More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1582 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1582  inner-membrane translocator  100 
 
 		 313 aa  616  1e-175  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0312  inner-membrane translocator  51.13 
 
 		 326 aa  306  3e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.950676  normal  0.481983 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2007  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  39.04 
 
 		 357 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551976  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1532  inner-membrane translocator  37.39 
 
 		 368 aa  208  7e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.378741  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1437  inner-membrane translocator  37.39 
 
 		 368 aa  208  7e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2283  inner-membrane translocator  39.74 
 
 		 318 aa  204  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1453  inner-membrane translocator  35.53 
 
 		 366 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.230295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1618  ABC transporter related  38.02 
 
 		 616 aa  194  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.103337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1663  inner-membrane translocator  37.26 
 
 		 326 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3618  inner-membrane translocator  36.53 
 
 		 328 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.466346  normal  0.345258 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1849  inner-membrane translocator  36.48 
 
 		 328 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.200349 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0851  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  38.59 
 
 		 333 aa  189  5.999999999999999e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.589569  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2426  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  36.92 
 
 		 368 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1950  inner-membrane translocator  36.27 
 
 		 328 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1828  inner-membrane translocator  37 
 
 		 331 aa  186  4e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000769607  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1090  inner-membrane translocator  37.27 
 
 		 359 aa  182  6e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.538994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0897  inner-membrane translocator  39.41 
 
 		 357 aa  182  8.000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2886  putative ABC transporter permiase component  37.33 
 
 		 334 aa  182  8.000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0441971 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3750  ABC transporter related  37.15 
 
 		 603 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408417  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1708  inner-membrane translocator  35.71 
 
 		 348 aa  177  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.550604  normal  0.0112984 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2301  inner-membrane translocator  37.04 
 
 		 328 aa  177  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.281867 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1500  inner-membrane translocator  38.05 
 
 		 336 aa  176  4e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.101712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0006  inner-membrane translocator  35.5 
 
 		 344 aa  176  6e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.273042  hitchhiker  0.0000215345 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1100  inner-membrane translocator  35.87 
 
 		 343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0111942  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2128  inner-membrane translocator  38.25 
 
 		 344 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212047  normal  0.208516 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0337  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.87 
 
 		 609 aa  173  2.9999999999999996e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1564  inner-membrane translocator  34.48 
 
 		 339 aa  155  8e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0143  inner-membrane translocator  33.76 
 
 		 311 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1679  inner-membrane translocator  33.21 
 
 		 317 aa  154  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0835  inner-membrane translocator  31.83 
 
 		 335 aa  151  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0400978  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0221  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  35.76 
 
 		 328 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3820  inner-membrane translocator  34.31 
 
 		 328 aa  150  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0270491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2587  inner-membrane translocator  35.13 
 
 		 317 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.629922  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1929  inner-membrane translocator  34.49 
 
 		 318 aa  146  5e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.456236  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2365  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.17 
 
 		 339 aa  144  2e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.554509  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0361  inner-membrane translocator  35.5 
 
 		 333 aa  144  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3519  ABC transporter related  33.33 
 
 		 643 aa  144  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.971696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4055  ABC transporter related  32.04 
 
 		 663 aa  143  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0357  ABC transporter related  31.75 
 
 		 643 aa  142  6e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0913  ABC transporter related  31.82 
 
 		 646 aa  142  8e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1863  inner-membrane translocator  32.06 
 
 		 321 aa  142  8e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1850  inner-membrane translocator  33.57 
 
 		 340 aa  142  8e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.2267  normal  0.119632 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1480  inner-membrane translocator  32.46 
 
 		 407 aa  142  8e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3838  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 315 aa  142  8e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.242692  normal  0.204744 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4441  ABC transporter related  32.77 
 
 		 603 aa  141  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0801  inner-membrane translocator  32.99 
 
 		 326 aa  141  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.950338 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5993  putative branched-chain amino acid ABC transporter (permease protein)  35.45 
 
 		 323 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.329288  normal  0.170989 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1652  inner-membrane translocator  33.57 
 
 		 336 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3708  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  31.44 
 
 		 646 aa  140  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.400523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1906  inner-membrane translocator  34.49 
 
