More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2039 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2039  peptide deformylase  100 
 
 		 184 aa  375  1e-103  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0029  peptide deformylase  80.24 
 
 		 171 aa  253  9e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0013  peptide deformylase  75.6 
 
 		 169 aa  232  3e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0015  peptide deformylase  56.89 
 
 		 167 aa  203  1e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2840  peptide deformylase  59.64 
 
 		 170 aa  192  3e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0011  peptide deformylase  54.49 
 
 		 172 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.196831  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0043  peptide deformylase  49.7 
 
 		 167 aa  160  7e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0021  peptide deformylase  51.57 
 
 		 167 aa  157  8e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0514  peptide deformylase  49.04 
 
 		 172 aa  155  4e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.312606  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3338  peptide deformylase  47.56 
 
 		 167 aa  154  7e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0818  peptide deformylase  45.4 
 
 		 171 aa  152  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0187  peptide deformylase  48.48 
 
 		 167 aa  152  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000698863 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0014  peptide deformylase  45.71 
 
 		 177 aa  150  8.999999999999999e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0648  peptide deformylase  48.47 
 
 		 172 aa  150  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.69456e-25 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0020  peptide deformylase  51.88 
 
 		 167 aa  149  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.133709 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0030  peptide deformylase  47.85 
 
 		 184 aa  149  2e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00022  peptide deformylase  47.62 
 
 		 169 aa  149  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0245  polypeptide deformylase  46.39 
 
 		 171 aa  149  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0078  peptide deformylase  47.27 
 
 		 167 aa  149  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.97939 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0019  polypeptide deformylase  51.88 
 
 		 167 aa  149  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2274  peptide deformylase  49.69 
 
 		 216 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0634  peptide deformylase  47.85 
 
 		 172 aa  148  4e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00220243  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0042  peptide deformylase  50.6 
 
 		 176 aa  148  4e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2352  polypeptide deformylase  49.69 
 
 		 179 aa  148  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2806  peptide deformylase  49.69 
 
 		 167 aa  147  6e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0142  peptide deformylase  49.69 
 
 		 167 aa  147  6e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.394236  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0159  polypeptide deformylase  49.69 
 
 		 179 aa  147  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.407364  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0150  polypeptide deformylase  49.69 
 
 		 179 aa  147  7e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0038  peptide deformylase  47.85 
 
 		 184 aa  147  7e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0095  peptide deformylase  49.38 
 
 		 167 aa  147  8e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  47.31 
 
 		 168 aa  147  8e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0346  peptide deformylase  49.69 
 
 		 167 aa  147  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  45.73 
 
 		 187 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  45.73 
 
 		 187 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0177  polypeptide deformylase  47.59 
 
 		 168 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  48.24 
 
 		 171 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0394  peptide deformylase  44.85 
 
 		 191 aa  145  3e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  46.71 
 
 		 168 aa  144  5e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  46.71 
 
 		 168 aa  144  5e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  46.71 
 
 		 168 aa  144  5e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0021  peptide deformylase  45.45 
 
 		 172 aa  144  5e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.243681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0625  peptide deformylase  46.51 
 
 		 175 aa  144  6e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276668  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0128  peptide deformylase  49.08 
 
 		 179 aa  144  6e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3408  peptide deformylase  48.48 
 
 		 168 aa  144  7.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.709814  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0019  peptide deformylase  46.99 
 
 		 168 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2513  peptide deformylase  47.85 
 
 		 167 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.449924  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3127  peptide deformylase  47.85 
 
 		 167 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0886547  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0442  peptide deformylase  46.47 
 
 		 174 aa  144  9e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.33127  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0129  polypeptide deformylase  45.73 
 
 		 182 aa  143  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6478  peptide deformylase  47.85 
 
 		 167 aa  143  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.755345 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0762  peptide deformylase  43.78 
 
 		 185 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100795  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4416  peptide deformylase  47.2 
 
 		 167 aa  143  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.571323 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3065  peptide deformylase  47.24 
 
 		 167 aa  143  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0762  peptide deformylase  43.78 
 
 		 185 aa  143  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.458132  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3143  peptide deformylase  47.85 
 
 		 167 aa  143  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.570267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  46.15 
 
 		 177 aa  142  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  43.29 
 
 		 175 aa  142  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  46.11 
 
 		 168 aa  142  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  48.78 
 
 		 169 aa  142  2e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0075  peptide deformylase  49.67 
 
 		 169 aa  143  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0725  peptide deformylase  45.45 
 
 		 185 aa  142  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3216  peptide deformylase  49.08 
 
 		 166 aa  142  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0170058  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3182  peptide deformylase  47.24 
 
 		 167 aa  142  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.98572  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3679  peptide deformylase  47.27 
 
 		 171 aa  142  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0023  peptide deformylase  43.79 
 
 		 169 aa  142  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0041  peptide deformylase  42.17 
 
 		 170 aa  142  3e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0035  peptide deformylase  47.2 
 
 		 167 aa  142  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3124  peptide deformylase  47.24 
 
 		 181 aa  142  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187097 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3356  peptide deformylase  47.27 
 
 		 171 aa  141  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.253244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0768  peptide deformylase  44.24 
 
 		 185 aa  141  4e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0336972  normal  0.920717 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  45.78 
 
 		 168 aa  142  4e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0031  peptide deformylase  46.11 
 
 		 170 aa  141  6e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000164435 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0031  peptide deformylase  46.11 
 
 		 170 aa  141  6e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000922598 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0027  peptide deformylase  46.11 
 
 		 170 aa  141  6e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0032  peptide deformylase  46.11 
 
 		 170 aa  141  6e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0309  peptide deformylase  46.58 
 
 		 167 aa  140  7e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3565  peptide deformylase  48.77 
 
 		 168 aa  141  7e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2473  peptide deformylase  44.85 
 
 		 169 aa  140  8e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0043  peptide deformylase  45.12 
 
 		 167 aa  140  8e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.598782  normal  0.134681 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0356  peptide deformylase  44.05 
 
 		 169 aa  140  9e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25208  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3773  peptide deformylase  46.01 
 
 		 169 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3603  peptide deformylase  46.01 
 
 		 169 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.53295 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3710  peptide deformylase  46.01 
 
 		 169 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.399963  normal  0.124168 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0673  peptide deformylase  46.55 
 
 		 175 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.478073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1778  peptide deformylase  45.12 
 
 		 171 aa  140  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.818545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3675  peptide deformylase  46.01 
 
 		 169 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3602  peptide deformylase  46.01 
 
 		 169 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0167703  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  45.51 
 
 		 168 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2843  polypeptide deformylase  43.65 
 
 		 178 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3882  peptide deformylase  44.24 
 
 		 170 aa  139  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000140056  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1918  peptide deformylase  45.88 
 
 		 171 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.101143 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3718  peptide deformylase  44.91 
 
 		 169 aa  139  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.042334  decreased coverage  0.00215529 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1636  peptide deformylase  45.88 
 
 		 171 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5113  peptide deformylase  45.56 
 
 		 173 aa  139  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0220791  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0394  peptide deformylase  43.27 
 
 		 177 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0029  peptide deformylase  45.51 
 
 		 168 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.948652  hitchhiker  0.00406786 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0027  peptide deformylase  45.51 
 
 		 168 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0851581 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0615  peptide deformylase  44.24 
 
 		 170 aa  139  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00752277  normal  0.0138093 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0035  peptide deformylase  45.51 
 
 		 168 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000196537 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0316  peptide deformylase  44.24 
 
 		 170 aa  139  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>