More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1966 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1966  thiamine-monophosphate kinase  100 
 
 		 365 aa  716    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2811  thiamine-monophosphate kinase  54.12 
 
 		 323 aa  358  9e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.612924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3570  thiamine-monophosphate kinase  51.06 
 
 		 339 aa  322  5e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0070  thiamine-monophosphate kinase  44.99 
 
 		 356 aa  269  5.9999999999999995e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2006  thiamine-monophosphate kinase  42.94 
 
 		 329 aa  246  3e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3747  thiamine monophosphate kinase  32.79 
 
 		 344 aa  139  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.635061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1597  thiamine-phosphate kinase  34.81 
 
 		 319 aa  135  9e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0493  thiamine monophosphate kinase  30.84 
 
 		 329 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.371786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3665  thiamine-monophosphate kinase  32.34 
 
 		 332 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3919  thiamine-monophosphate kinase  35.83 
 
 		 331 aa  126  5e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0487  thiamine-monophosphate kinase  34.63 
 
 		 319 aa  126  6e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  31.61 
 
 		 323 aa  124  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  34 
 
 		 329 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0432  thiamine-monophosphate kinase  36.5 
 
 		 326 aa  119  9e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0313115  normal  0.821004 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0479  thiamine monophosphate kinase  31.25 
 
 		 325 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2193  thiamine-monophosphate kinase  33.87 
 
 		 317 aa  118  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00454297  hitchhiker  0.00000617808 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  31.75 
 
 		 339 aa  119  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4471  thiamine-monophosphate kinase  32.7 
 
 		 332 aa  119  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.118432 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0529  thiamine-monophosphate kinase  34.89 
 
 		 335 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0957799  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11180  thiamine-phosphate kinase  33.81 
 
 		 332 aa  117  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0310468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1278  thiamine-phosphate kinase  28.85 
 
 		 319 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  unclonable  0.0000000000863796 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0986  thiamine monophosphate kinase  31.6 
 
 		 375 aa  116  6e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  29.12 
 
 		 319 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  32.45 
 
 		 323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0356  thiamine-monophosphate kinase  34.06 
 
 		 324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3443  thiamine-monophosphate kinase  32.56 
 
 		 315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.549222  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1584  thiamine monophosphate kinase  32.28 
 
 		 300 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.407521  normal  0.0322048 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18480  thiamine-monophosphate kinase  34.28 
 
 		 372 aa  114  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.04788  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1040  thiamine-monophosphate kinase  31.3 
 
 		 318 aa  114  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000743717  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2889  thiamine-monophosphate kinase  29.18 
 
 		 334 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202219  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2896  thiamine monophosphate kinase  30.14 
 
 		 324 aa  113  5e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0345  thiamine-monophosphate kinase  34.06 
 
 		 324 aa  113  5e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.277053  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0204  thiamine-monophosphate kinase  32.2 
 
 		 330 aa  113  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0210  thiamine-phosphate kinase  33.61 
 
 		 323 aa  113  6e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.631674 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0460  thiamine monophosphate kinase  30.65 
 
 		 326 aa  112  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0521  thiamine monophosphate kinase  30.65 
 
 		 326 aa  112  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0711  thiamine-monophosphate kinase  34.68 
 
 		 321 aa  112  8.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0458  thiamine monophosphate kinase  31.44 
 
 		 326 aa  112  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.703911  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8005  Thiamine-phosphate kinase  32.27 
 
 		 318 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  32.18 
 
 		 324 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2605  thiamine monophosphate kinase  33.78 
 
 		 331 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.807884  normal  0.0305329 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0466  thiamine monophosphate kinase  31.16 
 
 		 326 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8038  thiamine-monophosphate kinase  31.16 
 
 		 370 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1192  thiamine-monophosphate kinase  30.79 
 
 		 323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0510899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09190  thiamine-phosphate kinase  29.72 
 
 		 322 aa  111  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.268775  normal  0.793617 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1075  thiamine monophosphate kinase  29.92 
 
 		 327 aa  110  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255519  hitchhiker  0.000417977 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1387  thiamine-monophosphate kinase  29.89 
 
 		 319 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0324994  unclonable  0.0000000216996 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3114  thiamine monophosphate kinase  31.33 
 
 		 329 aa  110  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3255  thiamine monophosphate kinase  31.33 
 
 		 329 aa  110  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05609  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1533  thiamine-monophosphate kinase  29.12 
 
