200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1905 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1905  hypothetical protein  100 
 
 
553 aa  1130    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5415  hypothetical protein  29.02 
 
 
577 aa  231  3e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4402  hypothetical protein  29.42 
 
 
577 aa  230  4e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.256321  normal  0.491316 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4031  sulfatase  28.84 
 
 
577 aa  228  2e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4494  hypothetical protein  28.67 
 
 
577 aa  226  6e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03789  hypothetical protein  28.84 
 
 
577 aa  226  7e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03840  conserved inner membrane protein  28.84 
 
 
577 aa  226  7e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4061  hypothetical protein  28.84 
 
 
577 aa  226  7e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4441  hypothetical protein  28.84 
 
 
577 aa  226  7e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4189  hypothetical protein  28.84 
 
 
577 aa  226  7e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04430  hypothetical protein  30.3 
 
 
589 aa  224  3e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.117859  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4359  hypothetical protein  28.23 
 
 
577 aa  223  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4523  hypothetical protein  28.23 
 
 
577 aa  223  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000496918 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4446  hypothetical protein  28.23 
 
 
577 aa  223  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0100692 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4328  hypothetical protein  28.23 
 
 
577 aa  223  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.91856  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4449  hypothetical protein  28.06 
 
 
577 aa  223  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.155408 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3283  hypothetical protein  31.39 
 
 
592 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.972392 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5131  hypothetical protein  31.9 
 
 
600 aa  221  3e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.214339  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58610  hypothetical protein  31.9 
 
 
600 aa  220  5e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0756  hypothetical protein  28.78 
 
 
565 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.112418 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2579  hypothetical protein  31.51 
 
 
584 aa  217  4e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3137  hypothetical protein  31.32 
 
 
584 aa  216  9e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0113  hypothetical protein  30.64 
 
 
573 aa  208  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2584  hypothetical protein  30.27 
 
 
583 aa  206  7e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.734058 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1154  sulfatase  26.57 
 
 
564 aa  164  6e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.614879  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2111  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  26.92 
 
 
571 aa  150  4e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4610  sulfatase  30.63 
 
 
592 aa  129  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1948  hypothetical protein  26.7 
 
 
544 aa  120  4.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1874  hypothetical protein  26.7 
 
 
544 aa  120  4.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1039  integral membrane protein  32.16 
 
 
575 aa  118  1.9999999999999998e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000015393 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3401  sulfatase  31.16 
 
 
614 aa  119  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04885  sulfatase domain protein  28.8 
 
 
552 aa  117  6e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.568838  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2902  sulfatase  30.5 
 
 
553 aa  114  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0774  putative membrane-associated, metal-dependent hydrolase  25.42 
 
 
560 aa  114  6e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.000171309  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2532  sulfatase  24.68 
 
 
544 aa  114  7.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.301618  normal  0.874005 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2705  sulfatase  25.98 
 
 
557 aa  113  8.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0021  sulfatase  27.33 
 
 
524 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3642  sulfatase  24.57 
 
 
560 aa  113  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.418054  normal  0.084742 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1018  sulfatase  26.82 
 
 
544 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.663871  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04472  inner membrane protein  26.78 
 
 
532 aa  111  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.898006  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3812  sulfatase  32.36 
 
 
549 aa  109  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0194754  normal  0.186688 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2326  sulfatase  24.89 
 
 
547 aa  108  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.995391  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1777  sulfatase domain-containing protein  23.53 
 
 
589 aa  108  3e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3923  hypothetical protein  27.49 
 
 
547 aa  107  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.107021  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1916  sulfatase  25.27 
 
 
545 aa  107  8e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.725859  normal  0.322218 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1711  sulfatase  28.66 
 
 
551 aa  106  9e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.155197  normal  0.648833 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2041  hypothetical protein  25.8 
 
 
542 aa  106  9e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.017573 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03039  predicted hydrolase, inner membrane  31.23 
 
 
541 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02990  hypothetical protein  31.23 
 
 
541 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3085  phosphatidylethanolamine:Kdo2-lipid A phosphoethanolamine transferase  31.75 
 
 
549 aa  106  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0526  sulfatase  31.23 
 
 
541 aa  105  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000512477 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0236  sulfatase  24.67 
 
