More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2269 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2269  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  100 
 
 
688 aa  1383    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0189  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  60.41 
 
 
622 aa  708    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0066  DNA polymerase III, tau subunit  75.78 
 
 
577 aa  616  1e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0506  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  63.3 
 
 
538 aa  504  1e-141  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2144  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  67.25 
 
 
741 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4327  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.47 
 
 
579 aa  312  2e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.923822  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0094  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  44.15 
 
 
579 aa  308  3e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2789  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.29 
 
 
602 aa  304  4.0000000000000003e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.226663  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0365  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.12 
 
 
551 aa  302  2e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00200762  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3422  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.69 
 
 
582 aa  300  6e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.087707  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0212  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.56 
 
 
582 aa  298  2e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.783119  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0195  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.86 
 
 
579 aa  293  9e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.92139e-31 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0529  DNA-directed DNA polymerase  37.65 
 
 
696 aa  291  4e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000324921  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0692  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.96 
 
 
682 aa  289  1e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0052  DNA polymerase III subunits gamma and tau  36.53 
 
 
547 aa  289  1e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0055  DNA polymerase III subunits gamma and tau  36.53 
 
 
547 aa  289  1e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1073  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.9 
 
 
553 aa  288  2e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0374  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  42.15 
 
 
582 aa  288  2e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000945747  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6870  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  45.18 
 
 
649 aa  288  2e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.351092 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0301  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.62 
 
 
569 aa  288  2e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0288678  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1572  DNA polymerase III, tau subunit  42.65 
 
 
572 aa  286  1.0000000000000001e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.13387  hitchhiker  0.00000463974 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0912  DNA polymerase III, tau subunit  41.85 
 
 
652 aa  284  3.0000000000000004e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.850857 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0796  DNA polymerase III subunits gamma and tau  41.51 
 
 
565 aa  284  3.0000000000000004e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0481374 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0015  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.19 
 
 
589 aa  284  5.000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00819086  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0055  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.82 
 
 
582 aa  282  1e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0628794  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0769  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.56 
 
 
591 aa  281  3e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.775776  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0058  DNA-directed DNA polymerase  46.76 
 
 
625 aa  280  6e-74  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1454  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40 
 
 
751 aa  278  2e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000325473  normal  0.0490605 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2444  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  45.93 
 
 
567 aa  278  3e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.453017  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4057  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.69 
 
 
600 aa  277  4e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.495634  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1535  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.35 
 
 
599 aa  277  4e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495544  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1175  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.86 
 
 
520 aa  277  5e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0257  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  47.08 
 
 
518 aa  276  8e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1510  DNA polymerase III, tau subunit / DNA polymerase III, gamma subunit  42.06 
 
 
648 aa  276  8e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0569414  normal  0.564841 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.01 
 
 
562 aa  276  1.0000000000000001e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01580  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  44.07 
 
 
900 aa  276  1.0000000000000001e-72  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00110622 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0021  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.01 
 
 
562 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0259778  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.01 
 
 
562 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0496501  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1076  DNA polymerase III subunits gamma and tau  38.41 
 
 
685 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0258766  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1399  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.95 
 
 
716 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.01 
 
 
562 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0875141  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0245  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  48.39 
 
 
478 aa  275  3e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3235  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.89 
 
 
690 aa  275  3e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00193084  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1238  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.65 
 
 
634 aa  274  3e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0023  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.01 
 
 
562 aa  275  3e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0042  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  47.28 
 
 
540 aa  275  3e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000215305  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0033  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.61 
 
 
518 aa  275  3e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.168879  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1975  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.26 
 
 
632 aa  274  4.0000000000000004e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.106015  normal  0.868951 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0243  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  48.39 
 
 
478 aa  274  4.0000000000000004e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0062  DNA polymerase III, tau subunit  45.82 
 
 
614 aa  274  5.000000000000001e-72  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3801  DNA polymerase III subunits gamma and tau  42.5 
 
 
681 aa  273  8.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5294  DNA polymerase III subunits gamma and tau  38.46 
 
 
562 aa  273  1e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000435365  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  45.95 
 
 
664 aa  272  1e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.176808  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3587  DNA polymerase III subunits gamma and tau  42.5 
 
 
689 aa  273  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44630  DNA polymerase III subunits gamma and tau  42.5 
 
