More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2066 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2066  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 
838 aa  1635    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3773  heavy metal translocating P-type ATPase  51.23 
 
 
737 aa  630  1e-179  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.364819  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3947  heavy metal translocating P-type ATPase  49.62 
 
 
728 aa  556  1e-157  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3609  heavy metal translocating P-type ATPase  49.62 
 
 
728 aa  556  1e-157  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.545051  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4212  heavy metal translocating P-type ATPase  50.08 
 
 
1022 aa  550  1e-155  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1527  heavy metal translocating P-type ATPase  43.16 
 
 
783 aa  521  1e-146  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00585098  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1718  heavy metal translocating P-type ATPase  42.47 
 
 
712 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  42.31 
 
 
712 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0549  heavy metal translocating P-type ATPase  42.47 
 
 
712 aa  504  1e-141  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2204  heavy metal translocating P-type ATPase  40.21 
 
 
833 aa  500  1e-140  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.149675  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4451  heavy metal translocating P-type ATPase  46.29 
 
 
673 aa  496  1e-139  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0479  heavy metal translocating P-type ATPase  41.65 
 
 
939 aa  492  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2147  cadmium-translocating P-type ATPase  43.58 
 
 
713 aa  484  1e-135  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5352  heavy metal translocating P-type ATPase  39.81 
 
 
799 aa  481  1e-134  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448816  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2303  heavy metal translocating P-type ATPase  39.26 
 
 
984 aa  481  1e-134  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0230591  hitchhiker  0.00032078 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3390  heavy metal translocating P-type ATPase  39.26 
 
 
984 aa  481  1e-134  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0773629 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1815  heavy metal translocating P-type ATPase  45.44 
 
 
800 aa  482  1e-134  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.451181 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1257  cation transporter E1-E2 family ATPase  41.47 
 
 
709 aa  469  9.999999999999999e-131  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1690  heavy metal translocating P-type ATPase  40.38 
 
 
767 aa  467  9.999999999999999e-131  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2390  heavy metal translocating P-type ATPase  44.74 
 
 
800 aa  466  9.999999999999999e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0451824  normal  0.128679 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1643  heavy metal translocating P-type ATPase  44.96 
 
 
800 aa  467  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.960315  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5284  heavy metal translocating P-type ATPase  44.96 
 
 
800 aa  467  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.225774  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2103  heavy metal translocating P-type ATPase  44.74 
 
 
800 aa  466  9.999999999999999e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5279  cadmium-translocating P-type ATPase  45.13 
 
 
752 aa  463  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5371  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  43.54 
 
 
769 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1548  heavy metal translocating P-type ATPase  44.26 
 
 
707 aa  456  1e-127  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2631  ATPase, E1-E2 type:heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  43.67 
 
 
739 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.873232 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1125  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  44.44 
 
 
751 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.228678  normal  0.104561 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2086  cadmium-transporting ATPase  42.24 
 
 
735 aa  455  1.0000000000000001e-126  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16660  putative metal-transporting P-type ATPase  45.79 
 
 
742 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5139  heavy metal translocating P-type ATPase  45.12 
 
 
750 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.921896  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2698  heavy metal translocating P-type ATPase  44.57 
 
 
734 aa  451  1e-125  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.810739 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5012  heavy metal translocating P-type ATPase  45.12 
 
 
750 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.530784  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5192  heavy metal translocating P-type ATPase  45.38 
 
 
750 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4225  heavy metal translocating P-type ATPase  46.46 
 
 
734 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2810  heavy metal translocating P-type ATPase  43.37 
 
 
800 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3462  heavy metal translocating P-type ATPase  38.2 
 
 
801 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0326  heavy metal translocating P-type ATPase  44.8 
 
 
750 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.451186  normal  0.576346 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3683  heavy metal translocating P-type ATPase  44.41 
 
 
791 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00270096  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1465  heavy metal translocating P-type ATPase  40.34 
 
 
825 aa  444  1e-123  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.338501  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2550  heavy metal translocating P-type ATPase  43 
 
 
748 aa  444  1e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1448  cadmium-translocating P-type ATPase  44.78 
 
 
748 aa  446  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1677  heavy metal translocating P-type ATPase  41.46 
 
 
726 aa  443  1e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4837  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  44.89 
 
 
752 aa  442  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2148  heavy metal translocating P-type ATPase  39.33 
 
 
972 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.235605  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0026  heavy metal translocating P-type ATPase  44.13 
 
 
701 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.260901  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1335  heavy metal translocating P-type ATPase  46.52 
 
 
753 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.333183  normal  0.209936 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3304  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  45.53 
 
 
866 aa  436  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5947  Pb(II) resistance ATPase PbrA  46.09 
 
 
799 aa  437  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.341676 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1627  heavy metal translocating P-type ATPase  45.28 
 
 
718 aa  439  1e-121  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4019  cadmium-translocating P-type ATPase  45.29 
 
