40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2041 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2041  protein of unknown function DUF116  100 
 
 
354 aa  712    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0031  hypothetical protein  76.14 
 
 
307 aa  401  1e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2842  protein of unknown function DUF116  59.69 
 
 
268 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.833781  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0017  protein of unknown function DUF116  58.48 
 
 
298 aa  301  1e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0013  protein of unknown function DUF116  55.3 
 
 
291 aa  285  5.999999999999999e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.877315  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0015  hypothetical protein  64.77 
 
 
193 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0149  hypothetical protein  47.15 
 
 
267 aa  238  1e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.691923  normal  0.569731 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0512  hypothetical protein  45.08 
 
 
258 aa  237  2e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3218  protein of unknown function DUF116  42.29 
 
 
259 aa  231  2e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0131  hypothetical protein  44.35 
 
 
251 aa  224  2e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0636  protein of unknown function DUF116  46.18 
 
 
259 aa  224  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.62091  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0820  hypothetical protein  42.21 
 
 
256 aa  222  8e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0650  protein of unknown function DUF116  44.58 
 
 
256 aa  220  3e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.03585e-24 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3340  hypothetical protein  43.87 
 
 
251 aa  212  7.999999999999999e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0899  hypothetical protein  45.78 
 
 
269 aa  206  5e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.613511  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1706  hypothetical protein  41.8 
 
 
255 aa  206  7e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1754  hypothetical protein  38.31 
 
 
250 aa  199  7.999999999999999e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1335  protein of unknown function DUF116  42.97 
 
 
269 aa  196  7e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0220692  normal  0.691762 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0243  hypothetical protein  38.8 
 
 
275 aa  191  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2312  protein of unknown function DUF116  48.21 
 
 
262 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.568933  hitchhiker  0.00168334 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1230  hypothetical protein  39.09 
 
 
250 aa  168  1e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00155832  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1530  protein of unknown function DUF116  40.12 
 
 
251 aa  150  4e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.17942  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0569  hypothetical protein  36.27 
 
 
251 aa  149  7e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000609757  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0016  hypothetical protein  69.88 
 
 
95 aa  122  8e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1841  hypothetical protein  28.14 
 
 
237 aa  72.4  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.242761  normal  0.999986 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0977  hypothetical protein  26 
 
 
245 aa  69.7  0.00000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.310915  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0624  hypothetical protein  27.32 
 
 
230 aa  69.3  0.00000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.381935  normal  0.220202 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1695  hypothetical protein  27.17 
 
 
234 aa  67.8  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1600  hypothetical protein  29.19 
 
 
211 aa  65.1  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0788  hypothetical protein  30.49 
 
 
214 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2438  hypothetical protein  24.64 
 
 
211 aa  64.7  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1162  hypothetical protein  29.8 
 
 
214 aa  64.3  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2439  hypothetical protein  29.37 
 
 
208 aa  63.5  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1601  hypothetical protein  28.66 
 
 
206 aa  63.5  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1513  hypothetical protein  33.33 
 
 
214 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0687908  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1167  hypothetical protein  31.85 
 
 
214 aa  59.7  0.00000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0126  hypothetical protein  28.32 
 
 
177 aa  59.7  0.00000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2542  protein of unknown function DUF116  21.71 
 
 
232 aa  57  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1003  hypothetical protein  31.78 
 
 
223 aa  55.5  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2915  protein of unknown function DUF116  29.91 
 
 
634 aa  47  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>