More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1468 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0095  adenylosuccinate lyase  73.84 
 
 		 436 aa  654    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3102  adenylosuccinate lyase  73.32 
 
 		 436 aa  670    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.611529  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3011  adenylosuccinate lyase  80.93 
 
 		 431 aa  739    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.367246  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2464  adenylosuccinate lyase  70.7 
 
 		 438 aa  659    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.495777  hitchhiker  0.00480262 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0426  adenylosuccinate lyase  83.72 
 
 		 430 aa  764    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1468  adenylosuccinate lyase  100 
 
 		 432 aa  889    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0660  adenylosuccinate lyase  59.86 
 
 		 437 aa  521  1e-146  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0610462  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0255  adenylosuccinate lyase  55.61 
 
 		 431 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00422824  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0319  adenylosuccinate lyase  54.88 
 
 		 435 aa  508  1e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0363  adenylosuccinate lyase  54.88 
 
 		 435 aa  508  1e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0336  adenylosuccinate lyase  54.65 
 
 		 435 aa  508  1e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4984  adenylosuccinate lyase  54.65 
 
 		 435 aa  508  1e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0277  adenylosuccinate lyase  54.65 
 
 		 435 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.351809  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0262  adenylosuccinate lyase  54.65 
 
 		 435 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0265  adenylosuccinate lyase  54.42 
 
 		 435 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0631795  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0271  adenylosuccinate lyase  54.19 
 
 		 435 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0290  adenylosuccinate lyase  54.65 
 
 		 435 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2333  adenylosuccinate lyase  56.05 
 
 		 431 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.943471  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0322  adenylosuccinate lyase  54.65 
 
 		 435 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1887  adenylosuccinate lyase  55.81 
 
 		 431 aa  503  1e-141  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0269  adenylosuccinate lyase  54.42 
 
 		 433 aa  504  1e-141  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1131  adenylosuccinate lyase  55.14 
 
 		 431 aa  499  1e-140  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1943  adenylosuccinate lyase  55.81 
 
 		 431 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0393  adenylosuccinate lyase  55.35 
 
 		 430 aa  491  9.999999999999999e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.623936  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1632  adenylosuccinate lyase  55.35 
 
 		 431 aa  489  1e-137  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328122  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2370  adenylosuccinate lyase  54.19 
 
 		 430 aa  489  1e-137  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0307  adenylosuccinate lyase  56.05 
 
 		 430 aa  489  1e-137  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.141521  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2151  adenylosuccinate lyase  54.67 
 
 		 431 aa  491  1e-137  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0064  adenylosuccinate lyase  53.04 
 
 		 432 aa  489  1e-137  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2695  adenylosuccinate lyase  54.19 
 
 		 431 aa  486  1e-136  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0303486  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2064  adenylosuccinate lyase  53.95 
 
 		 431 aa  486  1e-136  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2052  adenylosuccinate lyase  55.27 
 
 		 431 aa  486  1e-136  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0154529  normal  0.110523 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1145  adenylosuccinate lyase  54.42 
 
 		 431 aa  487  1e-136  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0729  adenylosuccinate lyase  53.95 
 
 		 430 aa  482  1e-135  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0047  adenylosuccinate lyase  52.8 
 
 		 432 aa  478  1e-134  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.727181  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1473  adenylosuccinate lyase  53.74 
 
 		 431 aa  481  1e-134  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1997  adenylosuccinate lyase  51.52 
 
 		 431 aa  474  1e-133  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.035377  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1963  adenylosuccinate lyase  51.52 
 
 		 431 aa  474  1e-133  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.739677  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2128  adenylosuccinate lyase  54.27 
 
 		 435 aa  476  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113953 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1446  adenylosuccinate lyase  51.29 
 
 		 431 aa  474  1e-132  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.149725  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1921  adenylosuccinate lyase  53.79 
 
 		 435 aa  473  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0716  adenylosuccinate lyase  54.25 
 
 		 437 aa  472  1e-132  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2952  adenylosuccinate lyase  52.9 
 
 		 431 aa  473  1e-132  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.582746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2417  adenylosuccinate lyase  52.66 
 
 		 433 aa  469  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.12659  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2272  adenylosuccinate lyase  53.58 
 
 		 434 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.147267 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1990  adenylosuccinate lyase  56.64 
 
 		 435 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.246521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0819  adenylosuccinate lyase  51.26 
 
 		 438 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2356  adenylosuccinate lyase  56.64 
 
 		 435 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2597  adenylosuccinate lyase  52.53 
 
 		 445 aa  466  9.999999999999999e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.323829  normal  0.23611 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1804  adenylosuccinate lyase  51.05 
 
 		 431 aa  466  9.999999999999999e-131  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000252731  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1237  adenylosuccinate lyase  55.35 
 