 
535 aa  106  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3365  inner membrane protein yhbX  31.23 
 
 
541 aa  105  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00782202  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3658  inner membrane protein yhbX  31.23 
 
 
541 aa  105  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0592797  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3264  putative sulfatase  27.83 
 
 
556 aa  106  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.225612  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0533  sulfatase  31.23 
 
 
547 aa  105  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4495  inner membrane protein yhbX  31.23 
 
 
505 aa  105  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0722596  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3469  inner membrane protein yhbX  31.23 
 
 
505 aa  105  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0525732  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3848  phosphoethanolamine transferase  27.43 
 
 
563 aa  104  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.632743  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1562  sulfatase  28.41 
 
 
558 aa  103  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0048353  hitchhiker  0.00604368 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3478  sulfatase  30.34 
 
 
541 aa  103  6e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4017  phosphoethanolamine transferase  27.21 
 
 
563 aa  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.363242  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0178  phosphoethanolamine transferase  29.58 
 
 
563 aa  103  6e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.11544  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3913  phosphoethanolamine transferase  27.21 
 
 
563 aa  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.291921  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3835  phosphoethanolamine transferase  29.15 
 
 
563 aa  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00912049  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3957  phosphoethanolamine transferase  27.21 
 
 
563 aa  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00895606  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4736  hypothetical protein  31.25 
 
 
515 aa  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1758  hypothetical protein  24.27 
 
 
538 aa  102  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.534399  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1865  sulfatase  30.07 
 
 
575 aa  102  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.65649 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4754  sulfatase family protein  28.02 
 
 
499 aa  102  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4122  sulfatase  30 
 
 
545 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3323  hypothetical protein  30.45 
 
 
572 aa  102  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364714  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3156  hypothetical protein  28.25 
 
 
552 aa  100  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.84731  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1783  sulfatase  26.24 
 
 
552 aa  100  5e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.349972  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1871  sulfatase  24.86 
 
 
541 aa  100  7e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.754116  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2048  hypothetical protein  25 
 
 
541 aa  99.4  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1387  phosphatidylethanolamine:Kdo2-lipid A phosphoethanolamine transferase  28.57 
 
 
549 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39020  hypothetical protein  30.26 
 
 
567 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0446171  normal  0.409491 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0093  sulfatase  27.46 
 
 
550 aa  99.4  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4448  lipid A phosphoethanolamine transferase  29.39 
 
 
545 aa  99.4  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.62439  hitchhiker  0.00124758 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4592  hypothetical protein  29.01 
 
 
545 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0802  sulfatase  25.16 
 
 
531 aa  99.4  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6033  sulfatase  29.25 
 
 
580 aa  99  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.218752 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1854  inner membrane protein  25.78 
 
 
552 aa  99  2e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.458981  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03396  predicted metal dependent hydrolase  26.8 
 
 
563 aa  98.6  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0166  sulfatase  26.8 
 
 
563 aa  98.6  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03347  hypothetical protein  26.8 
 
 
563 aa  98.6  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0471  phosphatidylethanolamine:Kdo2-lipid A phosphoethanolamine transferase  28.47 
 
 
555 aa  98.6  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.882488 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0170  phosphoethanolamine transferase  26.8 
 
 
563 aa  98.6  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3983  phosphoethanolamine transferase  26.8 
 
 
563 aa  98.6  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.449102  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1296  hypothetical protein  30.04 
 
 
545 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3747  phosphoethanolamine transferase  26.8 
 
 
563 aa  98.6  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4041  phosphoethanolamine transferase  26.8 
 
 
563 aa  98.6  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3867  phosphoethanolamine transferase  26.8 
 
 
563 aa  98.2  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4916  phosphoethanolamine transferase  29.26 
 
 
563 aa  98.2  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0885  sulfatase family protein  23.85 
 
 
527 aa  98.2  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0481411  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2103  sulfatase  24.67 
 
 
541 aa  97.4  6e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.381763  normal  0.850087 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0964  sulfatase family protein  24.06 
 
 
527 aa  97.4  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00476272  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2533  sulfatase family protein  24.06 
 
 
527 aa  97.1  7e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.768289  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0839  sulfatase family protein  24.06 
 
 
527 aa  97.4  7e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.195944  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>