49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1502 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1502  protein of unknown function DUF330  100 
 
 		 247 aa  484  1e-136  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2345  putative lipoprotein  38.46 
 
 		 211 aa  135  9e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.623027  normal  0.0122599 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0521  protein of unknown function DUF330  30.24 
 
 		 213 aa  98.6  8e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.67807  normal  0.409639 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4116  hypothetical protein  32.82 
 
 		 213 aa  90.1  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0330836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2812  hypothetical protein  32.42 
 
 		 201 aa  88.2  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.882153  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1486  hypothetical protein  32.42 
 
 		 201 aa  87.8  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.287305 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1896  hypothetical protein  28.57 
 
 		 204 aa  87.8  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2515  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  32.5 
 
 		 228 aa  85.1  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0198377  normal  0.0124768 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03180  lipoprotein, putative  29.72 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.3551  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1717  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  36.23 
 
 		 201 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.230459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1912  putative lipoprotein  29.44 
 
 		 214 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0370  hypothetical protein  31.46 
 
 		 199 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22650  putative ABC-type uncharacterized transport system  31.46 
 
 		 214 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248211 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1543  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like  29.23 
 
 		 228 aa  78.2  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0904417  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2192  protein of unknown function DUF330  27.57 
 
 		 203 aa  77  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0373997  normal  0.146853 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0625  hypothetical protein  26 
 
 		 213 aa  74.7  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.289104  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1955  hypothetical protein  30.05 
 
 		 192 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.109853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0576  putative secreted protein  26 
 
 		 213 aa  75.1  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04750  hypothetical protein  29.08 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1157  protein of unknown function DUF330  30.61 
 
 		 247 aa  73.2  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2110  lipoprotein  28.43 
 
 		 209 aa  72  0.000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.214262  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1981  putative ABC transporter protein  26.64 
 
 		 203 aa  72  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00566413  normal  0.786267 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3671  hypothetical protein  33.68 
 
 		 198 aa  71.2  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.228354 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3498  hypothetical protein  26.26 
 
 		 378 aa  71.6  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.252503 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2001  hypothetical protein  32.37 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4715  Mammalian cell entry related domain protein  26.28 
 
 		 398 aa  68.9  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324726  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1551  hypothetical protein  27.83 
 
 		 204 aa  68.6  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0315787  normal  0.155463 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0989  putative lipoprotein  27.09 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1022  putative lipoprotein  27.09 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1375  hypothetical protein  28.12 
 
 		 390 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1355  hypothetical protein  29.94 
 
 		 390 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1194  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like  28.28 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.907024  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5748  ABC transporter substrate-binding protein  29.61 
 
 		 367 aa  62  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.588091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2047  hypothetical protein  27.92 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.665979 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0155  lipoprotein  24.86 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.941075 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0157  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  24.43 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5088  hypothetical protein  23.86 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.33903  normal  0.0631023 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0040  putative lipoprotein  25.56 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236399  normal  0.184271 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1923  hypothetical protein  28.39 
 
 		 369 aa  57.4  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.743497  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2804  protein of unknown function DUF330  31.16 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0854  protein of unknown function DUF330  29.6 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.251206  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0894  hypothetical protein  29.6 
 
 		 207 aa  57  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.749992 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2314  hypothetical protein  27.23 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1842  putative ABC-type uncharacterized transport system  32.76 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4041  hypothetical protein  29.52 
 
 		 367 aa  55.1  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.474065  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0139  putative lipoprotein  25.33 
 
 		 211 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.646492 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0820  protein of unknown function DUF330  28 
 
 		 207 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.24879 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4936  hypothetical protein  28.32 
 
 		 198 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4964  protein of unknown function DUF330  29.2 
 
 		 200 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>