 		 320 aa  109  7.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0750268  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3166  thiamine monophosphate kinase  31.07 
 
 		 329 aa  109  7.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0358  thiamine-monophosphate kinase  27.72 
 
 		 355 aa  109  7.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00127511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0885  thiamine monophosphate kinase  32.21 
 
 		 323 aa  109  8.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3047  thiamine monophosphate kinase  33.51 
 
 		 325 aa  109  8.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2317  thiamine monophosphate kinase  28.09 
 
 		 332 aa  109  9.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00365  thiamine monophosphate kinase  30 
 
 		 325 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.532124  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3192  thiamine-monophosphate kinase  30 
 
 		 325 aa  108  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3477  thiamine monophosphate kinase  34.82 
 
 		 333 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.695085  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2478  thiamine monophosphate kinase  34.82 
 
 		 333 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.152794  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0448  thiamine monophosphate kinase  30 
 
 		 325 aa  108  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3475  thiamine monophosphate kinase  34.82 
 
 		 333 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0488  thiamine monophosphate kinase  30 
 
 		 325 aa  109  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3308  thiamine monophosphate kinase  34.82 
 
 		 333 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1257  thiamine monophosphate kinase  34.82 
 
 		 333 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0397  thiamine monophosphate kinase  34.82 
 
 		 333 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.100912  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3440  thiamine monophosphate kinase  34.82 
 
 		 333 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.721251  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00369  hypothetical protein  30 
 
 		 325 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.381421  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0453  thiamine monophosphate kinase  30 
 
 		 325 aa  108  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0338  thiamine monophosphate kinase  30 
 
 		 325 aa  108  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3216  thiamine monophosphate kinase  30 
 
 		 325 aa  108  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3740  thiamine-monophosphate kinase  31.83 
 
 		 325 aa  108  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0499  thiamine monophosphate kinase  29.78 
 
 		 325 aa  108  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1188  thiamine monophosphate kinase  34.19 
 
 		 333 aa  108  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  29.4 
 
 		 318 aa  108  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11460  thiamine monophosphate kinase  33.91 
 
 		 322 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0770171  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  32.67 
 
 		 328 aa  107  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0477  thiamine-monophosphate kinase  26.47 
 
 		 306 aa  107  4e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2768  thiamine monophosphate kinase  35.39 
 
 		 332 aa  106  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.086077  normal  0.517414 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1050  thiamine monophosphate kinase  33.43 
 
 		 322 aa  106  6e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0604  thiamine monophosphate kinase  27.45 
 
 		 325 aa  106  6e-22  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0648083  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2773  thiamine-monophosphate kinase  29.2 
 
 		 323 aa  106  6e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00271748  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4465  thiamine-monophosphate kinase  34.34 
 
 		 325 aa  106  7e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.269077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2848  thiamine monophosphate kinase  33.51 
 
 		 326 aa  106  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0832  thiamine-monophosphate kinase  29.06 
 
 		 335 aa  105  9e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000411831  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3087  thiamine monophosphate kinase  30.11 
 
 		 324 aa  105  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  29.94 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0556  thiamine monophosphate kinase  34.35 
 
 		 334 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.301311 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3282  thiamine monophosphate kinase  30.19 
 
 		 326 aa  104  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0847  thiamine-monophosphate kinase  30.81 
 
 		 315 aa  104  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.532066  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0583  thiamine-monophosphate kinase  35.79 
 
 		 338 aa  104  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004260  thiamine-monophosphate kinase  28.53 
 
 		 321 aa  103  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0240227  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01171  thiamine monophosphate kinase  28.34 
 
 		 321 aa  103  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0927  thiamine-monophosphate kinase  28.29 
 
 		 330 aa  103  4e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.93501  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3155  thiamine-monophosphate kinase  29.59 
 
 		 323 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000840757  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1216  thiamine-monophosphate kinase  29.86 
 
 		 323 aa  103  5e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000120227  normal  0.180356 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1028  thiamine monophosphate kinase  30.06 
 
 		 326 aa  103  6e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3400  thiamine monophosphate kinase  32.77 
 
 		 332 aa  103  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0357932 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3153  thiamine-monophosphate kinase  29.59 
 
 		 323 aa  103  6e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000108532  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1856  thiamine monophosphate kinase  31.23 
 
 		 334 aa  102  7e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0710389  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3288  thiamine monophosphate kinase  31.98 
 
 		 316 aa  102  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.13566  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>