More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2016 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2016  flagellar biosynthetic protein FliR  100 
 
 
264 aa  509  1e-143  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0154  flagellar biosynthetic protein FliR  72.69 
 
 
263 aa  360  1e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.502944 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0378  flagellar biosynthetic protein FliR  62.45 
 
 
261 aa  324  1e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0193  flagellar biosynthetic protein FliR  53.64 
 
 
263 aa  291  5e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3473  flagellar biosynthetic protein FliR  50.97 
 
 
259 aa  261  6.999999999999999e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0586  flagellar biosynthetic protein FliR  38.03 
 
 
260 aa  149  6e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1411  flagellar biosynthetic protein FliR  36.62 
 
 
257 aa  140  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.844633  normal  0.465726 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4197  flagellar biosynthetic protein FliR  35.78 
 
 
261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0483  flagellar biosynthesis protein FliR  28.74 
 
 
261 aa  136  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0146503  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3288  flagellar biosynthetic protein FliR  35.32 
 
 
265 aa  135  5e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0702  flagellar biosynthesis protein FliR  29.88 
 
 
255 aa  135  8e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.310236  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0425  flagellar biosynthesis protein FliR  35.68 
 
 
264 aa  133  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16700  flagellar biosynthetic protein FliR  31.51 
 
 
259 aa  133  3e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794978  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3095  flagellar biosynthesis protein FliR  30.86 
 
 
264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3442  flagellar biosynthetic protein FliR  33.99 
 
 
264 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2697  flagellar biosynthetic protein FliR  30.23 
 
 
255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2394  flagellar biosynthesis protein FliR  34.74 
 
 
255 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1164  flagellar biosynthetic protein FliR  36.18 
 
 
258 aa  123  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3822  flagellar biosynthetic protein FliR  32.89 
 
 
261 aa  122  8e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0763  flagellar biosynthetic protein FliR  33.85 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0712  flagellar biosynthetic protein FliR  34.55 
 
 
258 aa  119  4.9999999999999996e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2033  flagellar biosynthesis protein FliR  29.11 
 
 
265 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.468794  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3906  flagellar biosynthetic protein FliR  31.56 
 
 
261 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00325261 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0788  flagellar biosynthesis protein FliR  36.92 
 
 
255 aa  116  3.9999999999999997e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000389137  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2155  flagellar biosynthetic protein FliR  28.45 
 
 
260 aa  115  8.999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.71741  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0068  flagellar biosynthetic protein FliR  29.3 
 
 
266 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.981811  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0742  flagellar biosynthetic protein FliR  31.31 
 
 
247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.42269  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2541  flagellar biosynthesis protein FliR  30.12 
 
 
264 aa  113  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00342215  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0867  flagellar biosynthetic protein FliR  30.62 
 
 
253 aa  113  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1514  flagellar biosynthesis protein FliR  30.49 
 
 
260 aa  112  5e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4136  flagellar biosynthetic protein FliR  30.7 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.140259  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2943  flagellar biosynthetic protein FliR  29.75 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2587  flagellar biosynthesis protein FliR  30.6 
 
 
261 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3915  flagellar biosynthesis protein FliR  32.58 
 
 
258 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.834588  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1750  flagellar biosynthetic protein FliR  33.33 
 
 
253 aa  109  6e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1640  flagellar biosynthetic protein FliR  31.67 
 
 
253 aa  108  9.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1513  flagellar biosynthesis protein FliR  32.6 
 
 
258 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.859445  normal  0.0902161 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3679  flagellar biosynthesis protein FliR  31.22 
 
 
258 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0271988  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1879  flagellar biosynthesis protein FliR  30.22 
 
 
261 aa  107  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0482  flagellar biosynthetic protein FliR  32.89 
 
 
263 aa  107  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1170  flagellar biosynthetic protein FliR  31.6 
 
 
253 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.113223 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1333  flagellar biosynthetic protein FliR  28.22 
 
 
257 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.762927  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1751  flagellar biosynthetic protein fliR  31.71 
 
 
256 aa  106  5e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1438  flagellar biosynthesis protein FliR  29.49 
 
 
257 aa  105  6e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1751  flagellar biosynthetic protein fliR  31.3 
 
 
256 aa  105  9e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4353  flagellar biosynthesis protein FliR  31.67 
 
 
258 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.179069 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2144  flagellar biosynthesis protein FliR  29.92 
 
 
264 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0345603  hitchhiker  0.00457903 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2139  flagellar biosynthesis protein FliR  29.92 
 
 
264 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.19844  normal  0.226973 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2197  flagellar biosynthesis protein FliR  29.92 
 
 
264 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103622  normal  0.587287 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1261  flagellar biosynthesis protein FliR  29.92 
 
 
264 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0910889  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1194  flagellar biosynthesis protein FliR  29.82 
 
