More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1526 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1526  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  100 
 
 
415 aa  797    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2508  chromate transporter  56.48 
 
 
450 aa  370  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  28.25 
 
 
420 aa  157  3e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  27.63 
 
 
416 aa  151  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1321  chromate transporter  29.74 
 
 
379 aa  136  6.0000000000000005e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2826  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.01 
 
 
382 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1126  Chromate transporter  37.43 
 
 
183 aa  134  3e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3318  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.94 
 
 
393 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.966219 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0066  chromate transporter  30.28 
 
 
382 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2332  putative chromate transport protein  33.66 
 
 
417 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00115086  normal  0.80205 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0092  chromate transporter  30.12 
 
 
428 aa  128  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0390  chromate transporter  31.25 
 
 
383 aa  127  5e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.780475  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5157  chromate transporter  29.57 
 
 
456 aa  126  6e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3384  chromate transporter  28.18 
 
 
456 aa  126  9e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295991 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1449  chromate transporter  29.16 
 
 
428 aa  125  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0728  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.23 
 
 
387 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.318998  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2663  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.22 
 
 
386 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000135911  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3191  chromate transporter  27.59 
 
 
483 aa  121  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5828  chromate transport protein chrA  28.87 
 
 
463 aa  120  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.42625  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1226  chromate transporter  29.86 
 
 
418 aa  120  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0699  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.24 
 
 
387 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2144  chromate transporter  27.61 
 
 
447 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2247  chromate transporter  28.04 
 
 
453 aa  120  6e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0538278  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2804  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.71 
 
 
470 aa  119  9e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2447  chromate transporter  29.46 
 
 
397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2460  chromate transporter  31.88 
 
 
388 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000403685 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0957  chromate transporter  34.47 
 
 
392 aa  116  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.29904  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3911  chromate transporter  28.57 
 
 
388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00929243  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5873  chromate transporter  30.54 
 
 
403 aa  113  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201334  normal  0.305808 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2178  chromate transporter  32.79 
 
 
415 aa  113  6e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.177453  normal  0.0225164 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3048  chromate transporter  26.39 
 
 
393 aa  113  7.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2855  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  25.83 
 
 
404 aa  113  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1127  Chromate transporter  42.19 
 
 
153 aa  113  8.000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6202  chromate transporter  29.7 
 
 
401 aa  113  8.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0320947 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2674  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.88 
 
 
441 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2503  chromate transporter  30.94 
 
 
399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.124594 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2590  chromate transporter  31.02 
 
 
425 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.215414  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2556  chromate transporter  29.97 
 
 
450 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0100116 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2467  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.01 
 
 
391 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2526  CHR transporter  30.31 
 
 
445 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0450  chromate transporter  29.85 
 
 
456 aa  111  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1239  chromate transporter  28.29 
 
 
442 aa  110  3e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.132611  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1563  chromate resistance transport protein  29.94 
 
 
396 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3583  chromate transporter  28.72 
 
 
460 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.35339  normal  0.0786793 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0084  chromate ion transporter protein ChrA  29.94 
 
 
396 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0067  chromate ion transporter protein ChrA  29.94 
 
 
396 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3947  chromate transporter, chromate ion transporter family  26.88 
 
 
389 aa  110  6e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.222583  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1601  chromate transporter  27.12 
 
 
443 aa  109  8.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.646731  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6162  chromate transporter  29.09 
 
 
466 aa  109  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3555  chromate transporter  28.17 
 
 
454 aa  108  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3198  chromate transporter  29.68 
 
 
392 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0081  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.15 
 
 
450 aa  108  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.826612 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4665  putative chromate transporter  26.58 
 
 
463 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154177  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4194  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.86 
 
 
469 aa  108  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48511  predicted protein  25.82 
 
 
493 aa  107  4e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2237  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.21 
 
 
469 aa  107  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3159  chromate transporter  29.84 
 
 
450 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896141  normal  0.125861 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1753  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.83 
 
 
467 aa  107  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5053  chromate transporter  29.39 
 
 
392 aa  107  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568452  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3865  chromate transporter  28.79 
 
 
390 aa  106  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1521  chromate transporter  27.65 
 
 
401 aa  106  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404287  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1633  chromate transporter  28.37 
 
 
432 aa  106  8e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3638  chromate transporter  31.01 
 
 
431 aa  105  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46355  normal  0.675394 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6097  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.86 
 
 
469 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5371  chromate ion transporter  27.35 
 
 
393 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2155  chromate transporter, permease component  27.33 
 
 
385 aa  105  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3574  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.26 
 
 
390 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.851055 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3251  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.5 
 
 
390 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5759  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.66 
 
 
457 aa  105  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.628575  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1891  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.76 
 
 
469 aa  105  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.861826 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2282  chromate efflux pump, ChrA  34.74 
 
 
392 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.122338  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2679  chromate transporter  28.49 
 
 
443 aa  105  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4365  chromate transporter  24.69 
 
 
455 aa  105  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.6524  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0742  chromate transporter  31.23 
 
 
461 aa  104  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1206  chromate transporter  29.46 
 
 
398 aa  104  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.405124  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1382  chromate transporter  28.05 
 
 
376 aa  104  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237324  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0073  chromate resistance transport protein  30.16 
 
 
396 aa  104  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0555  chromate transporter  28.27 
 
 
401 aa  103  6e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0311274 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4327  chromate transporter  28.61 
 
 
444 aa  103  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.685407 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2389  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.45 
 
 
473 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.443126  normal  0.934205 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1938  chromate transporter  30.2 
 
 
430 aa  102  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.275877  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5139  chromate transporter  29.45 
 
 
394 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.396318  normal  0.758776 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0797  chromate transporter  30.48 
 
 
451 aa  102  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.755683 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1475  chromate transporter  27.53 
 
 
467 aa  102  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.215191 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43910  Chromate transporter  26.79 
 
 
453 aa  102  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1474  chromate transporter  28.89 
 
 
346 aa  102  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0927755  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4416  chromate transporter  24.39 
 
 
376 aa  102  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0139  chromate transporter  31.41 
 
 
462 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4579  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.15 
 
 
379 aa  102  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3820  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.49 
 
 
395 aa  101  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0284197  normal  0.135489 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1699  chromate transporter  26.15 
 
 
392 aa  101  3e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2622  chromate transporter  26.15 
 
 
393 aa  101  3e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4736  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.88 
 
 
471 aa  100  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3060  chromate transporter  27.93 
 
 
449 aa  100  6e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.904181  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2241  chromate transporter  31.56 
 
 
401 aa  99.8  8e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.132853  hitchhiker  0.00439089 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0890  chromate transporter  28.74 
 
 
402 aa  99.8  8e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4100  chromate transporter  29.8 
 
 
454 aa  99.8  9e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.343432 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2441  chromate transporter  29.6 
 
 
404 aa  98.2  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0729076  normal  0.1199 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4177  chromate transporter  35.33 
 
 
208 aa  98.2  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639548  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0802  chromate transporter  29.89 
 
 
402 aa  98.2  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>