More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2141 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0327  peptidase U32  53.32 
 
 
656 aa  671    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0058  U32 family peptidase  64.02 
 
 
748 aa  840    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2141  peptidase U32  100 
 
 
709 aa  1439    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0074  peptidase U32  70.13 
 
 
697 aa  947    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3248  peptidase U32  52.11 
 
 
654 aa  622  1e-177  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1030  peptidase U32  49.03 
 
 
656 aa  598  1e-169  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0024  peptidase U32  56.58 
 
 
754 aa  526  1e-148  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0664  peptidase U32  32.41 
 
 
696 aa  243  7.999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0317421  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0065  peptidase U32  41.37 
 
 
822 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0370  peptidase U32  39.28 
 
 
818 aa  231  5e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3347  U32 family peptidase  38.05 
 
 
790 aa  229  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0024  peptidase U32  37.43 
 
 
792 aa  225  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000675639  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3618  peptidase U32  36.66 
 
 
790 aa  219  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3552  peptidase U32  36.76 
 
 
792 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0040  peptidase U32  38.46 
 
 
790 aa  216  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0071  U32 family peptidase  38.89 
 
 
746 aa  214  5.999999999999999e-54  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0064  collagenase-like protease  38.35 
 
 
790 aa  207  5e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1511  peptidase family protein U32  38.85 
 
 
886 aa  190  7e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02320  collagenase-like protease  33.82 
 
 
828 aa  187  4e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.265597  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0426  peptidase U32  32.05 
 
 
767 aa  179  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1848  U32 family peptidase  35.58 
 
 
783 aa  178  2e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1010  peptidase U32  37.92 
 
 
411 aa  179  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1861  peptidase U32  40.86 
 
 
810 aa  178  3e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2136  U32 family peptidase  35.28 
 
 
783 aa  177  4e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0544  peptidase U32  39.1 
 
 
835 aa  177  4e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.814985  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1107  peptidase U32  37.08 
 
 
836 aa  176  9.999999999999999e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0104488  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1637  peptidase U32  35.65 
 
 
847 aa  176  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1712  peptidase U32  41.64 
 
 
862 aa  174  5.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000390003  normal  0.623925 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1159  hypothetical protein  40.75 
 
 
783 aa  173  9e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.904079  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0176  peptidase U32  40.07 
 
 
835 aa  173  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2391  peptidase U32  35.18 
 
 
848 aa  173  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.740262  normal  0.817298 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2268  peptidase U32  41.06 
 
 
826 aa  172  2e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2024  U32 family peptidase  35.1 
 
 
409 aa  172  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1741  U32 family peptidase  35.1 
 
 
409 aa  172  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1084  collagenase  37.17 
 
 
548 aa  172  2e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.795762  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0735  peptidase U32  36.06 
 
 
408 aa  171  5e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0327554  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2047  peptidase U32  37.15 
 
 
783 aa  170  8e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0587  peptidase U32  36 
 
 
840 aa  169  2e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.684095  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08360  collagenase-like protease  34.42 
 
 
825 aa  168  4e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.593453 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2086  peptidase U32  34.13 
 
 
839 aa  167  4e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0943  peptidase U32  38.89 
 
 
411 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1336  peptidase U32  36.36 
 
 
817 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0126233  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0738  peptidase U32  36.4 
 
 
439 aa  165  2.0000000000000002e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10034  predicted protein  39.85 
 
 
826 aa  165  3e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0411  U32 family peptidase  36.71 
 
 
406 aa  165  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.52498e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10820  collagenase-like protease  39.56 
 
 
471 aa  165  3e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1374  peptidase U32  40.23 
 
 
838 aa  164  4.0000000000000004e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.466002  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2495  peptidase U32  34.15 
 
 
413 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0699  peptidase U32  35.91 
 
 
722 aa  164  5.0000000000000005e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1474  peptidase U32  36.8 
 
 
406 aa  164  8.000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00296183  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3761  peptidase U32  39.12 
 
 
835 aa  163  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0962396  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1775  peptidase U32  32.2 
 
