More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1890 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1890  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 
358 aa  743    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2631  iron-containing alcohol dehydrogenase  80.17 
 
 
357 aa  595  1e-169  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.703448 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2213  iron-containing alcohol dehydrogenase  64.62 
 
 
359 aa  514  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1857  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.94 
 
 
356 aa  339  5e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000304818  unclonable  0.00000258476 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2133  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.94 
 
 
356 aa  339  5e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000021113  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2374  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.66 
 
 
356 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000461423  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2362  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.66 
 
 
356 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000229628  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1760  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.22 
 
 
356 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0108166  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1985  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.38 
 
 
356 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000240423  unclonable  0.00000000000340211 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2477  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.38 
 
 
356 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000271565  decreased coverage  0.000108776 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1852  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.94 
 
 
356 aa  335  5e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000318302  hitchhiker  0.00000012761 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2477  alcohol dehydrogenase, iron-containing  46.22 
 
 
356 aa  335  9e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2126  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.66 
 
 
356 aa  334  1e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0147626  unclonable  0.0000187018 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1907  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.66 
 
 
356 aa  333  2e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000681421  unclonable  0.0000000000909138 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3202  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.44 
 
 
353 aa  333  3e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2183  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.94 
 
 
356 aa  333  3e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000901085  normal  0.0100031 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2423  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.94 
 
 
356 aa  330  3e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.195896  decreased coverage  0.00000137469 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1640  alcohol dehydrogenase, iron-containing  45.1 
 
 
356 aa  326  3e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000263255  normal  0.217224 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2140  Iron-containing alcohol dehydrogenase  44.17 
 
 
357 aa  321  9.999999999999999e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.741299  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0804  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.33 
 
 
358 aa  308  8e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10583  ethanolamine utilization protein-like protein  43.06 
 
 
614 aa  298  9e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2803  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.06 
 
 
365 aa  261  1e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1279  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.61 
 
 
384 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00932196  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2430  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.13 
 
 
384 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.528301  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1786  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.62 
 
 
388 aa  112  8.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2082  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.14 
 
 
388 aa  111  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1233  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.62 
 
 
387 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1628  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.12 
 
 
398 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.197511  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0740  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.15 
 
 
395 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.84 
 
 
397 aa  107  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0115621 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1990  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.14 
 
 
390 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.352675  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2234  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.14 
 
 
382 aa  105  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10038 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2506  alcohol dehydrogenase, class IV  29.37 
 
 
387 aa  105  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.75007e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1719  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.72 
 
 
390 aa  105  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1986  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.14 
 
 
382 aa  105  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0257  alcohol dehydrogenase, class IV  28.47 
 
 
383 aa  104  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0521  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.36 
 
 
383 aa  103  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000118982 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1261  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.63 
 
 
381 aa  103  5e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.528177  normal  0.0459015 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.2 
 
 
382 aa  102  7e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.020336  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1053  Iron-containing alcohol dehydrogenase  27.11 
 
 
382 aa  102  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000489581 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3267  alcetaldehyde dehydrogenase or NADPH-dependent butanol dehydrogenase  30.25 
 
 
369 aa  102  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05412  alcohol dehydrogenase  28.73 
 
 
382 aa  101  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4348  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.79 
 
 
385 aa  100  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.159902  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1048  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.63 
 
 
395 aa  100  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.155251  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1128  alcohol dehydrogenase, iron-containing  30.53 
 
 
376 aa  99.8  7e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2802  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.18 
 
 
395 aa  99.8  7e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2290  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.87 
 
 
388 aa  99.4  9e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0834  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.02 
 
 
380 aa  98.6  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.161806 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0990  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.22 
 
 
386 aa  99  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.71484 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3658  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.61 
 
 
383 aa  99  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1833  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.18 
 
 
382 aa  99  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.453404  normal  0.863481 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1584  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.22 
 
 
383 aa  98.2  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140068  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0441  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.51 
 
 
399 aa  98.6  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2945  dehydrogenase  31.8 
 
 
381 aa  98.2  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1513  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.2 
 
 
376 aa  98.2  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.496166  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4103  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.04 
 
 
371 aa  97.4  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1609  alcohol dehydrogenase  31.68 
 
 
382 aa  97.4  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  26.79 
 
 
382 aa  97.4  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2222  propanol dehydrogenase  29.43 
 
 
370 aa  97.8  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.806517 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2066  alcohol dehydrogenase, iron-containing  31.68 
 
 
400 aa  97.1  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.904837  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2006  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.68 
 
 
400 aa  97.1  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.857021  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2250  alcohol dehydrogenase, iron-containing  31.68 
 
 
400 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.32939e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2222  alcohol dehydrogenase  31.68 
 
 
392 aa  97.1  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662473  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0885  alcohol dehydrogenase, iron-containing  31.6 
 
 
376 aa  97.1  4e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2279  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.17 
 
 
374 aa  97.1  4e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4700  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.35 
 
 
377 aa  96.7  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  26.79 
 
 
382 aa  97.1  5e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2803  1,3-propanediol dehydrogenase  30.45 
 
 
394 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1481  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.78 
 
 
382 aa  96.7  6e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2455  alcohol dehydrogenase II  28.86 
 
 
382 aa  96.7  6e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5260  alcohol dehydrogenase  27.59 
 
 
399 aa  96.3  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.926776 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001472  alcohol dehydrogenase  26.44 
 
 
382 aa  96.3  8e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2005  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.04 
 
 
400 aa  95.9  9e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000571381  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2175  propanediol utilization: propanol dehydrogenase  29.06 
 
 
370 aa  95.9  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0702  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.8 
 
 
386 aa  95.5  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.149133 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1369  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.12 
 
 
368 aa  95.5  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0976  alcohol dehydrogenase, iron-containing  27.5 
 
 
376 aa  95.9  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1164  alcohol dehydrogenase, iron-containing  29.33 
 
 
388 aa  95.9  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3532  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.19 
 
 
388 aa  95.9  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1857  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.36 
 
 
382 aa  95.9  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2388  propanediol utilization: propanol dehydrogenase  29.06 
 
 
370 aa  95.9  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.64 
 
 
384 aa  95.1  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2252  alcohol dehydrogenase, iron-containing  30.85 
 
 
400 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.366861  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2290  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.14 
 
 
394 aa  94.7  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000188362  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2334  alcohol dehydrogenase, iron-containing  27.33 
 
 
400 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0717342  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3982  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.4 
 
 
368 aa  94.7  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1164  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.57 
 
 
379 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144236  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2938  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.88 
 
 
382 aa  95.1  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3674  ethanolamine utilization protein EutG  28.12 
 
 
395 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1386  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.53 
 
 
376 aa  94  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.913625  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2650  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.99 
 
 
376 aa  94.4  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1180  1,3-propanediol dehydrogenase  27.62 
 
 
385 aa  94.4  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.440796  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1011  1,3-propanediol dehydrogenase  27.62 
 
 
385 aa  94.4  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000128902  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2762  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.88 
 
 
382 aa  94.4  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2840  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.88 
 
 
382 aa  94.4  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2229  propanediol utilization: propanol dehydrogenase  29.06 
 
 
370 aa  94.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.176556  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2275  propanol dehydrogenase  28.73 
 
 
370 aa  94  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0229422 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2582  ethanolamine utilization protein EutG  30.2 
 
 
395 aa  93.6  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2819  ethanolamine utilization protein EutG  28.61 
 
 
395 aa  94  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0507  NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase  30.6 
 
 
371 aa  94  4e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>