More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2077 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2077  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 
602 aa  1231  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0210  AhpF family protein/thioredoxin reductase  59.19 
 
 
550 aa  698  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.018  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2697  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  65.18 
 
 
579 aa  774  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.278242 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0772  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  47.02 
 
 
551 aa  556  1e-157  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1754  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  46.13 
 
 
547 aa  521  1e-146  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0325052  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3874  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.28 
 
 
548 aa  428  1e-118  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.697389  normal  0.0433305 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1278  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  39.2 
 
 
316 aa  233  1e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  41.93 
 
 
304 aa  231  3e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2112  thioredoxin reductase  43.73 
 
 
324 aa  228  3e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0567  thioredoxin reductase  37.43 
 
 
340 aa  221  2e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  40.68 
 
 
304 aa  220  5e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  2.90803e-08  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0823  thioredoxin reductase  39.94 
 
 
396 aa  220  6e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0381  thioredoxin reductase  40.18 
 
 
326 aa  219  9e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4027  thioredoxin reductase  43.08 
 
 
323 aa  218  3e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2441  thioredoxin reductase  42.57 
 
 
345 aa  218  3e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0877885  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0145  thioredoxin reductase  44 
 
 
321 aa  216  6e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2880  thioredoxin reductase  41.8 
 
 
321 aa  216  1e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.805293  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2972  thioredoxin reductase  38.58 
 
 
315 aa  216  1e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  4.88903e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1694  thioredoxin-disulfide reductase  40 
 
 
317 aa  214  3e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6803  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  40.98 
 
 
321 aa  214  4e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2043  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2879  thioredoxin reductase  40.62 
 
 
312 aa  214  4e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2772  thioredoxin reductase  39.94 
 
 
321 aa  214  5e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1013  thioredoxin reductase  39.63 
 
 
308 aa  213  6e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2453  thioredoxin reductase  40.67 
 
 
321 aa  213  7e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1576  thioredoxin reductase  39.94 
 
 
327 aa  213  8e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.608559  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0414  thioredoxin reductase  39.08 
 
 
314 aa  213  8e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0681074  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2343  thioredoxin reductase  41.69 
 
 
322 aa  212  1e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0254  thioredoxin reductase  40.44 
 
 
308 aa  212  1e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0385075  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1293  thioredoxin reductase  38.1 
 
 
320 aa  212  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.429956 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1344  thioredoxin-disulfide reductase  37.99 
 
 
320 aa  212  2e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0518  thioredoxin reductase  38.46 
 
 
306 aa  212  2e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1283  thioredoxin reductase  37.99 
 
 
320 aa  212  2e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3701  thioredoxin reductase  37.74 
 
 
318 aa  211  3e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.600246  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1148  thioredoxin reductase  38.48 
 
 
317 aa  211  4e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.604332  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1731  thioredoxin reductase  38.55 
 
 
316 aa  210  6e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3338  thioredoxin reductase  38.89 
 
 
331 aa  210  6e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1731  thioredoxin reductase  38.25 
 
 
316 aa  209  9e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3203  thioredoxin reductase  41.21 
 
 
361 aa  209  9e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121454  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3149  thioredoxin reductase  38.63 
 
 
318 aa  209  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3793  thioredoxin reductase  41.39 
 
 
325 aa  209  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119595  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5277  thioredoxin-disulfide reductase  37.38 
 
 
318 aa  209  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.450322  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1692  thioredoxin reductase 1  37.72 
 
 
314 aa  209  1e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.160177  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4836  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  36.76 
 
 
321 aa  208  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5007  thioredoxin reductase  36.76 
 
 
321 aa  208  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548386  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4851  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  36.76 
 
 
321 aa  208  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.881258  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0542  thioredoxin-disulfide reductase  37.77 
 
 
306 aa  208  3e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5262  thioredoxin reductase  36.76 
 
 
318 aa  208  3e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5319  thioredoxin-disulfide reductase  36.76 
 
 
318 aa  208  3e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5243  thioredoxin-disulfide reductase  36.76 
 
 
318 aa  208  3e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0760  thioredoxin reductase  38.51 
 
 
323 aa  207  3e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.474741  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5387  thioredoxin reductase  36.76 
 
 
318 aa  208  3e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1717  thioredoxin reductase  38.79 
 
 
320 aa  207  4e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_483  thioredoxin reductase  37.77 
 
