252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1914 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1914  protein of unknown function DUF939  100 
 
 		 395 aa  801    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2884  hypothetical protein  47.43 
 
 		 360 aa  298  9e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0097  hypothetical protein  42.38 
 
 		 347 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0146368  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0164  hypothetical protein  39.94 
 
 		 359 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0054  hypothetical protein  41.11 
 
 		 338 aa  261  2e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3675  protein of unknown function DUF939  23.06 
 
 		 708 aa  84  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0309  hypothetical protein  32.89 
 
 		 363 aa  73.9  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.631914  normal  0.0699099 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0368  hypothetical protein  25.21 
 
 		 378 aa  73.6  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.992488 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2736  hypothetical protein  28.9 
 
 		 363 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.30564  normal  0.0867479 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2601  hypothetical protein  27.31 
 
 		 371 aa  68.6  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4720  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  25.81 
 
 		 746 aa  66.6  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171257  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4389  hypothetical protein  26.99 
 
 		 361 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4422  fusaric acid resistance protein region  29.78 
 
 		 690 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4282  fusaric acid resistance protein region  29.78 
 
 		 711 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4234  Fusaric acid resistance protein conserved region  29.78 
 
 		 690 aa  64.7  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0118  fusaric acid resistance protein region  29.78 
 
 		 690 aa  64.3  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.429698  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1280  hypothetical protein  26.56 
 
 		 364 aa  63.2  0.000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.638215 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1355  protein of unknown function DUF939  25.35 
 
 		 359 aa  62.4  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0015  hypothetical protein  30.92 
 
 		 380 aa  62.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0005  hypothetical protein  25 
 
 		 377 aa  62.8  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00809476  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4267  fusaric acid resistance protein region  27.47 
 
 		 662 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1818  hypothetical protein  28.18 
 
 		 664 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1167  fusaric acid resistance protein region  27.48 
 
 		 676 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240521 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1226  hypothetical protein  25.43 
 
 		 374 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.826461 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1134  hypothetical protein  27.51 
 
 		 376 aa  60.5  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3209  hypothetical protein  25 
 
 		 355 aa  59.7  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0499107 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6623  Fusaric acid resistance protein conserved region  29.21 
 
 		 700 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1150  fusaric acid resistance protein region  26.96 
 
 		 662 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0139844  normal  0.271992 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1421  hypothetical membrane spanning protein  23.67 
 
 		 377 aa  58.2  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.230954  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2983  Fusaric acid resistance protein conserved region  27.59 
 
 		 697 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2682  fusaric acid resistance protein region  26.67 
 
 		 691 aa  58.5  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7105  hypothetical protein  30.11 
 
 		 350 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4696  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  23.5 
 
 		 745 aa  58.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.427482 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1484  hypothetical protein  23.08 
 
 		 377 aa  57.8  0.0000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.356024  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0154  hypothetical protein  27.07 
 
 		 374 aa  57.4  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2149  hypothetical protein  25.29 
 
 		 388 aa  57  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.432183  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0146  hypothetical protein  27.07 
 
 		 372 aa  57.4  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.790344 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0141  hypothetical protein  27.07 
 
 		 372 aa  57.4  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0201  fusaric acid resistance protein region  30.32 
 
 		 695 aa  57  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0141  hypothetical protein  27.07 
 
 		 372 aa  57  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0176  fusaric acid resistance protein region  30.97 
 
 		 695 aa  57  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.314543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0144  hypothetical protein  28.02 
 
 		 371 aa  57  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12921  hypothetical protein  27.78 
 
 		 151 aa  57  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0893341 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21280  hypothetical protein  26.9 
 
 		 664 aa  56.2  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0197  fusaric acid resistance protein region  30.32 
 
 		 695 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0487942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4083  fusaric acid resistance protein region  27.92 
 
 		 682 aa  55.8  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4639  fusaric acid resistance protein region  27.98 
 
 		 732 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2612  AraE family aromatic acid exporter  29.41 
 
 		 700 aa  56.2  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3730  hypothetical protein  26.74 
 
 		 362 aa  56.2  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1351  hypothetical protein  22.99 
 
 		 721 aa  55.8  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2531  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  21.71 
 
