194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2253 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2253  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  100 
 
 		 245 aa  478  1e-134  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0292  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  68.66 
 
 		 213 aa  271  8.000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.599912 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0342  precorrin-8X methylmutase  59.82 
 
 		 220 aa  251  6e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.470855  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0027  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  56.11 
 
 		 230 aa  218  5e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.615155  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0965  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  51.83 
 
 		 213 aa  205  4e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.519287  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2136  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  45.24 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0350382 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1435  precorrin-8X methylmutase  40.85 
 
 		 209 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.170002  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1241  precorrin-8X methylmutase  40.85 
 
 		 209 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.189427  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0308  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  39.71 
 
 		 207 aa  153  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1269  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  45.16 
 
 		 219 aa  151  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3134  precorrin-8X methylmutase  43.41 
 
 		 217 aa  150  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688258 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2999  precorrin-8X methylmutase  44.55 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.540254  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3611  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  41.26 
 
 		 216 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0033  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  43.33 
 
 		 213 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1349  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  45.41 
 
 		 222 aa  146  3e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3545  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  41.26 
 
 		 214 aa  143  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0477  precorrin-8X methylmutase  44.76 
 
 		 214 aa  143  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2706  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  49.16 
 
 		 207 aa  143  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0197172  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1269  precorrin-8X methylmutase  41.98 
 
 		 214 aa  140  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0352716  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1008  Precorrin-8X methylmutase  40 
 
 		 211 aa  140  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1285  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  40.09 
 
 		 211 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.808372  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1298  Precorrin-8X methylmutase  37.79 
 
 		 207 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456818 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2081  precorrin-8X methylmutase  38.94 
 
 		 218 aa  139  6e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1303  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  41.23 
 
 		 212 aa  137  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0697  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  36.45 
 
 		 205 aa  137  1e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1382  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  39.09 
 
 		 214 aa  137  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7175  precorrin-8X methylmutase  43.69 
 
 		 210 aa  135  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894546  normal  0.0915035 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0480  precorrin isomerase, CbiC-like  39.91 
 
 		 225 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3654  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  43.13 
 
 		 228 aa  135  8e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6020  precorrin-8X methylmutase  43.69 
 
 		 210 aa  134  9e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00161417  normal  0.19604 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2817  precorrin-8X methylmutase  42.72 
 
 		 210 aa  134  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1298  precorrin-8X methylmutase  43.72 
 
 		 211 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000022919  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3739  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  45.66 
 
 		 226 aa  133  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2777  precorrin-8X methylmutase  41.51 
 
 		 224 aa  132  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.066759 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2161  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  43.66 
 
 		 228 aa  131  7.999999999999999e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.149955 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1691  precorrin-8X methylmutase  40.74 
 
 		 225 aa  131  9e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.188396 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1720  cobalt-precorrin-8X methylmutase  38.91 
 
 		 227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2613  Precorrin-8X methylmutase  38.86 
 
 		 215 aa  129  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0070  precorrin-8X methylmutase  43.72 
 
 		 239 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.104216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3509  precorrin-8X methylmutase  43.41 
 
 		 209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.400984  normal  0.540092 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1782  Precorrin-8X methylmutase  42.31 
 
 		 208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.140584  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1250  precorrin-8X methylmutase  43.41 
 
 		 208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0567  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  41.2 
 
 		 222 aa  127  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0317  precorrin-8X methylmutase  40.98 
 
 		 224 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0575  Precorrin-8X methylmutase  43.48 
 
 		 206 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.204948  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0642  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  41.2 
 
 		 222 aa  126  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3376  precorrin-8X methylmutase  37.44 
 
 		 221 aa  125  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.218633 
 
 
-
 
NC_004310  BR1287  precorrin-8X methylmutase  42.93 
 
 		 208 aa  125  6e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1898  precorrin-8X methylmutase  41.75 
 
 		 208 aa  125  7e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.171358  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3117  precorrin-8X methylmutase  45.15 
 
 		 230 aa  124  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3178  precorrin-8X methylmutase  42.51 
 
 		 209 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.333659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0172  precorrin-8X methylmutase  44.44 
 
 		 512 aa  123  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00890226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2320  precorrin-8X methylmutase  42.03 
 
 		 209 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.415646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21130  precorrin-8X methylmutase  41.04 
 
