More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1808 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1808  protein of unknown function DUF1078 domain protein  100 
 
 		 501 aa  1009    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2674  hypothetical protein  57.88 
 
 		 498 aa  559  1e-158  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0298  flagella basal body rod domain-containing protein  56.06 
 
 		 501 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0246  protein of unknown function DUF1078 domain protein  42 
 
 		 545 aa  391  1e-107  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0426476 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2091  protein of unknown function DUF1078 domain protein  45.7 
 
 		 499 aa  386  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0508836  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1711  flagellar hook protein FlgE  44.32 
 
 		 527 aa  379  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.185044  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1636  hypothetical protein  41.3 
 
 		 564 aa  377  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0290752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1614  protein of unknown function DUF1078 domain protein  39.88 
 
 		 513 aa  330  2e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.621437  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2432  protein of unknown function DUF1078 domain protein  36.59 
 
 		 562 aa  325  1e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1618  protein of unknown function DUF1078 domain protein  38.21 
 
 		 525 aa  323  5e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3103  hypothetical protein  33.6 
 
 		 419 aa  218  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0419  flagellar hook protein FlgE  34.53 
 
 		 419 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1183  flagellar biosynthesis, hook protein  32.87 
 
 		 413 aa  199  7e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3574  flagellar hook protein FlgE  32.39 
 
 		 414 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.575838 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4413  flagellar hook protein FlgE  32.39 
 
 		 414 aa  190  7e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3954  flagellar hook protein FlgE  32.39 
 
 		 414 aa  190  7e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.42967  normal  0.345321 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2129  flagellar hook protein FlgE  32.93 
 
 		 414 aa  187  5e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.355079  normal  0.0206733 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3570  hypothetical protein  31.4 
 
 		 496 aa  186  7e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.683662 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2768  flagellar hook protein FlgE  31.15 
 
 		 463 aa  183  6e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0119321  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31140  flagellar hook protein FlgE  31.04 
 
 		 394 aa  182  1e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0638977  normal  0.0911466 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2042  protein of unknown function DUF1078 domain protein  30.45 
 
 		 454 aa  177  3e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.593026  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3067  flagellar hook protein FlgE  31.24 
 
 		 413 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3351  flagellar hook protein FlgE  30.71 
 
 		 413 aa  177  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0269  flagellar hook protein FlgE  30.71 
 
 		 413 aa  177  4e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3328  flagellar hook protein FlgE  30.71 
 
 		 413 aa  177  4e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0465  flagellar hook protein FlgE  30.71 
 
 		 413 aa  177  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2096  flagellar hook protein FlgE  30.71 
 
 		 413 aa  177  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0281  flagellar hook protein FlgE  30.71 
 
 		 413 aa  177  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2997  flagellar hook protein FlgE  30.71 
 
 		 413 aa  177  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4297  flagellar hook protein FlgE  31 
 
 		 462 aa  176  8e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1684  hypothetical protein  30.78 
 
 		 417 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0577  fagellar hook-basal body protein  31.66 
 
 		 433 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1638  protein of unknown function DUF1078 domain protein  27.1 
 
 		 413 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.974664  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1015  fagellar hook-basal body protein  30.35 
 
 		 441 aa  174  3.9999999999999995e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1261  protein of unknown function DUF1078 domain protein  31.06 
 
 		 808 aa  171  3e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2566  protein of unknown function DUF1078 domain protein  32.16 
 
 		 428 aa  170  5e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1645  flagellar basal body FlaE  32.05 
 
 		 409 aa  169  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0752  flagellar hook protein FlgE  29.17 
 
 		 442 aa  168  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2932  flagellar hook protein FlgE  31.25 
 
 		 413 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1556  flagellar hook protein FlgE  31.12 
 
 		 405 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.460065  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50450  flagellar hook protein FlgE  29.76 
 
 		 462 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0277327 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0289  flagellar hook protein FlgE  28.93 
 
 		 442 aa  165  2.0000000000000002e-39  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0970  flagellar hook-basal body protein  30.71 
 
 		 408 aa  164  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4248  flagellar hook protein FlgE  28.21 
 
 		 443 aa  162  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564607 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2164  protein of unknown function DUF1078 domain protein  27.72 
 
 		 488 aa  162  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0858  flagellar hook protein  27.39 
 
 		 475 aa  162  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1634  flagellar hook protein FlgE  30.3 
 
 		 405 aa  161  3e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0243  flagellar hook protein FlgE  29.52 
 
 		 413 aa  160  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0566  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  28.85 
 