 		 740 aa  55.8  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1292  fusaric acid resistance protein region  26.63 
 
 		 681 aa  55.8  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.944306 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2237  inner membrane protein YeeA  28.09 
 
 		 352 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.223026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3320  hypothetical protein  26.92 
 
 		 374 aa  55.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0550063  normal  0.724266 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5051  fusaric acid resistance protein region  30.32 
 
 		 695 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2283  hypothetical protein  28.09 
 
 		 352 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0319559 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2396  inner membrane protein YeeA  28.09 
 
 		 352 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1796  fusaric acid resistance protein region  26.16 
 
 		 625 aa  54.7  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00451003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4511  fusaric acid resistance protein  26.28 
 
 		 663 aa  54.7  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0314221 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52940  hypothetical protein  27.38 
 
 		 731 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0760  hypothetical protein  30 
 
 		 698 aa  54.3  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.183091  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2230  inner membrane protein YeeA  27.53 
 
 		 352 aa  53.9  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3199  hypothetical protein  23.88 
 
 		 700 aa  54.3  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000232699  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0171  fusaric acid resistance protein region  26.34 
 
 		 687 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0939  fusaric acid resistance protein region  29.75 
 
 		 730 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4934  fusaric acid resistance protein region  30.82 
 
 		 687 aa  54.3  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1992  fusaric acid resistance protein region  28.15 
 
 		 702 aa  54.3  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.355593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4661  hypothetical protein  23.28 
 
 		 776 aa  54.3  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.415956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1365  hypothetical protein  28.99 
 
 		 272 aa  53.9  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1184  fusaric acid resistance protein region  26.47 
 
 		 662 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.476236  normal  0.23816 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5462  fusaric acid resistance protein region  24.26 
 
 		 718 aa  53.9  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0737125 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47810  hypothetical protein  28.86 
 
 		 679 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00112495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2183  inner membrane protein YeeA  27.53 
 
 		 352 aa  53.9  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1402  hypothetical protein  29.08 
 
 		 364 aa  53.5  0.000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1903  hypothetical protein  28.99 
 
 		 269 aa  53.5  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.515369  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4793  putative inner membrane efflux transporter  28.04 
 
 		 659 aa  53.1  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.310622  normal  0.638285 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1212  hypothetical protein  21.38 
 
 		 731 aa  53.1  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000149337  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3343  Fusaric acid resistance protein conserved region  29.11 
 
 		 688 aa  53.1  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0973  membrane protein-like protein  28.57 
 
 		 189 aa  53.1  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2863  hypothetical protein  25.23 
 
 		 352 aa  53.1  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.104583 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2694  hypothetical protein  23.13 
 
 		 721 aa  52.8  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0146  hypothetical protein  26.37 
 
 		 389 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0143  hypothetical protein  26.37 
 
 		 388 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0685  hypothetical protein  26.38 
 
 		 354 aa  52.4  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1329  hypothetical protein  30.82 
 
 		 217 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.666788  normal  0.253277 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0147  hypothetical protein  26.37 
 
 		 380 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.311964 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4353  fusaric acid resistance protein region  26.19 
 
 		 665 aa  52.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3597  membrane protein  25.44 
 
 		 356 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1919  hypothetical protein  26.24 
 
 		 364 aa  52.8  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.259115  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1952  fusaric acid resistance protein region  27.74 
 
 		 704 aa  52.8  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3646  fusaric acid resistance protein region  25.58 
 
 		 688 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0600324  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1953  hypothetical protein  26.24 
 
 		 364 aa  52.8  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4120  hypothetical protein  27.52 
 
 		 679 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.215585  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4721  fusaric acid resistance protein region  25.58 
 
 		 688 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00201941 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5579  fusaric acid resistance protein region  25.58 
 
 		 688 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.152208  hitchhiker  0.00845324 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4212  hypothetical protein  26.37 
 
 		 389 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0336  hypothetical protein  28.99 
 
 		 197 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1053  hypothetical protein  28.99 
 
 		 197 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1057  hypothetical protein  27.49 
 
 		 357 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0815  hypothetical protein  28.99 
 
 		 197 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>