 		 219 aa  122  5e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5593  Precorrin-8X methylmutase  41.55 
 
 		 208 aa  122  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179804  normal  0.278794 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0080  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  33.65 
 
 		 213 aa  122  6e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.52758 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1022  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  42.72 
 
 		 229 aa  122  8e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.535258  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0440  precorrin-8X methylmutase, precorrin isomerase  40.85 
 
 		 225 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.46496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0475  precorrin-8X methylmutase  40.85 
 
 		 225 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1858  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.26 
 
 		 541 aa  121  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1553  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  35.5 
 
 		 215 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.160219  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1097  precorrin-8X methylmutase  40.85 
 
 		 210 aa  119  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12101  precorrin-8X methylmutase  40.93 
 
 		 208 aa  118  7.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0138483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1520  precorrin-8X methylmutase  40.98 
 
 		 219 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0927  Precorrin-8X methylmutase  37.8 
 
 		 204 aa  117  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000290763 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3284  precorrin-8X methylmutase  42.58 
 
 		 211 aa  116  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.174863  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17660  precorrin-8X methylmutase  39.91 
 
 		 221 aa  116  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0262485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3146  precorrin-8X methylmutase  41.18 
 
 		 210 aa  116  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.757727  normal  0.930234 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1244  precorrin-8X methylmutase  40.41 
 
 		 208 aa  115  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0926514  normal  0.29626 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4876  precorrin-8X methylmutase  39.22 
 
 		 208 aa  115  6e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1712  Precorrin-8X methylmutase  43.69 
 
 		 210 aa  115  6e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.61701  hitchhiker  0.00790463 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4416  precorrin-8X methylmutase  39.22 
 
 		 208 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.416711 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2440  precorrin-8X methylmutase  45.88 
 
 		 210 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.341213  normal  0.0714057 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1888  precorrin-8X methylmutase  40.49 
 
 		 209 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1437  precorrin-8X methylmutase  43.2 
 
 		 210 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.226548  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03744  putative transmembrane protein  38.36 
 
 		 534 aa  113  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.937216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1670  precorrin-8X methylmutase  40.72 
 
 		 209 aa  113  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.793368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2399  precorrin-8X methylmutase  43.13 
 
 		 208 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.154427  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2488  precorrin-8X methylmutase  40.93 
 
 		 208 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2533  precorrin-8X methylmutase  40.93 
 
 		 208 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.466209  normal  0.41387 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2525  precorrin-8X methylmutase  40.93 
 
 		 208 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.345603  normal  0.182328 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4572  precorrin-8X methylmutase  42.51 
 
 		 208 aa  112  5e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3144  precorrin-8X methylmutase  40.41 
 
 		 212 aa  112  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2298  precorrin-8X methylmutase  41.54 
 
 		 219 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.191284  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2380  precorrin-8X methylmutase  39.61 
 
 		 209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2151  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  44.33 
 
 		 210 aa  109  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0108715  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2991  precorrin-8X methylmutase  41.67 
 
 		 208 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1434  Precorrin-8X methylmutase  42.72 
 
 		 210 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.656935  normal  0.667092 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0152  Precorrin-8X methylmutase  38.02 
 
 		 215 aa  108  6e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1287  precorrin-8X methylmutase  36.57 
 
 		 203 aa  108  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.01573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3266  Precorrin-8X methylmutase  42.16 
 
 		 215 aa  107  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0444754 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2639  precorrin isomerase  40.93 
 
 		 499 aa  106  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0523957  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2355  precorrin-8X methylmutase  38.17 
 
 		 249 aa  106  3e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000155393  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1193  precorrin-8X methylmutase  38.86 
 
 		 208 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0208289  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1573  precorrin-8X methylmutase  39.38 
 
 		 208 aa  106  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.377269  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1673  precorrin-8X methylmutase  38.86 
 
 		 208 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0355413  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5060  precorrin-8X methylmutase  32.85 
 
 		 211 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.341493 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1646  precorrin-8X methylmutase  38.86 
 
 		 208 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.996028  normal  0.344579 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1591  precorrin-8X methylmutase  38.86 
 
 		 208 aa  106  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.257981 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1852  precorrin-8X methylmutase  37.76 
 
 		 209 aa  106  4e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.334862  normal  0.809538 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>