134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1690 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_0246  polysaccharide export protein  75.73 
 
 
537 aa  802    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000856367  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1690  polysaccharide export protein  100 
 
 
558 aa  1105    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1826  polysaccharide export protein  58.69 
 
 
516 aa  592  1e-168  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.698968  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2584  polysaccharide export protein  48.88 
 
 
605 aa  478  1e-134  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  unclonable  0.0000240824 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001787  capsular polysaccharide export system periplasmic protein KpsD  44.29 
 
 
579 aa  409  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03058  capsular polysaccharide transport protein, putative  43.66 
 
 
609 aa  397  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.715854  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3241  polysaccharide export protein  42.28 
 
 
587 aa  394  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1307  polysaccharide export protein  42.75 
 
 
565 aa  394  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5952  polysaccharide export protein  41.06 
 
 
557 aa  359  7e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0621  KpsD protein  37.52 
 
 
606 aa  320  3e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.440749 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02816  KpsD protein  36.18 
 
 
558 aa  317  3e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000043482  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02766  hypothetical protein  36.18 
 
 
558 aa  317  3e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000332683  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3221  polysialic acid capsule transport protein KpsD  36.38 
 
 
558 aa  317  3e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.364488  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5729  polysialic acid transport protein KpsD  37.63 
 
 
606 aa  301  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4938  polysaccharide export protein  35 
 
 
603 aa  294  3e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0293  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  34.21 
 
 
552 aa  292  9e-78  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.994472  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1779  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  34.68 
 
 
552 aa  291  2e-77  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1618  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  34.88 
 
 
552 aa  290  6e-77  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1438  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  34.88 
 
 
552 aa  290  6e-77  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.473166  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1889  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  25.43 
 
 
576 aa  126  9e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.105703  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00687  hypothetical protein  27.21 
 
 
897 aa  93.6  8e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0660  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  25.65 
 
 
877 aa  92.8  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1399  polysaccharide export protein  32.09 
 
 
920 aa  93.6  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00159215  normal  0.0100644 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3035  polysaccharide export protein  31.96 
 
 
828 aa  93.2  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.636336  normal  0.407015 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3193  polysaccharide biosynthesis protein  31.44 
 
 
921 aa  92  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1470  polysaccharide export protein  31.96 
 
 
828 aa  92.8  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.270093  normal  0.749053 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0648  polysaccharide export protein  26.82 
 
 
779 aa  92.8  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0566  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  25.43 
 
 
800 aa  91.3  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1395  polysaccharide export protein  32.62 
 
 
931 aa  91.3  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0391429  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1959  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  25.22 
 
 
875 aa  91.3  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.940843  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2543  polysaccharide export protein  33.67 
 
 
919 aa  90.9  5e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.941823  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2184  polysaccharide export protein  34.04 
 
 
833 aa  90.5  8e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.243697  hitchhiker  0.000313767 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0794  polysaccharide export protein  27.53 
 
 
869 aa  89.7  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.020437  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2264  ClpX, ATPase regulatory subunit  31.31 
 
 
827 aa  88.2  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000642696  decreased coverage  0.000131264 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2236  polysaccharide export protein  34.72 
 
 
948 aa  88.6  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.987184  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2893  polysaccharide export protein  28.87 
 
 
912 aa  88.2  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.325033  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3032  polysaccharide export protein  26.32 
 
 
922 aa  88.2  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190653  normal  0.0184914 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2843  polysaccharide export protein  29.95 
 
 
910 aa  87  8e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427616  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1986  polysaccharide biosynthesis protein, putative  24.29 
 
 
877 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0277  polysaccharide export periplasmic protein  25.33 
 
 
869 aa  86.3  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1515  polysaccharide export protein  29.92 
 
 
869 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000317972  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1651  polysaccharide export protein  30.96 
 
 
915 aa  84.3  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.530434  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2671  polysaccharide export protein  25.37 
 
 
919 aa  84  0.000000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0888  polysaccharide export protein  32.77 
 
 
940 aa  84  0.000000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.434689  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3403  polysaccharide export protein  34.48 
 
 
977 aa  84  0.000000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00684592  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2606  polysaccharide export protein  34.81 
 
 
936 aa  83.6  0.000000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1714  polysaccharide export protein  29.73 
 
 
947 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.397648  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2732  polysaccharide export protein  27.37 
 
