More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2028 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2028  NLP/P60 protein  100 
 
 		 233 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0199  NLP/P60 protein  59.76 
 
 		 191 aa  192  3e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0021  NLP/P60 protein  53.72 
 
 		 165 aa  143  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.386292  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2195  NLP/P60 protein  44.51 
 
 		 168 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1768  NLP/P60 protein  41.76 
 
 		 325 aa  129  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0124  NLP/P60 family protein  52.07 
 
 		 159 aa  118  6e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  41.48 
 
 		 173 aa  116  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1706  lipoprotein, putative  37.71 
 
 		 181 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3683  NLP/P60  37.93 
 
 		 181 aa  112  6e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2667  peptidace C40 NLP/P60  45.52 
 
 		 187 aa  112  6e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.411217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1638  NLP/P60  36.31 
 
 		 178 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.52996  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2100  NLP/P60  47.01 
 
 		 201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.995227  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2830  NLP/P60 protein  38.82 
 
 		 220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.704353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1228  NLP/P60 protein  38.41 
 
 		 177 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771322  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2166  NLP/P60 protein  45.59 
 
 		 194 aa  109  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.343346  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48790  putative lipoprotein  43.07 
 
 		 177 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.006644  hitchhiker  0.0000000144437 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4179  putative lipoprotein  44.19 
 
 		 197 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000450162  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1657  NLP/P60 protein  42.41 
 
 		 154 aa  108  6e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.983654  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1664  NLP/P60 protein  41.3 
 
 		 192 aa  107  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  39.33 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4048  NLP/P60 protein  37.01 
 
 		 177 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2091  NLP/P60 protein  41.48 
 
 		 192 aa  107  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.315099  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1787  NLP/P60 protein  40.41 
 
 		 202 aa  105  5e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2519  cell wall-associated hydrolase-like protein  42.18 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1670  NLP/P60 protein  38.03 
 
 		 177 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1628  NLP/P60 protein  44.38 
 
 		 155 aa  103  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3968  NLP/P60 protein  40.77 
 
 		 211 aa  103  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12193  normal  0.0821241 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1268  NLP/P60 protein  38.03 
 
 		 177 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.200264 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  41.13 
 
 		 183 aa  102  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  36.17 
 
 		 269 aa  102  7e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  41.18 
 
 		 307 aa  102  7e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  37.32 
 
 		 269 aa  102  8e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  36.54 
 
 		 234 aa  101  9e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1747  NLP/P60 protein  40.48 
 
 		 174 aa  101  9e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  39.19 
 
 		 218 aa  101  9e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  39.19 
 
 		 218 aa  101  9e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  39.19 
 
 		 218 aa  101  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  39.19 
 
 		 218 aa  101  9e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0919  NLP/P60 protein  38.71 
 
 		 382 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0475791  normal  0.21921 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  39.19 
 
 		 234 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  39.19 
 
 		 234 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2365  NLP/P60:sporulation-related protein  33.54 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0018  NLP/P60 protein  41.48 
 
 		 188 aa  101  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2393  putative transmembrane lipoprotein  38.04 
 
 		 404 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.951834  normal  0.103299 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  42.5 
 
 		 224 aa  101  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48800  hypothetical protein  42.34 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.040428  hitchhiker  0.0000000044472 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  39.19 
 
 		 234 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33180  NLP/P60 family lipoprotein  35.75 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.38174  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1890  NLP/P60 protein  46.34 
 
 		 363 aa  99.8  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00780805  hitchhiker  0.0000000811276 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6213  NLP/P60  46.34 
 
 		 363 aa  99.8  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935456  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1804  NLP/P60 protein  45.97 
 
 		 354 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1866  NLP/P60 protein  46.34 
 
 		 363 aa  99.8  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1397  NLP/P60 family lipoprotein  44.35 
 
 		 407 aa  99.8  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.929375  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2408  NLP/P60 family lipoprotein  44.35 
 
 		 407 aa  99.4  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.166866  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1887  NLP/P60 family lipoprotein  44.35 
 
 		 407 aa  99.8  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.850579  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0009  NLP/P60 family lipoprotein  44.35 
 
 		 407 aa  99.8  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30529  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2244  NlpC/P60 family lipoprotein  44.35 
 
 		 404 aa  99.4  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2283  NlpC/P60 family lipoprotein  44.35 
 
 		 404 aa  99.4  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1160  NLP/P60 family lipoprotein  44.35 
 
 		 407 aa  99.8  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.812731  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2466  NLP/P60 protein  38.65 
 
 		 162 aa  99.4  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.291366  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  39.71 
 
 		 223 aa  99  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  39.71 
 
 		 223 aa  99  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  39.71 
 
 		 223 aa  99  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1407  NLP/P60 protein  44.72 
 
 		 369 aa  99.4  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.374528 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  36.36 
 
 		 424 aa  99  6e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2186  NLP/P60 family lipoprotein  43.9 
 
 		 407 aa  99  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  40.48 
 
 		 232 aa  99  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  37.96 
 
 		 177 aa  99  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4180  hypothetical protein  42.42 
 
 		 193 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000520752  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  37.68 
 
 		 198 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1776  NLP/P60 protein  45.16 
 
 		 353 aa  98.6  8e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2291  NLP/P60 protein  41.04 
 
 		 242 aa  97.8  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2277  NLP/P60 family lipoprotein  39.83 
 
 		 267 aa  98.2  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2887  NLP/P60 protein  42.64 
 
 		 179 aa  97.8  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.171139  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1705  NLP/P60 family protein  34.01 
 
 		 242 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01907  lipoprotein  43.61 
 
 		 133 aa  97.8  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.324405  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1999  NLP/P60  40.58 
 
 		 226 aa  97.8  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.762084  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5167  NLP/P60 family lipoprotein  44.72 
 
 		 364 aa  97.8  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  39.23 
 
 		 224 aa  98.2  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  38.89 
 
 		 150 aa  97.8  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1794  NLP/P60 protein  44.83 
 
 		 418 aa  97.8  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435053  hitchhiker  0.00883906 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1250  NLP/P60 protein  37.59 
 
 		 248 aa  97.8  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000552171  normal  0.790948 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  39.68 
 
 		 223 aa  97.1  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1314  lipoprotein transmembrane  33.15 
 
 		 258 aa  97.4  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3684  NLP/P60  35.14 
 
 		 242 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49515  hitchhiker  0.00130241 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1659  hypothetical protein  35.47 
 
 		 209 aa  97.4  2e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.255203  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  35.68 
 
 		 235 aa  97.1  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  36.72 
 
 		 205 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  40.48 
 
 		 221 aa  97.4  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  39.68 
 
 		 223 aa  97.1  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  40.48 
 
 		 221 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  41.98 
 
 		 265 aa  97.4  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  40 
 
 		 150 aa  96.7  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1379  NLP/P60 protein  40.48 
 
 		 223 aa  96.7  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0123318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2772  NLP/P60 protein  38.04 
 
 		 157 aa  96.7  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1606  NLP/P60 protein  41.09 
 
 		 209 aa  96.7  3e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1732  NlpC/P60 family lipoprotein  36.63 
 
 		 154 aa  96.3  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2161  NLP/P60 protein  37.13 
 
 		 154 aa  96.3  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.854022 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1838  NLP/P60 protein  36.63 
 
 		 154 aa  96.3  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1972  NLP/P60  40.62 
 
 		 212 aa  95.9  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.107958  normal  0.172208 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>