270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1887 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1887  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
353 aa  733    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0069  glycosyl transferase family 2  34.38 
 
 
302 aa  149  5e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.866174  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  38.33 
 
 
2401 aa  140  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  33.58 
 
 
1739 aa  135  9e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  27.66 
 
 
785 aa  77  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  29.52 
 
 
679 aa  77  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  29.49 
 
 
1162 aa  76.3  0.0000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  27.72 
 
 
1268 aa  75.5  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  27.5 
 
 
1435 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  28.03 
 
 
700 aa  73.9  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  29.52 
 
 
624 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3218  glycosyl transferase family protein  25.54 
 
 
902 aa  73.6  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0552261  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0114  glycosyl transferase family 2  29.72 
 
 
410 aa  73.6  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  26.44 
 
 
1523 aa  73.2  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  25.96 
 
 
1523 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  27.14 
 
 
1119 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2342  glycosyl transferase family protein  27.6 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3142  glycosyl transferase family 2  29.03 
 
 
430 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4093  glycosyl transferase family 2  28.71 
 
 
296 aa  65.1  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.206516  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1711  glycosyl transferase family 2  25.25 
 
 
337 aa  64.3  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9788799999999997e-27 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2557  glycosyl transferase family protein  24.9 
 
 
499 aa  64.3  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  25.23 
 
 
860 aa  62.8  0.000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0777  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 
280 aa  62.4  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 
616 aa  62  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  26.14 
 
 
1340 aa  61.2  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
334 aa  60.8  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0820  glycosyl transferase family protein  27.07 
 
 
308 aa  58.9  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2508  glycosyl transferase family 2  26.32 
 
 
337 aa  58.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000796473  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4681  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 
345 aa  57.8  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627848  normal  0.36467 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5040  glycosyl transferase family 2  26.6 
 
 
323 aa  57.4  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.476681  normal  0.0567661 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3973  glycosyl transferase family protein  24.9 
 
 
1275 aa  57  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1851  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.84 
 
 
214 aa  56.6  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1529  glycosyl transferase family 2  27.84 
 
 
214 aa  56.6  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.322486  normal  0.0695414 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2296  glycosyl transferase family protein  23.08 
 
 
632 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.870587  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4180  glycosyl transferase family 2  23.48 
 
 
506 aa  56.2  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1949  glycosyl transferase family protein  23.02 
 
 
717 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  22.59 
 
 
294 aa  55.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1948  glycosyl transferase family 2  24.07 
 
 
721 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  25.64 
 
 
333 aa  54.7  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2849  glycosyl transferase family protein  24.29 
 
 
824 aa  55.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  26.24 
 
 
298 aa  55.1  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0773  glycosyl transferase family protein  26.4 
 
 
369 aa  54.7  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  24.34 
 
 
337 aa  54.3  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0907  glycosyl transferase family protein  25.19 
 
 
415 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00249013  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5292  glycosyl transferase family 2  25.21 
 
 
327 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2264  glycosyl transferase family 2  22.9 
 
 
270 aa  53.9  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.503819  normal  0.135779 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2225  glycosyl transferase family 2  22.62 
 
 
717 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.432582 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2086  glycosyl transferase family protein  31.78 
 
 
274 aa  53.5  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3719  glycosyl transferase family 2  23.48 
 
 
327 aa  53.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  24.61 
 
 
1644 aa  53.1  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3563  glycosyl transferase family 2  25.28 
 
 
271 aa  52.8  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.03489  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  24.61 
 
 
1644 aa  53.1  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1503  glycosyl transferase family 2  22.81 
 
 
733 aa  53.1  0.000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1742  glycosyltransferase  30.97 
 
 
281 aa  52  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00465779  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  24.61 
 
 
1106 aa  52.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1298  glycosyl transferase family protein  24.88 
 
 
289 aa  52.4  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3489  glycosyl transferase family protein  24.67 
 
 
635 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0475235 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6724  glycosyl transferase family protein  33.96 
 
 
316 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1074  glycosyl transferase, group 2 family protein  22.94 
 
 
1561 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.755532  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1946  glycosyl transferase, group 2 family protein  22.77 
 
 
1191 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.678208  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2814  glycosyl transferase family protein  23.92 
 
 
457 aa  51.6  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0054  glycosyl transferase family 2  26.92 
 
 
557 aa  51.6  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  25.88 
 
 
303 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  27.68 
 
 
279 aa  51.6  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0212  glycosyl transferase family 2  27.78 
 
 
334 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2341  glycosyl transferase family protein  21.34 
 
 
684 aa  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2865  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 
345 aa  51.2  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000384977  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3136  glycosyl transferase family 2  28.33 
 
 
320 aa  51.6  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0775  glycosyl transferase family 2  24.39 
 
 
617 aa  51.6  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1260  glycosyl transferase family protein  27.5 
 
 
309 aa  50.8  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.736334  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0396  glycosyl transferase family protein  30.56 
 
 
625 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0878  glycosyl transferase family protein  30.56 
 
 
625 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08131  glycosyl transferase family protein  25.13 
 
 
303 aa  51.2  0.00003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0454  glycosyl transferase family 2  32.61 
 
 
299 aa  51.2  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.797965  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4364  glycosyl transferase family 2  24.63 
 
 
294 aa  51.2  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  24.43 
 
 
320 aa  50.4  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1842  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
884 aa  50.4  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0563  glycosyl transferase family 2  27.16 
 
 
555 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.158623 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2935  family 2 glycosyl transferase  25.7 
 
 
272 aa  50.8  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.231634 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1388  glycosyl transferase family protein  21.95 
 
 
324 aa  50.4  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0590  glycosyl transferase family 2  26.29 
 
 
329 aa  50.4  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1818  glycosyl transferase family protein  23.86 
 
 
335 aa  50.1  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08121  glycosyl transferase family protein  24.75 
 
 
303 aa  50.1  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0852  glycosyl transferase family protein  26.15 
 
 
765 aa  50.4  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  25.88 
 
 
300 aa  50.4  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1579  glycosyl transferase family protein  26.15 
 
 
318 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0209  glycosyltransferase  33.33 
 
 
102 aa  50.1  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000668914  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2088  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.7 
 
 
384 aa  49.7  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2031  family 2 glycosyl transferase  24.89 
 
 
274 aa  49.7  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3110  glycosyl transferase family 2  25.25 
 
 
325 aa  49.7  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0888  b-glycosyltransferase  28.68 
 
 
333 aa  49.7  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0236559  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0201  glycosyl transferase family 2  27.31 
 
 
334 aa  49.7  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  21.29 
 
 
318 aa  49.7  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0778  glycosyl transferase family 2  29.47 
 
 
384 aa  49.3  0.00009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0620  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.32 
 
 
610 aa  48.9  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0315  glycosyl transferase family protein  23.29 
 
 
775 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.177291 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0849  glycosyl transferase family protein  26.86 
 
 
625 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.33844 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0962  glycosyl transferase family protein  26.11 
 
 
302 aa  48.9  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153227  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1811  glycosyl transferase family protein  28.95 
 
 
294 aa  48.9  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0703738  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02465  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  26.72 
 
 
309 aa  49.3  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.248238  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>