 		 426 aa  161  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0929  fagellar hook-basal body protein  29.74 
 
 		 408 aa  160  7e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2921  flagellar basal body FlaE domain protein  29.63 
 
 		 450 aa  158  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.926176  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3478  flagellar hook protein FlgE  31.17 
 
 		 442 aa  156  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1957  flagellar hook protein FlgE  28.71 
 
 		 410 aa  155  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1400  protein of unknown function DUF1078 domain protein  27.9 
 
 		 508 aa  155  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.153228  normal  0.872762 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0474  protein of unknown function DUF1078-like protein  29.75 
 
 		 440 aa  155  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000090236  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2426  flagellar basal body FlaE domain protein  28.54 
 
 		 410 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.594401 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3070  flagellar basal body and hook protein  29.68 
 
 		 420 aa  152  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2470  protein of unknown function DUF1078 domain protein  31.2 
 
 		 428 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1936  flagellar hook protein FlgE  31.65 
 
 		 441 aa  150  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4423  hypothetical protein  27.27 
 
 		 425 aa  150  7e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4196  flagellar basal body FlaE domain protein  30.34 
 
 		 404 aa  149  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3729  flagellar hook protein FlgE  28.99 
 
 		 451 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.293053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0688  hypothetical protein  27.63 
 
 		 461 aa  149  2.0000000000000003e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.714062  normal  0.621954 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2951  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  30.19 
 
 		 501 aa  148  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.431038 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0780  protein of unknown function DUF1078 domain protein  29.13 
 
 		 415 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2570  flagellar basal body FlaE domain protein  29.17 
 
 		 402 aa  145  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.494993  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1199  flagellar hook protein FlgE  28.97 
 
 		 402 aa  143  7e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2524  flagellar hook protein FlgE  28.97 
 
 		 402 aa  143  7e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.353481  hitchhiker  0.00930832 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2422  flagellar hook protein FlgE  27.86 
 
 		 428 aa  143  8e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.638743  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2001  flagellar hook protein FlgE  27.86 
 
 		 428 aa  143  8e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2321  flagellar hook protein FlgE  27.86 
 
 		 428 aa  143  8e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3247  flagellar hook protein FlgE  27.98 
 
 		 453 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2847  flagellar hook protein FlgE  28.37 
 
 		 438 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.111901 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1324  flagellar hook protein FlgE  27.59 
 
 		 453 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0596368 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1773  flagellar hook-basal body protein  29 
 
 		 418 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01072  flagellar hook protein E  29.11 
 
 		 401 aa  141  3e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1199  flagellar hook protein FlgE  29.11 
 
 		 401 aa  141  3e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1324  flagellar hook protein FlgE  29.64 
 
 		 406 aa  141  3e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2594  flagellar hook protein FlgE  28.24 
 
 		 453 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24030  Flagellar basal body rod protein  28.25 
 
 		 383 aa  140  3.9999999999999997e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0517  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  28.14 
 
 		 418 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1227  flagellar hook protein FlgE  27.45 
 
 		 437 aa  140  4.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1164  flagellar hook protein FlgE  28.68 
 
 		 459 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0402559  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5628  flagellar hook protein FlgE  29.22 
 
 		 417 aa  140  7e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2967  flagellar hook protein FlgE  28.32 
 
 		 407 aa  139  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4388  flagellar hook protein FlgE  26.53 
 
 		 440 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408667  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1419  flagellar hook protein FlgE  27.5 
 
 		 453 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3084  flagellar hook protein FlgE  27.38 
 
 		 454 aa  139  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.901085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2959  flagellar hook protein FlgE  27.5 
 
 		 453 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.270235  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3097  flagellar hook protein FlgE  27.5 
 
 		 453 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1455  flagellar hook protein FlgE  28.91 
 
 		 401 aa  139  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159718 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2375  hypothetical protein  29.45 
 
 		 425 aa  138  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1343  flagellar hook protein FlgE  27.97 
 
 		 453 aa  138  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3949  flagellar hook protein FlgE  27.49 
 
 		 440 aa  139  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1387  hypothetical protein  29.98 
 
 		 428 aa  138  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.457805  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1348  flagellar hook protein FlgE  28.43 
 
 		 453 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02925  flagellar hook protein FlgE  27.08 
 
 		 461 aa  137  4e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.308031  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1227  flagellar hook protein FlgE  27.27 
 
 		 437 aa  136  7.000000000000001e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3097  flagellar hook protein FlgE  27.5 
 
 		 458 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1600  flagellar hook protein FlgE  28.54 
 
 		 453 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.998442  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>