91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1655 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1655  phage major capsid protein, HK97 family  100 
 
 		 406 aa  829    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0867  HK97 family phage major capsid protein  80.54 
 
 		 407 aa  689    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.887226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2266  phage major capsid protein, HK97 family  50.86 
 
 		 401 aa  388  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000739522 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2263  phage major capsid protein, HK97 family  50.86 
 
 		 401 aa  388  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0574985 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1190  HK97 family phage major capsid protein  50.37 
 
 		 401 aa  383  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000012399 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0906  HK97 family phage major capsid protein  46.21 
 
 		 435 aa  362  6e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.225289  normal  0.497938 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3913  HK97 family phage major capsid protein  46.85 
 
 		 408 aa  339  5e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.511324  normal  0.0176262 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1705  phage major capsid protein, HK97 family  43.28 
 
 		 421 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.154021  normal  0.125329 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1427  phage major capsid protein, HK97 family  43.53 
 
 		 421 aa  335  9e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.370183 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1970  phage major capsid protein, HK97  46.29 
 
 		 431 aa  330  3e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.141118  normal  0.540615 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1805  phage major capsid protein, HK97  45.69 
 
 		 416 aa  328  9e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.539863  normal  0.129536 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1999  phage major capsid protein, HK97  51.56 
 
 		 380 aa  328  9e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00431544 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6186  phage major capsid protein HK97 family  42.93 
 
 		 471 aa  328  9e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.423125  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1415  phage major capsid protein, HK97  45.2 
 
 		 417 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3155  HK97 family phage major capsid protein  45.96 
 
 		 428 aa  323  4e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0231727  normal  0.0147808 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1431  HK97 family phage major capsid protein  43.53 
 
 		 421 aa  323  4e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.263231 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1167  Phage major capsid protein, HK97  44.42 
 
 		 417 aa  322  7e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1542  Phage major capsid protein, HK97  44.82 
 
 		 419 aa  322  9.999999999999999e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1047  HK97 family phage major capsid protein  45.05 
 
 		 441 aa  319  5e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144894  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0922  HK97 family phage major capsid protein  44.9 
 
 		 403 aa  318  1e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.255185 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3867  HK97 family phage major capsid protein  43.7 
 
 		 425 aa  316  5e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292858 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3122  phage major capsid protein, HK97  46.2 
 
 		 380 aa  315  6e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1338  phage major capsid protein HK97 family  46.37 
 
 		 420 aa  315  9e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0373474  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4965  HK97 family phage major capsid protein  41.03 
 
 		 430 aa  308  9e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154569 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2096  phage major capsid protein, HK97 family  42.26 
 
 		 418 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.225363  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3481  Phage major capsid protein, HK97  44.02 
 
 		 417 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.137838  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0589  HK97 family major capsid protein  46.08 
 
 		 424 aa  295  1e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2500  phage major capsid protein, HK97 family  40.74 
 
 		 416 aa  284  3.0000000000000004e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00454127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2174  putative phage major capsid protein  39.89 
 
 		 405 aa  258  2e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2898  HK97 family phage major capsid protein  37.98 
 
 		 388 aa  254  2.0000000000000002e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.593833  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0540  putative major capsid protein  36.94 
 
 		 388 aa  246  4e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.272419 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3709  HK97 family phage major capsid protein  35.25 
 
 		 450 aa  245  9.999999999999999e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1061  phage major capsid protein, HK97  37.5 
 
 		 398 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0887541 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1635  phage major capsid protein, HK97  38.52 
 
 		 393 aa  239  6.999999999999999e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.304591  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1078  HK97 family phage major capsid protein  40.41 
 
 		 387 aa  236  7e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.506947 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1133  HK97 family phage major capsid protein  41.03 
 
 		 387 aa  232  8.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2471  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  40.73 
 
 		 398 aa  230  3e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0951  HK97 family phage major capsid protein  36.25 
 
 		 389 aa  229  7e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0458  HK97 family phage major capsid protein  31.1 
 
 		 399 aa  207  3e-52  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.830326  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1895  HK97 family phage major capsid protein  34.72 
 
 		 389 aa  204  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0861  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  33.92 
 
 		 403 aa  202  6e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.456659  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3980  phage major capsid protein, HK97 family  35.28 
 
 		 382 aa  199  9e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2025  phage major capsid protein, HK97  33.84 
 
 		 382 aa  195  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.848367  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0337  phage major capsid protein, HK97  33.84 
 
