More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2036 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2036  Methyltransferase type 11  100 
 
 
268 aa  547  1e-155  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0026  methyltransferase type 11  65.59 
 
 
262 aa  328  5.0000000000000004e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0009  hypothetical protein  50.63 
 
 
246 aa  239  5e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0010  Methyltransferase type 11  46.89 
 
 
248 aa  206  2e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3111  Methyltransferase type 11  43.59 
 
 
241 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1525  methyltransferase type 11  32.85 
 
 
273 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.308393  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0355  methyltransferase type 11  40.38 
 
 
299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.970356 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1133  methyltransferase type 11  34.17 
 
 
246 aa  115  6e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4381  methyltransferase type 11  35.37 
 
 
221 aa  97.4  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0720  methyltransferase type 11  36.04 
 
 
225 aa  89.7  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  40.59 
 
 
225 aa  88.6  9e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  34.19 
 
 
243 aa  84.3  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  35.64 
 
 
225 aa  84.3  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0759  methyltransferase, putative  40 
 
 
216 aa  82.4  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2052  Methyltransferase type 11  40 
 
 
216 aa  82  0.000000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.782296  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0626  methyltransferase type 11  38.62 
 
 
224 aa  80.9  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00710227 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0905  Methyltransferase type 11  39.29 
 
 
216 aa  81.3  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.445237  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0189  Methyltransferase type 11  37.86 
 
 
213 aa  78.2  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.14372  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  31.3 
 
 
265 aa  77.8  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  33.81 
 
 
238 aa  73.2  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  30 
 
 
240 aa  73.2  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1880  Methyltransferase type 11  39.81 
 
 
240 aa  72.8  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2422  hypothetical protein  40.32 
 
 
194 aa  71.2  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.27 
 
 
230 aa  70.1  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1551  Methyltransferase type 11  35.08 
 
 
212 aa  69.3  0.00000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.669083  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0864  methyltransferase type 11  26.55 
 
 
235 aa  68.9  0.00000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.81939  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1039  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.19 
 
 
241 aa  68.6  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.6 
 
 
241 aa  67.8  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1528  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.6 
 
 
241 aa  67.8  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1633  Methyltransferase type 11  48 
 
 
264 aa  67.4  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0213004 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0109  methyltransferase type 11  34.34 
 
 
236 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.89 
 
 
237 aa  66.2  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0391  Methyltransferase type 11  40.54 
 
 
207 aa  65.5  0.0000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0437563  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1618  Methyltransferase type 11  35.07 
 
 
299 aa  64.7  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  43.14 
 
 
270 aa  65.5  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5792  Methyltransferase type 11  40.59 
 
 
239 aa  64.3  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1305  Methyltransferase type 11  37.27 
 
 
235 aa  64.7  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  40 
 
 
258 aa  64.3  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2905  Methyltransferase type 11  35.48 
 
 
234 aa  63.9  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1190  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.82 
 
 
241 aa  63.9  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  39.39 
 
 
250 aa  63.9  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2831  Methyltransferase type 11  36 
 
 
235 aa  63.2  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2460  methyltransferase type 11  37.37 
 
 
260 aa  63.5  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.930517  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1676  putative methyltransferase, S-adenosyl-L-methionine (SAM)-MTase protein  38.61 
 
 
268 aa  63.2  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.921474  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3665  Methyltransferase type 11  32.16 
 
 
251 aa  62.8  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2207  Methyltransferase type 11  31.66 
 
 
219 aa  62.8  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1274  Methyltransferase type 11  38.53 
 
 
206 aa  62.8  0.000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.572437 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3724  methyltransferase type 11  40 
 
 
240 aa  62.4  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0166  DNA topoisomerase VI subunit A-like protein  39.77 
 
 
257 aa  62.4  0.000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1526  methyltransferase type 11  28.76 
 
 
207 aa  62.4  0.000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.164104  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0551  Methyltransferase type 11  34.68 
 
 
255 aa  61.2  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0245261  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  41.94 
 
 
257 aa  62  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2889  methyltransferase type 11  38.38 
 
 
273 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000212071 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  41.49 
 
 
260 aa  60.8  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0946  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.96 
 
 
232 aa  61.2  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  39.78 
 
 
236 aa  61.2  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4779  Methyltransferase type 11  40.21 
 
 
264 aa  60.1  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766265 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  38.24 
 
 
296 aa  60.5  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0008  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  39.62 
 
 
199 aa  59.7  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.257422  normal  0.214675 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3206  Methyltransferase type 11  38.18 
 
 
234 aa  60.1  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.457665  normal  0.153588 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2189  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  37.61 
 
 
229 aa  60.1  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1430  Methyltransferase type 11  39.09 
 
 
205 aa  60.1  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.406205  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1566  Methyltransferase type 11  29.82 
 
 
226 aa  59.7  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4690  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  39.62 
 
 
206 aa  60.1  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.179715 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  40.86 
 
 
252 aa  59.7  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3983  methyltransferase type 11  40.2 
 
 
293 aa  59.3  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.307607  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1543  methyltransferase type 11  36.51 
 
 
259 aa  59.3  0.00000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  33.33 
 
 
268 aa  59.3  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  33.82 
 
 
276 aa  58.9  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.99 
 
 
250 aa  58.5  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0064  Methyltransferase type 11  37.38 
 
 
226 aa  58.5  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1592  methyltransferase type 11  32.63 
 
 
225 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.367784  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2685  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  38.89 
 
 
229 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5124  methyltransferase type 11  33.58 
 
 
241 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1936  methyltransferase type 11  29.87 
 
 
213 aa  58.5  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0227883  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1272  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37.07 
 
 
237 aa  57.4  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3346  Methyltransferase type 11  38.94 
 
 
207 aa  57.4  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.74 
 
 
238 aa  57.8  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.25 
 
 
233 aa  57.8  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3265  methyltransferase type 11  33.58 
 
 
241 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1846  methyltransferase type 11  28.83 
 
 
195 aa  57.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.441849  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1847  methyltransferase type 11  27.08 
 
 
195 aa  57.4  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.512652  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1652  Methyltransferase type 11  41.24 
 
 
262 aa  57.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1193  Methyltransferase type 11  30.33 
 
 
215 aa  57.4  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0170367  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4620  methyltransferase type 11  27.05 
 
 
248 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225989  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2758  Methyltransferase type 11  30 
 
 
263 aa  57  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000336599  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2723  Methyltransferase type 11  39.81 
 
 
200 aa  57.4  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87708  predicted protein  32.64 
 
 
267 aa  57  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2319  generic methyltransferase  35.4 
 
 
210 aa  57  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.897419  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4275  Methyltransferase type 11  30.93 
 
 
203 aa  57  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.18004 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2471  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  35.65 
 
 
253 aa  57.4  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0910  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.71 
 
 
247 aa  57  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  33.57 
 
 
309 aa  57  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3913  methyltransferase type 11  34.65 
 
 
232 aa  57  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119732  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0059  Methyltransferase type 11  33.13 
 
 
219 aa  57  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.624064  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  38.18 
 
 
233 aa  57  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  0.0000156795 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4848  Methyltransferase type 11  31.15 
 
 
241 aa  57  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2928  SAM-dependent methyltransferase  39.6 
 
 
218 aa  56.6  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000530736  hitchhiker  0.00484041 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  36 
 
 
255 aa  56.6  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1576  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 
229 aa  56.6  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0819441  unclonable  0.000000165496 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>