190  DNA-directed DNA polymerase  38.08 
 
 		 410 aa  251  2e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2424  DNA-directed DNA polymerase  42.98 
 
 		 415 aa  250  3e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0565493 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0352  DNA polymerase IV  41.01 
 
 		 351 aa  250  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.990512 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1818  DNA polymerase IV  40.47 
 
 		 359 aa  250  3e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.432608  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0961  DNA polymerase IV  42.11 
 
 		 359 aa  250  4e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.215034  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0882  DNA-directed DNA polymerase  45.87 
 
 		 417 aa  249  6e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6078  DNA polymerase IV  43.11 
 
 		 365 aa  249  9e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02810  DNA polymerase IV  41.47 
 
 		 368 aa  249  9e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.495536  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3995  DNA polymerase IV  41.67 
 
 		 417 aa  248  1e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03139  DNA polymerase IV  43.7 
 
 		 369 aa  248  1e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3552  DNA polymerase IV  41.57 
 
 		 358 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4749  DNA polymerase IV  43.03 
 
 		 435 aa  248  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.676615  normal  0.525378 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3422  DNA polymerase IV  40.59 
 
 		 360 aa  248  2e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3092  DNA polymerase IV  45.51 
 
 		 358 aa  248  2e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0011  DNA polymerase IV, putative  39.19 
 
 		 390 aa  247  3e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4922  DNA-directed DNA polymerase  42.58 
 
 		 410 aa  247  3e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0212665 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7420  DNA polymerase IV  41.98 
 
 		 429 aa  247  3e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.108606  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3374  DNA polymerase IV  42.35 
 
 		 385 aa  247  4e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2097  DNA-directed DNA polymerase  44.82 
 
 		 373 aa  247  4e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1185  DNA-directed DNA polymerase  41.87 
 
 		 381 aa  246  4.9999999999999997e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3265  DNA polymerase IV  45 
 
 		 354 aa  246  6e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2961  DNA-directed DNA polymerase  38.62 
 
 		 356 aa  246  6.999999999999999e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000066201  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_10  DNA polymerase IV (Y-family)  40.06 
 
 		 391 aa  246  8e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1433  DNA polymerase IV  42.11 
 
 		 356 aa  245  9.999999999999999e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0276  DNA polymerase IV  41.46 
 
 		 351 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.820662 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3427  DNA polymerase IV  41.28 
 
 		 358 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3355  DNA polymerase IV  41.28 
 
 		 358 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3544  DNA polymerase IV  43.84 
 
 		 431 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0935  DNA polymerase IV  41.57 
 
 		 358 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>