 
701 aa  273  1e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.522569  normal  0.208913 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0277  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.64 
 
 
517 aa  272  2e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.433516  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2144  DNA polymerase III subunits gamma and tau  44.56 
 
 
547 aa  272  2e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00119695  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0024  DNA polymerase III subunits gamma and tau  38.46 
 
 
562 aa  272  2e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00112319  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2361  DNA-directed DNA polymerase  45.21 
 
 
957 aa  271  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.832917  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01097  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.06 
 
 
930 aa  271  2.9999999999999997e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0856876  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0034  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.29 
 
 
602 aa  271  2.9999999999999997e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.330023  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0832  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.73 
 
 
695 aa  271  2.9999999999999997e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1826  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  45.21 
 
 
893 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.297137 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3834  DNA polymerase III subunits gamma and tau  42.22 
 
 
687 aa  271  4e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.471872 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1458  DNA polymerase III subunits gamma and tau  41.5 
 
 
723 aa  271  4e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0026  DNA polymerase III subunits gamma and tau  38.46 
 
 
562 aa  270  5e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000589622  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2219  DNA polymerase III subunits gamma and tau  45.21 
 
 
812 aa  270  5e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.373497  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20790  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.07 
 
 
588 aa  270  5e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000015496  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2647  DNA polymerase III subunits gamma and tau  41.39 
 
 
692 aa  270  5e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.377545  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2130  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  49.65 
 
 
427 aa  270  5.9999999999999995e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0748227  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0603  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.82 
 
 
735 aa  270  7e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.705665 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6252  DNA polymerase III subunits gamma and tau  44.52 
 
 
787 aa  270  8e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.554361  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1827  DNA polymerase III subunits gamma and tau  44.52 
 
 
787 aa  270  8e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.203884  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0045  DNA polymerase III subunits gamma and tau  45.21 
 
 
825 aa  270  8.999999999999999e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.787094  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1361  DNA polymerase III subunits gamma and tau  45.21 
 
 
825 aa  270  8.999999999999999e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.926406  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2373  DNA polymerase III subunits gamma and tau  45.21 
 
 
822 aa  270  8.999999999999999e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2206  DNA polymerase III subunits gamma and tau  45.21 
 
 
826 aa  270  8.999999999999999e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.236828  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1851  DNA polymerase III subunits gamma and tau  45.21 
 
 
825 aa  270  8.999999999999999e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0281713  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1448  DNA polymerase III subunits gamma and tau  48.33 
 
 
554 aa  270  8.999999999999999e-71  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0128933  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1123  DNA polymerase III subunits gamma and tau  45.21 
 
 
825 aa  270  8.999999999999999e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.496963  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.64 
 
 
562 aa  270  8.999999999999999e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0804011  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3778  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.46 
 
 
601 aa  269  1e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131326  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3695  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.46 
 
 
601 aa  269  1e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1135  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.67 
 
 
650 aa  269  1e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.239786  unclonable  0.0000000363353 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1200  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.4 
 
 
667 aa  269  1e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2016  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.76 
 
 
637 aa  269  1e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.780836  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4269  DNA polymerase III subunits gamma and tau  41.94 
 
 
691 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  38.19 
 
 
562 aa  268  2e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0519893  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0806  AAA ATPase, central region  45.89 
 
 
537 aa  268  2e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.343257  unclonable  0.000000100554 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1599  DNA polymerase III subunits gamma and tau  41.94 
 
 
692 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0852408 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0027  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.51 
 
 
589 aa  268  2e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154817 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19830  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.45 
 
 
694 aa  268  2e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2897  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.11 
 
 
914 aa  268  2e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.579528  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2365  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.98 
 
 
580 aa  268  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.153654 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0020  DNA polymerase III subunits gamma and tau  38.29 
 
 
562 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.327732  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3039  DNA polymerase III subunits gamma and tau  46.62 
 
 
678 aa  268  2.9999999999999995e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0521  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.36 
 
 
582 aa  268  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.067552  normal  0.421793 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0775  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.03 
 
 
509 aa  268  2.9999999999999995e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.275781  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2852  DNA-directed DNA polymerase  39.22 
 
 
955 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00013426  hitchhiker  0.000000946714 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1652  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.52 
 
 
397 aa  268  2.9999999999999995e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.675136  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>