More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1728 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1728  ABC transporter related  100 
 
 		 277 aa  545  1e-154  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2457  ABC transporter related  50.2 
 
 		 264 aa  225  7e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.310276  normal  0.489928 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1086  ABC transporter related  47.57 
 
 		 222 aa  166  4e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.76035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1235  ABC transporter related  44.92 
 
 		 225 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1347  ABC transporter-related protein  45.11 
 
 		 222 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.652945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1310  ABC transporter related  48.35 
 
 		 222 aa  152  5e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1057  ATPase  46.77 
 
 		 223 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.583693  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0688  ABC transporter, ATP-binding protein  34.16 
 
 		 218 aa  128  8.000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.580982  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4667  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  37.64 
 
 		 225 aa  122  9e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1467  ABC transporter related protein  40.2 
 
 		 222 aa  120  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2291  ABC transporter related  41.58 
 
 		 255 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000398246 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  36.41 
 
 		 239 aa  116  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  38.86 
 
 		 233 aa  116  5e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00441  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  36.52 
 
 		 225 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00446  hypothetical protein  36.52 
 
 		 225 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2631  ABC transporter related  36.36 
 
 		 264 aa  115  7.999999999999999e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000448343  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0594  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  36.52 
 
 		 225 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.355686 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0529  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  36.52 
 
 		 225 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0440  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.79 
 
 		 506 aa  115  8.999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3120  ABC transporter related protein  36.52 
 
 		 225 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.981007  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0569  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  36.52 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0539  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  35.96 
 
 		 225 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3126  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  36.52 
 
 		 225 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000946354 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0425  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  36.52 
 
 		 225 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4174  cell division ATP-binding protein FtsE  39.71 
 
 		 222 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00105133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04961  ABC transporter ATP-binding protein  35.81 
 
 		 228 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2790  ABC transporter-like protein protein  35.45 
 
 		 260 aa  114  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04910  cell division ATP-binding protein FtsE  38.92 
 
 		 223 aa  113  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0953664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0595  ATPase  36.97 
 
 		 228 aa  113  4.0000000000000004e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0833962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1979  transporter  33.02 
 
 		 227 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38820  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  41.35 
 
 		 251 aa  112  5e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2350  ABC transporter related protein  35.78 
 
 		 220 aa  111  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575927  normal  0.731614 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  35.48 
 
 		 232 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1091  ABC transporter related  36.54 
 
 		 251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0974  ABC transporter, ATP-binding protein  35.05 
 
 		 250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0469  cell division ATP-binding protein FtsE  38.42 
 
 		 223 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.55028  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0836  peptide ABC transporter ATPase  35.15 
 
 		 251 aa  110  3e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.506405  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1805  ABC transporter related  38.58 
 
 		 259 aa  110  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1551  ABC transporter related protein  41.2 
 
 		 264 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.019793 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2812  ABC transporter related  41.49 
 
 		 260 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.844738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3788  ABC transporter related  41.1 
 
 		 290 aa  109  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0020  amino acid ABC transporter ATPase  36.92 
 
 		 256 aa  109  5e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.732673  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0933  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  32.66 
 
 		 212 aa  109  5e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000401651  normal  0.238349 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1362  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  41.15 
 
 		 580 aa  109  5e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5544  ABC transporter related  40.48 
 
 		 241 aa  109  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.635049 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0433  ATPase  33.95 
 
 		 228 aa  108  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.526748  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0549  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  35.8 
 
 		 225 aa  108  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  39.25 
 
 		 242 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0556  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  35.8 
 
 		 225 aa  108  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  39.05 
 
 		 715 aa  108  8.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2443  ABC transporter related  38.21 
 
 		 261 aa  108  8.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1342  ABC transporter related  38.39 
 
 		 243 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.494343 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2278  ABC transporter related  36.29 
 
 		 582 aa  108  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.682256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4759  ABC transporter related  35.33 
 
 		 219 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1549  ABC transporter related  32.73 
 
 		 613 aa  108  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0873918  normal  0.0393082 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2001  ABC transporter related  36.29 
 
 		 582 aa  108  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.201401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1792  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 		 233 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2051  peptide ABC transporter ATPase  36.53 
 
 		 229 aa  108  1e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04581  ABC transporter ATP-binding protein  34.26 
 
 		 228 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04891  ABC transporter ATP-binding protein  33.8 
 
 		 228 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.324822  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5083  ABC transporter, ATP-binding protein  35.39 
 
 		 219 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0610  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  35.23 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0551  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  35.23 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.522757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  35.24 
 
 		 236 aa  107  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2530  ABC transporter related  31.68 
 
 		 220 aa  107  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00573558  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2008  ABC-type transport system, ATPase component  38.83 
 
 		 253 aa  107  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00806638  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1767  ATPase  36.74 
 
 		 248 aa  107  2e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.132988  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0566  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  35.23 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2481  ABC transporter related  31.68 
 
 		 220 aa  107  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000539797  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06281  ABC transporter ATP-binding protein  34.89 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0807317 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1247  ABC transporter related protein  39.91 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0795163  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1837  ABC transporter related  36.87 
 
 		 228 aa  107  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000603885  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3863  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  37.2 
 
 		 736 aa  107  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.779093  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  38.59 
 
 		 242 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0123  ABC transporter related protein  38.97 
 
 		 265 aa  106  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0798  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  34.74 
 
 		 246 aa  106  4e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.205108  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0718  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.7 
 
 		 251 aa  106  5e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000110627  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4399  ABC transporter related  31.7 
 
 		 248 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.224888 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2304  ABC transporter related  35.85 
 
 		 360 aa  106  5e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.297775  normal  0.671211 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2076  ABC transporter related  39.63 
 
 		 241 aa  106  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.701263  normal  0.274442 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0276  cell division ATP-binding protein FtsE  36.71 
 
 		 229 aa  106  5e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000204562  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3478  ABC transporter related  37.9 
 
 		 242 aa  106  5e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18720  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  41.79 
 
 		 267 aa  105  6e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0202  cell division ATP-binding protein FtsE  35.45 
 
 		 231 aa  105  7e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000183823  decreased coverage  0.00000275574 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0428  cell division ATP-binding protein FtsE  37.81 
 
 		 223 aa  105  7e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1510  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  38.16 
 
 		 628 aa  105  7e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.639878 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  36.99 
 
 		 644 aa  105  7e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0252  Type II (General) Secretory Pathway (IISP) Family protein  37.55 
 
 		 222 aa  105  8e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4783  cell division protein FtsE  37.55 
 
 		 222 aa  105  8e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5078  ABC transporter, ATP-binding protein  34.83 
 
 		 219 aa  105  8e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3867  cell division protein FtsE  37.55 
 
 		 221 aa  105  8e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.508824  normal  0.0993887 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3859  cell division protein FtsE  37.55 
 
 		 222 aa  105  8e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3945  cell division protein FtsE  37.55 
 
 		 222 aa  105  8e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3746  cell division protein FtsE  37.55 
 
 		 222 aa  105  8e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1167  ABC transporter related  36.36 
 
 		 235 aa  105  9e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0533  ABC transporter related  39.88 
 
 		 226 aa  105  9e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1594  ABC transporter related  37.55 
 
 		 259 aa  105  9e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0972  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.56 
 
 		 251 aa  105  9e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000308614  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  38.28 
 
 		 254 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0970  ABC transporter related  33.04 
 
 		 241 aa  105  1e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>