 
306 aa  207  5e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2721  thioredoxin reductase  39.69 
 
 
324 aa  207  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.137171  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0228  thioredoxin reductase  40.18 
 
 
312 aa  207  5e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1985  thioredoxin reductase  37.69 
 
 
320 aa  207  6e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.594025  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1576  thioredoxin reductase  40.18 
 
 
317 aa  206  7e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5680  thioredoxin-disulfide reductase  37.07 
 
 
318 aa  206  8e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  37.72 
 
 
320 aa  206  9e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0294  thioredoxin reductase  37.31 
 
 
304 aa  206  9e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53290  thioredoxin reductase 2  38.84 
 
 
316 aa  206  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.868588 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0114  thioredoxin reductase  37.58 
 
 
308 aa  206  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.98339e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4951  thioredoxin reductase  36.14 
 
 
318 aa  205  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.414255  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2750  thioredoxin-disulfide reductase  38.81 
 
 
312 aa  205  2e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0256  thioredoxin reductase  39.47 
 
 
335 aa  205  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.464072 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0545  thioredoxin reductase  37.76 
 
 
323 aa  205  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.192083  hitchhiker  3.99991e-06 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2436  thioredoxin-disulfide reductase  38.81 
 
 
312 aa  205  2e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2006  thioredoxin reductase  39.27 
 
 
317 aa  205  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0375  thioredoxin-disulfide reductase  37.76 
 
 
323 aa  205  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1779  thioredoxin reductase  39.23 
 
 
308 aa  205  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1838  thioredoxin reductase  37.61 
 
 
321 aa  204  3e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4609  thioredoxin reductase  41.59 
 
 
321 aa  204  5e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0752942  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1753  thioredoxin reductase  37.2 
 
 
317 aa  204  5e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2262  thioredoxin reductase  38.3 
 
 
319 aa  204  5e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0017275  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2028  thioredoxin reductase  36.2 
 
 
316 aa  203  8e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  1.02058e-05  hitchhiker  2.62597e-05 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3139  thioredoxin-disulfide reductase  39.33 
 
 
338 aa  202  1e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0388  putative thioredoxin reductase  37.39 
 
 
340 aa  202  1e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.457738  normal  0.0960406 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0429  thioredoxin reductase  37.69 
 
 
340 aa  202  1e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.749384  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2943  thioredoxin reductase  37.8 
 
 
333 aa  202  1e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2601  thioredoxin reductase  37.91 
 
 
321 aa  202  2e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1512  thioredoxin reductase  40.67 
 
 
321 aa  202  2e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3350  thioredoxin reductase  37.69 
 
 
318 aa  201  2e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  7.09992e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4077  thioredoxin reductase  38.24 
 
 
346 aa  202  2e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.880689  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3838  thioredoxin reductase  40.43 
 
 
321 aa  202  2e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0619  thioredoxin reductase  36.47 
 
 
342 aa  202  2e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  1.25941e-05  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3225  thioredoxin reductase  36.72 
 
 
319 aa  202  2e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00279715  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4671  thioredoxin reductase 2  38.53 
 
 
316 aa  201  2e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445681  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  37.46 
 
 
310 aa  202  2e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2762  thioredoxin-disulfide reductase  35.84 
 
 
315 aa  201  3e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117857  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0834  thioredoxin reductase  38.3 
 
 
346 aa  201  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2687  thioredoxin reductase  37.76 
 
 
320 aa  201  4e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.643501  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1713  thioredoxin reductase  37.16 
 
 
317 aa  201  4e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  7.42143e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1681  thioredoxin reductase  37.54 
 
 
323 aa  201  4e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.634211  normal  0.152153 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1611  thioredoxin reductase  37.76 
 
 
320 aa  201  4e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.52855e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2598  thioredoxin-disulfide reductase  37.76 
 
 
320 aa  201  4e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000212052  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2305  thioredoxin reductase  41.18 
 
 
334 aa  201  4e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0781239 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2123  thioredoxin-disulfide reductase  37.39 
 
 
320 aa  200  5e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165856  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0789  thioredoxin-disulfide reductase  37.39 
 
 
320 aa  200  5e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.133485  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3078  thioredoxin-disulfide reductase  37.39 
 
 
320 aa  200  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2991  thioredoxin-disulfide reductase  37.39 
 
 
320 aa  200  5e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.520991  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>