 
832 aa  433  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3946  cadmium-translocating P-type ATPase  45.3 
 
 
828 aa  433  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3290  cadmium-translocating P-type ATPase  44.8 
 
 
830 aa  434  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0854  heavy metal translocating P-type ATPase  44.28 
 
 
812 aa  436  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4594  ZntA, P-type ATPase involved in Zn(II), Cd(II), Tl(I) and Pb(II) resistance  43.46 
 
 
794 aa  432  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0280589  hitchhiker  0.0082213 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0124  heavy metal translocating P-type ATPase  45.95 
 
 
856 aa  433  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2242  heavy metal translocating P-type ATPase  43.29 
 
 
750 aa  433  1e-120  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00781921 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0114  heavy metal translocating P-type ATPase  45.95 
 
 
704 aa  433  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1563  cadmium-translocating P-type ATPase  45.29 
 
 
832 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3333  cadmium-translocating P-type ATPase  45.29 
 
 
834 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3038  cadmium-translocating P-type ATPase  45.29 
 
 
834 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2450  heavy metal translocating P-type ATPase  44.57 
 
 
738 aa  429  1e-119  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0805426  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2976  cadmium-translocating P-type ATPase  45.29 
 
 
713 aa  432  1e-119  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0150  cadmium-translocating P-type ATPase  45.12 
 
 
713 aa  431  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.478149  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4439  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  43.62 
 
 
709 aa  430  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1242  heavy metal translocating P-type ATPase  45.47 
 
 
799 aa  430  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0138  heavy metal translocating P-type ATPase  45.1 
 
 
848 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3233  heavy metal translocating P-type ATPase  40.74 
 
 
785 aa  429  1e-118  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.27574  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0123  heavy metal translocating P-type ATPase  44.77 
 
 
862 aa  428  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1049  hypothetical protein  40.47 
 
 
713 aa  424  1e-117  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2931  heavy metal translocating P-type ATPase  45.7 
 
 
846 aa  425  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0124  heavy metal translocating P-type ATPase  45.7 
 
 
846 aa  425  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.772511  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2084  heavy metal translocating P-type ATPase  40.5 
 
 
812 aa  424  1e-117  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.155382 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18520  heavy metal translocating P-type ATPase  44.48 
 
 
712 aa  424  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3562  heavy metal translocating P-type ATPase  44.43 
 
 
762 aa  424  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.482767  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0832  heavy metal translocating P-type ATPase  45.45 
 
 
783 aa  421  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4001  heavy metal translocating P-type ATPase  43.76 
 
 
745 aa  421  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.703594  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3134  heavy metal translocating P-type ATPase  43.85 
 
 
712 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2581  heavy metal translocating P-type ATPase  42.93 
 
 
793 aa  419  9.999999999999999e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1151  heavy metal translocating P-type ATPase  42.65 
 
 
904 aa  413  1e-114  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0071597  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1815  heavy metal translocating P-type ATPase  46.6 
 
 
629 aa  413  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.115559  normal  0.735799 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3564  heavy metal translocating P-type ATPase  44.26 
 
 
785 aa  412  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0209  heavy metal translocating P-type ATPase  41.11 
 
 
635 aa  412  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.454108  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2370  hypothetical protein  41.03 
 
 
711 aa  411  1e-113  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5561  P type cation (metal) transporter ATPase component  43.32 
 
 
757 aa  408  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.85793  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0922  heavy metal translocating P-type ATPase  40.52 
 
 
868 aa  407  1.0000000000000001e-112  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3208  heavy metal translocating P-type ATPase  44.56 
 
 
720 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2257  ATPase, E1-E2 type:heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  42.06 
 
 
743 aa  403  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3972  ATPase, E1-E2 type:heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  43.69 
 
 
783 aa  404  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189862  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0121  heavy metal translocating P-type ATPase  37.32 
 
 
616 aa  403  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000385765  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  44.37 
 
 
711 aa  402  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1347  heavy metal translocating P-type ATPase  41.12 
 
 
738 aa  400  9.999999999999999e-111  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.174649 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2752  heavy metal translocating P-type ATPase  45.98 
 
 
722 aa  402  9.999999999999999e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7421  lead, cadmium, zinc and mercury-transporting ATPase  43.69 
 
 
764 aa  400  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.396456 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2849  heavy metal translocating P-type ATPase  42.5 
 
 
734 aa  401  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3679  heavy metal translocating P-type ATPase  42.77 
 
 
709 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.170843  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2067  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  39.71 
 
 
773 aa  401  9.999999999999999e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3467  heavy metal translocating P-type ATPase  43.96 
 
 
634 aa  401  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0212  heavy metal translocating P-type ATPase  40.38 
 
 
758 aa  401  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0921  heavy metal translocating P-type ATPase  42.63 
 
 
844 aa  397  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>