 
419 aa  163  1e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.768163  normal  0.436207 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2182  peptidase U32  38.85 
 
 
805 aa  162  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0246456  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2502  collagenase-like protein  40 
 
 
746 aa  162  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.503721  normal  0.268664 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2093  peptidase U32  38.4 
 
 
413 aa  161  3e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1005  peptidase, U32 family  30.23 
 
 
418 aa  162  3e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.683549  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0153  peptidase U32  35.62 
 
 
805 aa  161  3e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2286  peptidase U32  37.45 
 
 
716 aa  160  9e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2165  peptidase U32  35.74 
 
 
420 aa  160  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2008  peptidase U32  34.44 
 
 
420 aa  159  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2966  peptidase U32  36.65 
 
 
877 aa  159  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.484686  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1028  peptidase U32  35.68 
 
 
834 aa  158  3e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0229  peptidase U32  31.27 
 
 
872 aa  158  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.277324  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2232  peptidase U32  40.07 
 
 
418 aa  158  3e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.138304  normal  0.83326 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0296  peptidase U32  35 
 
 
837 aa  158  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0211  peptidase U32  40.3 
 
 
435 aa  157  5.0000000000000005e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0480978  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2714  peptidase U32  36.61 
 
 
439 aa  157  8e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2801  peptidase U32  35.79 
 
 
411 aa  156  1e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3693  peptidase U32  37.59 
 
 
404 aa  156  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00154214  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3558  peptidase U32  35.77 
 
 
430 aa  156  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000993466  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0801  U32 family peptidase  29.45 
 
 
417 aa  155  2e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0547  collagenase  35.36 
 
 
422 aa  155  2e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1685  peptidase U32  34.96 
 
 
403 aa  155  2e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0901  peptidase U32  34.12 
 
 
407 aa  155  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.451276  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2291  peptidase U32  34.56 
 
 
426 aa  155  2.9999999999999998e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0724  U32 family peptidase  28.77 
 
 
417 aa  155  4e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000627659  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0703  peptidase U32  40.61 
 
 
841 aa  154  5.9999999999999996e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2262  U32 family peptidase  33.71 
 
 
414 aa  153  8e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.734981  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3702  protease  40.54 
 
 
878 aa  153  8e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.204118  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0228  peptidase U32  35.34 
 
 
403 aa  153  8.999999999999999e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1459  peptidase U32  33.04 
 
 
723 aa  153  8.999999999999999e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1305  U32 family peptidase  28.28 
 
 
417 aa  153  1e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0849626  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1925  peptidase U32  34.2 
 
 
414 aa  152  2e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.984732  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1732  peptidase U32  36.55 
 
 
873 aa  152  2e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1622  proteinase  37.69 
 
 
823 aa  152  2e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0350786 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1293  peptidase U32  39.49 
 
 
839 aa  152  2e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.461857  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0957  collagenase-like protease  36.1 
 
 
643 aa  152  3e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0908875  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0916  peptidase U32  34.81 
 
 
403 aa  151  4e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.672629  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1649  peptidase U32  39.26 
 
 
852 aa  151  4e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1532  peptidase U32  35.71 
 
 
403 aa  151  5e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.207316  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01393  predicted peptidase  37.78 
 
 
653 aa  150  8e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01403  hypothetical protein  37.78 
 
 
653 aa  150  8e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2211  peptidase U32  37.78 
 
 
653 aa  150  9e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.722535  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0969  peptidase U32  30.83 
 
 
422 aa  150  9e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3218  peptidase U32  37.5 
 
 
757 aa  150  9e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000467027 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1337  peptidase U32  35.27 
 
 
736 aa  150  1.0000000000000001e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1614  U32 family peptidase  37.78 
 
 
667 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2224  peptidase U32  37.78 
 
 
667 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.787396 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2040  peptidase, U32 family  37.78 
 
 
667 aa  150  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0020805  hitchhiker  3.90569e-18 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1519  U32 family peptidase  37.78 
 
 
667 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>