 
255 aa  103  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.894574  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1138  flagellar biosynthesis protein FliR  30.96 
 
 
264 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000910874  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4383  flagellar biosynthetic protein FliR  32.26 
 
 
247 aa  103  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0215  flagellar biosynthetic protein FliR  30.34 
 
 
260 aa  103  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.598232  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3035  flagellar biosynthesis protein FliR  31.85 
 
 
259 aa  102  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1313  flagellar biosynthesis protein FliR  29.36 
 
 
255 aa  102  6e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.518612  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0550  flagellar biosynthesis protein FliR  29.36 
 
 
255 aa  102  6e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.826855  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3442  flagellar biosynthesis protein FliR  29.08 
 
 
261 aa  102  7e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5879  flagellar biosynthesis protein FliR  27.64 
 
 
261 aa  102  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250463  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1551  flagellar biosynthesis protein FliR  29.55 
 
 
261 aa  101  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272266  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3069  flagellar biosynthetic protein FliR  36.3 
 
 
247 aa  100  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159103  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0153  flagellar biosynthesis protein FliR  30.33 
 
 
260 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.800809 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02875  flagellar biosynthesis protein FliR  31.22 
 
 
259 aa  100  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3795  flagellar biosynthetic protein FliR  36.3 
 
 
256 aa  100  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3782  flagellar biosynthetic protein FliR  28.69 
 
 
260 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1698  flagellar biosynthetic protein FliR  31.98 
 
 
261 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412821  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3216  flagellar biosynthesis protein FliR  28.38 
 
 
265 aa  99.8  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2050  flagellar biosynthesis protein FliR  31.84 
 
 
261 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000709328  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1234  flagellar biosynthesis protein FliR  31.98 
 
 
261 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000114634  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2183  flagellar biosynthesis protein FliR  31.98 
 
 
261 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000259397  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3432  flagellar biosynthetic protein FliR  32.31 
 
 
260 aa  99.8  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2727  flagellar biosynthesis protein FliR  31.98 
 
 
261 aa  99.8  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00116197  normal  0.508279 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1357  flagellar biosynthetic protein FliR  28.9 
 
 
260 aa  99.4  5e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.811405  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0547  flagellar biosynthesis protein FliR  28.51 
 
 
253 aa  99.4  5e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00458922  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1194  flagellar biosynthesis protein FliR  27.43 
 
 
267 aa  99.8  5e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0650  flagellar biosynthetic protein FliR  29.73 
 
 
256 aa  99.4  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5303  flagellar biosynthetic protein FliR  30.91 
 
 
261 aa  99  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.114912 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1361  flagellar biosynthesis protein FliR  28.83 
 
 
265 aa  99.4  6e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.837405 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1354  flagellar biosynthesis protein FliR  28.83 
 
 
265 aa  99  6e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.541538  normal  0.208053 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1798  flagellar biosynthesis protein FliR  28.05 
 
 
254 aa  99  7e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1974  flagellar biosynthetic protein FliR  27.94 
 
 
258 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0533447  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1294  flagellar biosynthesis protein FliR  28.83 
 
 
265 aa  99  8e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.755718  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0054  flagellar biosynthetic protein FliR  29.34 
 
 
260 aa  98.6  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  29.34 
 
 
260 aa  98.6  9e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  29.34 
 
 
260 aa  98.6  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1091  flagellar biosynthesis protein FliR  32.39 
 
 
256 aa  97.8  1e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1692  flagellar biosynthesis protein FliR  31.53 
 
 
261 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000555568  normal  0.0138418 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24110  flagellar biosynthetic protein  31.39 
 
 
264 aa  98.6  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.253106  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1071  flagellar biosynthesis protein FliR  31.53 
 
 
261 aa  98.2  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000309979  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3056  flagellar biosynthesis protein FliR  27.39 
 
 
265 aa  97.1  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.394206 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2914  flagellar biosynthesis protein FliR  27.39 
 
 
265 aa  97.1  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.401935  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2170  flagellar biosynthetic protein FliR  27.06 
 
 
261 aa  97.8  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1338  flagellar biosynthesis protein FliR  28.97 
 
 
267 aa  97.8  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1449  flagellar biosynthesis protein FliR  27.04 
 
 
265 aa  97.4  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.22312  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2924  flagellar biosynthesis protein FliR  27.39 
 
 
265 aa  97.1  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2810  flagellar biosynthesis protein FliR  29.46 
 
 
258 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.47893  normal  0.0490399 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1859  flagellar biosynthetic protein FliR  30.52 
 
 
260 aa  96.3  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.352593  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2693  flagellar biosynthetic protein FliR  30.52 
 
 
260 aa  96.3  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0034  flagellar biosynthetic protein FliR  30.52 
 
 
260 aa  96.3  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3268  flagellar biosynthetic protein FliR  30.52 
 
 
260 aa  96.3  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>