 
753 aa  82  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445544  normal  0.725394 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3062  polysaccharide export protein  32.61 
 
 
834 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0530  polysaccharide export protein  27.34 
 
 
1055 aa  81.6  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.925852 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1604  polysaccharide export protein  32.16 
 
 
952 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1842  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  35.83 
 
 
781 aa  80.9  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.749239  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3949  polysaccharide export protein  32.61 
 
 
823 aa  79.7  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.256427 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4937  polysaccharide export protein  30.19 
 
 
800 aa  76.6  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00100729  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2676  polysaccharide export protein  29.77 
 
 
849 aa  75.9  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1078  polysaccharide export protein  26.79 
 
 
830 aa  73.9  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2903  polysaccharide export protein  28.87 
 
 
828 aa  73.6  0.000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0690654  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3790  polysaccharide export protein  28.16 
 
 
803 aa  72.8  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0353  polysaccharide export protein  30.65 
 
 
830 aa  72.4  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.949664  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3645  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.57 
 
 
920 aa  72  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1375  polysaccharide export protein  28.87 
 
 
837 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193694  decreased coverage  0.0000028911 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1315  polysaccharide export protein  28.87 
 
 
837 aa  70.9  0.00000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0893778 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1382  polysaccharide export protein  28.87 
 
 
837 aa  70.9  0.00000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0473  polysaccharide export protein  29.89 
 
 
824 aa  68.9  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1345  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  25.29 
 
 
568 aa  68.2  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000291611 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2568  Soluble ligand binding domain protein  27.3 
 
 
812 aa  66.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171347  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2769  polysaccharide export protein  25.72 
 
 
846 aa  65.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.594167 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0763  polysaccharide export protein  24.57 
 
 
852 aa  64.3  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00148481  normal  0.528442 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1576  ClpX, ATPase regulatory subunit  27.94 
 
 
833 aa  62.4  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000033468  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003530  polysaccharide export periplasmic protein  23.55 
 
 
700 aa  59.7  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1013  hypothetical protein  27.17 
 
 
191 aa  58.2  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.528873  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4531  polysaccharide export protein  30.13 
 
 
208 aa  58.5  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4605  polysaccharide export protein  31.25 
 
 
791 aa  57.8  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.321524  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1061  polysaccharide export protein  30.72 
 
 
478 aa  56.2  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0167243  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  30 
 
 
473 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1508  polysaccharide export protein  27.27 
 
 
495 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2513  polysaccharide export protein  30.52 
 
 
454 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2678  polysaccharide export protein  28.64 
 
 
347 aa  54.7  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1535  polysaccharide export protein  27.27 
 
 
495 aa  55.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.106975 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3593  polysaccharide export protein  30.52 
 
 
384 aa  55.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0310  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.53 
 
 
703 aa  54.7  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02231  hypothetical protein  28.11 
 
 
700 aa  54.3  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1156  polysaccharide export protein  28.65 
 
 
187 aa  53.9  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508119  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0791  polysaccharide export protein  30.34 
 
 
216 aa  53.9  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.22146  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4708  polysaccharide export protein  27.74 
 
 
219 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655126  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1429  polysaccharide export protein  22.58 
 
 
435 aa  51.2  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5320  polysaccharide export protein  29.81 
 
 
213 aa  51.6  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.884665  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2909  polysaccharide export protein  35.97 
 
 
446 aa  50.8  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723004  hitchhiker  0.000339784 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  29.91 
 
 
205 aa  50.8  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3135  polysaccharide export protein  30.33 
 
 
459 aa  50.4  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.248104  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5609  polysaccharide export protein  29.91 
 
 
419 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01391  exopolysaccharide xanthan biosynthesis export protein GumB  26.27 
 
 
232 aa  49.7  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3126  polysaccharide export protein  28.81 
 
 
185 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4940  polysaccharide export protein  29.11 
 
 
247 aa  49.7  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.89418 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2696  polysaccharide export protein  29.03 
 
 
196 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.975578 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7871  hypothetical protein  27.43 
 
 
238 aa  48.9  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2730  polysaccharide export protein  29.94 
 
 
185 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4037  polysaccharide export protein  28.83 
 
 
235 aa  48.1  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2590  polysaccharide export protein  29.94 
 
 
185 aa  47.8  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2464  polysaccharide export protein  27.22 
 
 
235 aa  47.8  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.719315  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>