More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2121 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2121  2-alkenal reductase  100 
 
 		 525 aa  1042    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0112  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  63.06 
 
 		 450 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.542288  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3776  PDZ/DHR/GLGF  59.07 
 
 		 483 aa  444  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0424  2-alkenal reductase  53.95 
 
 		 444 aa  434  1e-120  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.943038  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0890  2-alkenal reductase  53.05 
 
 		 480 aa  391  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.2841  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0073  2-alkenal reductase  41.11 
 
 		 459 aa  274  3e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0754695 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  40.53 
 
 		 478 aa  272  9e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  37.5 
 
 		 464 aa  264  3e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0079  2-alkenal reductase  43.03 
 
 		 474 aa  263  6.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0091  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.03 
 
 		 474 aa  262  8.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000577253  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  39.42 
 
 		 476 aa  261  2e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  40.91 
 
 		 452 aa  256  9e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  38.2 
 
 		 500 aa  253  5.000000000000001e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  36.34 
 
 		 457 aa  252  1e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0073  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.61 
 
 		 474 aa  252  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  38.38 
 
 		 480 aa  251  2e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  41.71 
 
 		 453 aa  251  2e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  36.88 
 
 		 464 aa  249  7e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  36.24 
 
 		 482 aa  249  9e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  39.91 
 
 		 476 aa  249  9e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0347  protease Do  36.3 
 
 		 459 aa  247  3e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.342826  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  35.5 
 
 		 485 aa  246  4.9999999999999997e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  36.45 
 
 		 458 aa  246  6.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  35.68 
 
 		 476 aa  246  9e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  35.37 
 
 		 466 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  45.2 
 
 		 385 aa  245  9.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  38.46 
 
 		 471 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  39.81 
 
 		 476 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  37.53 
 
 		 474 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0365  protease Do  35.62 
 
 		 459 aa  243  5e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0250  heat shock protein  40.94 
 
 		 481 aa  243  6e-63  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004514  outer membrane stress sensor protease DegQ  38.24 
 
 		 455 aa  243  7e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00186375  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  37.58 
 
 		 474 aa  243  7.999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0220  protease Do  40.51 
 
 		 481 aa  243  9e-63  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.850727  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1599  serine protease, MucD, putative  38.24 
 
 		 504 aa  242  1e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.210077  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00878  protease  37.28 
 
 		 455 aa  242  1e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  37.39 
 
 		 474 aa  241  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  37.76 
 
 		 472 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  36.87 
 
 		 476 aa  240  5.999999999999999e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  37.56 
 
 		 464 aa  239  6.999999999999999e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3598  protease Do  37.39 
 
 		 451 aa  238  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.133395  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  38.65 
 
 		 477 aa  238  2e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1169  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41 
 
 		 384 aa  238  2e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  37.7 
 
 		 473 aa  238  3e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  36.02 
 
 		 492 aa  237  4e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  37.61 
 
 		 462 aa  237  4e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  35.95 
 
 		 485 aa  236  6e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  36.32 
 
 		 482 aa  236  7e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  36.36 
 
 		 479 aa  236  8e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4861  protease Do  37.27 
 
 		 492 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.837631 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  36.02 
 
 		 477 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3784  protease Do  37.27 
 
 		 492 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  37.27 
 
 		 465 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  36.32 
 
 		 477 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  37.64 
 
 		 502 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  37.98 
 
 		 469 aa  234  3e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2462  peptidase S1C, Do  38.08 
 
 		 471 aa  233  5e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  35.71 
 
 		 481 aa  233  5e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  34.94 
 
 		 502 aa  233  6e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  34.94 
 
 		 502 aa  233  6e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  34.94 
 
 		 502 aa  233  6e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3955  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  36.42 
 
 		 481 aa  233  8.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0676  peptidase Do  37.22 
 
 		 450 aa  233  9e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30411  hitchhiker  0.00175979 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13730  HtrA serine protease  36.18 
 
 		 473 aa  232  1e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  36.38 
 
 		 479 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02108  protease signal peptide protein  38.16 
 
 		 490 aa  231  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1880  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.16 
 
 		 386 aa  231  2e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0947444  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.03 
 
 		 396 aa  231  2e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3271  peptidase Do  37.22 
 
 		 450 aa  231  2e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.137957  hitchhiker  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0690  peptidase Do  37.22 
 
 		 450 aa  231  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000515523 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0721  protease Do  37.11 
 
 		 450 aa  231  3e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000974746  hitchhiker  0.002505 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0730  protease Do  37.11 
 
 		 450 aa  230  4e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0286508  normal  0.0133644 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0700  protease Do  37.11 
 
 		 450 aa  230  4e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00468675  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3654  protease Do  37.11 
 
 		 450 aa  230  5e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000180809  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0539  serine protease, MucD  35.31 
 
 		 461 aa  230  6e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.794345  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2783  Do family protease  35.76 
 
 		 502 aa  230  6e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2845  Do family protease  35.76 
 
 		 502 aa  230  6e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  35.68 
 
 		 483 aa  229  7e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1572  peptidase S1C, Do  37.84 
 
 		 468 aa  229  7e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0853453  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2684  2-alkenal reductase  43.66 
 
 		 391 aa  229  7e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2898  peptidase  35.76 
 
 		 485 aa  229  8e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3298  peptidase S1C, Do  37.13 
 
 		 511 aa  229  9e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0267  protease Do  40.42 
 
 		 477 aa  229  1e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.326354  normal  0.464292 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3296  protease Do  35.98 
 
 		 450 aa  229  1e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0128319  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  35.45 
 
 		 483 aa  229  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0520  protease Do  39.12 
 
 		 457 aa  228  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0469168  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3942  serine protease  36.59 
 
 		 450 aa  228  2e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1137  protease  37.3 
 
 		 463 aa  228  2e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0382173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1726  serine protease, MucD  35.54 
 
 		 485 aa  228  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3073  serine protease  36.61 
 
 		 449 aa  228  2e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0102381  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0100  protease DO  36.81 
 
 		 456 aa  228  2e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000901293  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0504  peptidase S1C, Do  34.89 
 
 		 453 aa  228  2e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0524175  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0456  protease DegQ  39.12 
 
 		 457 aa  228  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000901384  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1119  protease Do  36.38 
 
 		 503 aa  228  2e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  36.79 
 
 		 474 aa  228  3e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0742  protease Do  38.57 
 
 		 451 aa  227  3e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0204105  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0986  HtrA2 peptidase  41.01 
 
 		 382 aa  227  4e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  36.04 
 
 		 475 aa  227  4e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0296  protease Do  38.06 
 
 		 456 aa  226  7e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0105337  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0916  HtrA2 peptidase  47.52 
 
 		 383 aa  225  1e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>