 		 326 aa  140  3.9999999999999997e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.257462 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2395  inner-membrane translocator  32.67 
 
 		 407 aa  139  6e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0670  inner-membrane translocator  33.44 
 
 		 335 aa  139  6e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2128  inner-membrane translocator  29.87 
 
 		 337 aa  139  7e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3688  inner-membrane translocator  32.88 
 
 		 330 aa  139  8.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3103  inner-membrane translocator  35.5 
 
 		 354 aa  138  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3659  inner-membrane translocator  29.43 
 
 		 341 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2609  inner-membrane translocator  31.12 
 
 		 415 aa  136  4e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0997  inner-membrane translocator  34.25 
 
 		 321 aa  136  4e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.915307  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1140  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 328 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.129861 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3398  inner-membrane translocator  32.11 
 
 		 335 aa  135  9e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0288037 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1673  inner-membrane translocator  31.63 
 
 		 319 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1944  inner-membrane translocator  30.47 
 
 		 297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0794  inner-membrane translocator  34.09 
 
 		 327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.605525  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4071  inner-membrane translocator  32.31 
 
 		 327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0610  ABC transporter related  33.45 
 
 		 647 aa  134  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0261  inner-membrane translocator  30.92 
 
 		 324 aa  134  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  31.58 
 
 		 562 aa  133  3.9999999999999996e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1407  inner-membrane translocator  30.94 
 
 		 332 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.14353  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2363  inner-membrane translocator  33.12 
 
 		 325 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0322104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2167  inner-membrane translocator  32.15 
 
 		 325 aa  133  3.9999999999999996e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.87 
 
 		 307 aa  132  6e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1259  inner-membrane translocator  33.55 
 
 		 357 aa  132  6e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1386  inner-membrane translocator  31.38 
 
 		 312 aa  132  7.999999999999999e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0999  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  32.79 
 
 		 328 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.203493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0863  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  31.87 
 
 		 334 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0562534  normal  0.217688 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1079  inner-membrane translocator  31.86 
 
 		 333 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.710188  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3647  inner-membrane translocator  31.95 
 
 		 315 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0606167  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0065  inner-membrane translocator  36.86 
 
 		 282 aa  130  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.123483 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1602  inner-membrane translocator  33.96 
 
 		 336 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.47347  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1821  inner-membrane translocator  29.87 
 
 		 328 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2187  inner-membrane translocator  33.21 
 
 		 320 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0512  inner-membrane translocator  31.62 
 
 		 307 aa  129  4.0000000000000003e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0951798  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4183  inner-membrane translocator  29.85 
 
 		 358 aa  129  5.0000000000000004e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.708738  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6000  branched-chain amino acid transport system permease protein  33.11 
 
 		 321 aa  129  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108703  normal  0.0256137 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0406  inner-membrane translocator  32.99 
 
 		 327 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0311713  normal  0.305027 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0567  inner-membrane translocator  30.47 
 
 		 443 aa  129  9.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.856247  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1424  inner-membrane translocator  35.25 
 
 		 381 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132982  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1732  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.23 
 
 		 326 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2040  inner-membrane translocator  32.6 
 
 		 320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000437253 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5835  inner-membrane translocator  33.75 
 
 		 344 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.825187  hitchhiker  0.0031354 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6116  branched chain amino acid ABC transporter permease  33.22 
 
 		 332 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.661138  normal  0.287958 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1482  inner-membrane translocator  32.32 
 
 		 360 aa  127  3e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2500  inner-membrane translocator  32.76 
 
 		 407 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.62609  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0297  ABC transporter related  29.54 
 
 		 682 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.963057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0828  inner-membrane translocator  30.25 
 
 		 350 aa  126  5e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5694  inner-membrane translocator  34.11 
 
 		 348 aa  125  6e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00469436 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2238  inner-membrane translocator  35.66 
 
 		 326 aa  125  7e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1836  ABC transporter related  33.33 
 
 		 648 aa  125  7e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0483035  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1097  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.66 
 
 		 315 aa  125  7e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.701299  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2501  inner-membrane translocator  28.09 
 
 		 345 aa  125  9e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>