 		 439 aa  462  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1285  adenylosuccinate lyase  54.25 
 
 		 435 aa  464  1e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.348183  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2377  adenylosuccinate lyase  52.66 
 
 		 433 aa  464  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1148  adenylosuccinate lyase  54.69 
 
 		 439 aa  458  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.64996  normal  0.297095 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2682  adenylosuccinate lyase  54.02 
 
 		 435 aa  459  9.999999999999999e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1492  adenylosuccinate lyase  52.66 
 
 		 435 aa  459  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0862733 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0759  adenylosuccinate lyase  50.93 
 
 		 451 aa  459  9.999999999999999e-129  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3530  adenylosuccinate lyase  52.44 
 
 		 431 aa  457  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0840  adenylosuccinate lyase  50.93 
 
 		 451 aa  457  1e-127  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1842  adenylosuccinate lyase  51.73 
 
 		 450 aa  456  1e-127  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.333164 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2587  adenylosuccinate lyase  52.44 
 
 		 431 aa  457  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_744  adenylosuccinate lyase  50.47 
 
 		 451 aa  455  1e-127  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0897  adenylosuccinate lyase  51.96 
 
 		 434 aa  456  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2221  adenylosuccinate lyase  51.96 
 
 		 434 aa  456  1e-127  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0455  Adenylosuccinate lyase  50.47 
 
 		 430 aa  455  1e-127  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.547071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0857  adenylosuccinate lyase  51.27 
 
 		 434 aa  458  1e-127  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0639352  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1109  adenylosuccinate lyase  55.13 
 
 		 439 aa  457  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1634  adenylosuccinate lyase  52.31 
 
 		 432 aa  457  1e-127  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4474  adenylosuccinate lyase  52.55 
 
 		 432 aa  456  1e-127  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.457482  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2094  adenylosuccinate lyase  51.04 
 
 		 431 aa  455  1e-127  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1169  adenylosuccinate lyase  55.35 
 
 		 439 aa  456  1e-127  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1108  adenylosuccinate lyase  53.24 
 
 		 434 aa  455  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.34197  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1307  adenylosuccinate lyase  53.66 
 
 		 427 aa  453  1.0000000000000001e-126  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.325105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0991  adenylosuccinate lyase  52.78 
 
 		 434 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0849  adenylosuccinate lyase  52.66 
 
 		 433 aa  454  1.0000000000000001e-126  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0841  adenylosuccinate lyase  52.66 
 
 		 433 aa  454  1.0000000000000001e-126  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1011  adenylosuccinate lyase  51.96 
 
 		 434 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4463  adenylosuccinate lyase  51.49 
 
 		 438 aa  454  1.0000000000000001e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.34436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0238  adenylosuccinate lyase  49.3 
 
 		 433 aa  449  1e-125  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.247681  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2167  adenylosuccinate lyase  51.03 
 
 		 435 aa  450  1e-125  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0172588  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0959  adenylosuccinate lyase  51.49 
 
 		 435 aa  449  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.998456 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0937  adenylosuccinate lyase  51.72 
 
 		 435 aa  451  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5353  adenylosuccinate lyase  52.66 
 
 		 435 aa  449  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156814 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0379  adenylosuccinate lyase  49.3 
 
 		 430 aa  451  1e-125  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1095  adenylosuccinate lyase  52.66 
 
 		 435 aa  450  1e-125  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1779  adenylosuccinate lyase  50.35 
 
 		 434 aa  449  1e-125  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00299045  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0996  adenylosuccinate lyase  51.72 
 
 		 435 aa  450  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.546306  normal  0.992281 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1390  adenylosuccinate lyase  50.47 
 
 		 431 aa  448  1e-125  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.98811  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3439  adenylosuccinate lyase  51.5 
 
 		 436 aa  448  1.0000000000000001e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6842  adenylosuccinate lyase  53.1 
 
 		 435 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1139  adenylosuccinate lyase  52.72 
 
 		 425 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.863394  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23110  adenylosuccinate lyase  47.2 
 
 		 431 aa  447  1.0000000000000001e-124  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3693  adenylosuccinate lyase  50.8 
 
 		 458 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0852  adenylosuccinate lyase  48.84 
 
 		 432 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.20433  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4169  adenylosuccinate lyase  50.82 
 
 		 431 aa  445  1.0000000000000001e-124  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.618231  normal  0.283805 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1125  adenylosuccinate lyase  49.77 
 
 		 433 aa  447  1.0000000000000001e-124  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.814931  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5635  adenylosuccinate lyase  50.58 
 
 		 435 aa  442  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.366607 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1212  adenylosuccinate lyase  51.39 
 
 		 434 aa  442  1e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2569  adenylosuccinate lyase  50.34 
 
 		 435 aa  444  1e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7577  adenylosuccinate lyase  52.41 
 
 		 435 aa  442  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>