More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2158 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2158  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 244 aa  500  1e-141  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 263 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 213 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1742  transcriptional regulator, TetR family  32.3 
 
 		 235 aa  121  8e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.666045  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3173  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2892  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 227 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0741527  n/a   
 
 
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NC_012560  Avin_00620  Transcriptional regulatory protein, TetR family  36.63 
 
 		 227 aa  112  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2500  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 234 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0446  TetR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 220 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
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NC_002977  MCA1598  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 239 aa  107  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235097  n/a   
 
 
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NC_007947  Mfla_0170  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 233 aa  107  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000323068 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0468  Transcriptional regulator TetR  29.33 
 
 		 219 aa  106  4e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1807  TetR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 218 aa  104  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237257  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1086  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 219 aa  101  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.535417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0813  AcrR/TetR family transcription regulator  31.02 
 
 		 227 aa  98.2  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1517  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 372 aa  95.5  6e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3284  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 222 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.961661 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0392  transcriptional regulator, TetR family  30.15 
 
 		 213 aa  90.9  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4065  transcriptional regulator, TetR family  26.83 
 
 		 208 aa  90.5  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2863  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1870  transcriptional regulator, TetR family  38.21 
 
 		 220 aa  74.7  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  41.11 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2681  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.387724  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2902  regulatory protein, TetR  36.8 
 
 		 253 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.271799  normal  0.100562 
 
 
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NC_013441  Gbro_0744  regulatory protein TetR  41.05 
 
 		 191 aa  64.7  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2776  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 209 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376535  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3316  transcriptional regulator, TetR family  60.78 
 
 		 249 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.655704  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3012  transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2557  TetR family transcriptional regulator  60.78 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.705718  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1330  putative DNA-binding transcriptional regulator  30.18 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.745262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6888  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 254 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 226 aa  62.4  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0794  transcriptional regulator, TetR family  33.08 
 
 		 221 aa  62  0.000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2811  putative DNA-binding transcriptional regulator  30.94 
 
 		 236 aa  61.6  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014210  Ndas_3882  transcriptional regulator, TetR family  30.21 
 
 		 190 aa  61.2  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010465  YPK_2899  putative DNA-binding transcriptional regulator  30.94 
 
 		 236 aa  61.6  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3543  Transcriptional regulator TetR  31.33 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.32802  normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_4783  transcriptional regulator, TetR family  54.72 
 
 		 201 aa  61.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.697373  normal  0.690259 
 
 
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NC_007958  RPD_1989  hypothetical protein  32.86 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00163154  normal  0.392807 
 
 
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NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3469  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1118  regulatory protein TetR  23.7 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  47.62 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011369  Rleg2_2999  transcriptional regulator, TetR family  25.86 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  24.48 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
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NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  40.62 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1190  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106163  n/a   
 
 
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NC_008254  Meso_0128  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009784  VIBHAR_05966  hypothetical protein  31.07 
 
 		 241 aa  57  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013441  Gbro_4256  regulatory protein TetR  47.83 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.671328  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0125  transcriptional regulator, TetR family  25.86 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.247519  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1341  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009620  Smed_4699  TetR family transcriptional regulator  23.7 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.310001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6563  putative transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0113679 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000229  transcriptional regulator  29.63 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5635  transcriptional regulator, TetR family  27.94 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0445849  normal  0.712508 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4301  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1731  TetR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.206322 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  22.95 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35350  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  22.95 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  25.7 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1719  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 272 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  hitchhiker  0.00027252 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2528  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 317 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0660251  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10145  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 280 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1275  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 318 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.033456  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1805  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 316 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.754817  n/a   
 
 
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NC_007434  BURPS1710b_1958  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 316 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00062632  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003766  predicted transcriptional regulator for fatty acid degradation FadQ TetR family  41.82 
 
 		 214 aa  54.7  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1784  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 316 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261379  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0708  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 244 aa  55.1  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1650  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 196 aa  54.7  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00305011  n/a   
 
 
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NC_013730  Slin_2820  transcriptional regulator, TetR family  35.42 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013530  Xcel_0416  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 228 aa  54.7  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0133  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 318 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.221572  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1033  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 318 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.781792  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  32.46 
 
 		 196 aa  54.7  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1762  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 318 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0114483  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  22.95 
 
 		 204 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  25.97 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1586  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 215 aa  53.9  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.377059  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2914  transcriptional regulator, TetR family  23.24 
 
 		 202 aa  54.3  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4675  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 273 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.104564 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3059  TetR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2917  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 218 aa  54.3  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_9154  putative transcriptional regulator, TetR family  30.1 
 
 		 226 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231214  normal  1 
 
 
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NC_008781  Pnap_3899  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 247 aa  53.9  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0449568  normal  0.0930409 
 
 
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NC_003295  RSc0538  putative transcription regulator protein  29.12 
 
 		 340 aa  53.5  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0548249  normal  0.54431 
 
 
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NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 225 aa  53.1  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
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NC_007953  Bxe_C0212  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 242 aa  53.5  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581109  normal  1 
 
 
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NC_009953  Sare_3404  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 198 aa  53.5  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.64747  normal  0.339255 
 
 
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NC_008060  Bcen_1055  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 273 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009092  Shew_3567  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 217 aa  53.1  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0246266  normal  1 
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_0030  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 196 aa  53.5  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.100703  normal  1 
 
 
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NC_009092  Shew_2052  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 212 aa  53.5  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634978  normal  0.379689 
 
 
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