 		 382 aa  195  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.139658  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0644  HK97 family phage major capsid protein  32.85 
 
 		 379 aa  194  3e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146587 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0795  HK97 family phage major capsid protein  32.84 
 
 		 379 aa  193  4e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1719  phage major capsid protein, HK97  33.6 
 
 		 384 aa  186  9e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0256  HK97 family phage major capsid protein  30.05 
 
 		 382 aa  182  1e-44  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0170854  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0830  HK97 family phage major capsid protein  29.63 
 
 		 383 aa  178  2e-43  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1334  HK97 family phage major capsid protein  30.8 
 
 		 424 aa  177  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.280266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1359  HK97 family phage major capsid protein  31.3 
 
 		 385 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.504084  normal  0.308637 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5467  hypothetical protein  30.96 
 
 		 386 aa  169  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2358  phage phi-C31 gp36-like protein /HK97 family major capsid protein  33.42 
 
 		 420 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172606  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0277  HK97 family phage major capsid protein  30.96 
 
 		 385 aa  166  9e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1482  Phage major capsid protein, HK97  31.89 
 
 		 385 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.353157 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1625  Phage major capsid protein, HK97  31.89 
 
 		 385 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.490763  normal  0.450118 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2489  phage major capsid protein, HK97  30.9 
 
 		 390 aa  161  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0466  HK97 family phage major capsid protein  29.02 
 
 		 369 aa  157  3e-37  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1628  HK97 family phage major capsid protein  30.27 
 
 		 400 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0400  HK97 family phage major capsid protein  28.35 
 
 		 397 aa  145  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2834  phage major capsid protein, HK97 family  28.35 
 
 		 397 aa  144  4e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.174812  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1254  HK97 family phage major capsid protein  28.1 
 
 		 399 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1485  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  27.01 
 
 		 392 aa  122  9e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1085  HK97 family major capsid protein  26.39 
 
 		 405 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1022  phage major capsid protein, HK97 family  29.97 
 
 		 411 aa  106  9e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7329  phage major capsid protein, HK97 family  25.98 
 
 		 417 aa  96.7  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3970  HK97 family phage major capsid protein  26.4 
 
 		 413 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.33538 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0875  phage capsid family protein  25.17 
 
 		 315 aa  90.9  3e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2995  phage major capsid protein, gp36  25.92 
 
 		 369 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.100977  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2271  phage major capsid protein, HK97 family  23.37 
 
 		 427 aa  84.7  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1695  phage major capsid protein, HK97 family  23.37 
 
 		 427 aa  84.7  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1466  HK97 family phage major capsid protein  24.3 
 
 		 312 aa  85.5  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000392324  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1311  phage major capsid protein, HK97 family  23.37 
 
 		 427 aa  84.7  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0852  major capsid protein, HK97 family  22.76 
 
 		 386 aa  77.4  0.0000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0590991  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3486  HK97 family phage major capsid protein  23.46 
 
 		 394 aa  76.6  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1970  major capsid-like protein  24.45 
 
 		 425 aa  75.5  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.244233  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1458  HK97 family major capsid protein  21.2 
 
 		 388 aa  74.7  0.000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.90039  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1086  HK97 family phage major capsid protein  23.14 
 
 		 400 aa  64.3  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12666  phiRv2 prophage protein  27.33 
 
 		 479 aa  62  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.5272e-17  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2179  phage major capsid protein, HK97 family  26.97 
 
 		 373 aa  60.1  0.00000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5360  HK97 family phage major capsid protein  27.35 
 
 		 346 aa  53.9  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3313  phage major capsid protein, HK97 family  23.12 
 
 		 562 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533544 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4981  HK97 family phage major capsid protein  27.35 
 
 		 359 aa  53.9  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4253  phage major capsid protein, HK97 family  23.53 
 
 		 440 aa  53.5  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3898  major capsid protein HK97  28.02 
 
 		 279 aa  53.1  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2598  HK97 family phage major capsid protein  21.95 
 
 		 409 aa  52.8  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00517058 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1684  phage phi-C31 GP36-like protein  23.88 
 
 		 412 aa  52.8  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.885456 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1998  phage major capsid protein, HK97 family  23.29 
 
 		 438 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1114  HK97 family phage major capsid protein  22.99 
 
 		 391 aa  47  0.0006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2015  putative phage-related protein  26.42 
 
 		 446 aa  43.9  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0608266 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3877  hypothetical protein  26.23 
 
 		 490 aa  43.1  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0282142 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>