More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1453 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1453  50S ribosomal protein L10  100 
 
 		 173 aa  347  4e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0441  50S ribosomal protein L10  84.39 
 
 		 189 aa  292  2e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2994  50S ribosomal protein L10  71.68 
 
 		 173 aa  251  5.000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1634  50S ribosomal protein L10  68.79 
 
 		 174 aa  239  2e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2074  50S ribosomal protein L10  56.47 
 
 		 172 aa  209  2e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2783  50S ribosomal protein L10  55.88 
 
 		 172 aa  194  4.0000000000000005e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00189787  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  46.24 
 
 		 174 aa  157  9e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1547  50S ribosomal protein L10  39.41 
 
 		 173 aa  137  7e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.834427 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  41.04 
 
 		 172 aa  127  8.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  40.59 
 
 		 172 aa  125  4.0000000000000003e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0857  50S ribosomal protein L10  39.77 
 
 		 177 aa  122  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000259828  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  36.47 
 
 		 172 aa  122  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0504  50S ribosomal protein L10  35.96 
 
 		 180 aa  114  7.999999999999999e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000340487  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  38.01 
 
 		 174 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2865  50S ribosomal protein L10  38.6 
 
 		 174 aa  111  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161934  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1784  50S ribosomal protein L10  37.29 
 
 		 181 aa  111  5e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0213  ribosomal protein L10  34.5 
 
 		 175 aa  110  8.000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.623588  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1821  ribosomal protein L10  33.54 
 
 		 179 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2470  50S ribosomal protein L10  33.92 
 
 		 176 aa  108  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0147283  hitchhiker  0.00682166 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  36.99 
 
 		 176 aa  108  5e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1529  ribosomal protein L10  38.01 
 
 		 183 aa  108  5e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000554953  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  36.99 
 
 		 173 aa  108  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  36.99 
 
 		 173 aa  108  5e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1059  50S ribosomal protein L10  37.43 
 
 		 174 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0531801  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  37.79 
 
 		 174 aa  107  8.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  32.94 
 
 		 175 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1337  50S ribosomal protein L10  38.6 
 
 		 174 aa  106  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.900212  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0464  50S ribosomal protein L10  37.29 
 
 		 179 aa  105  3e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0359791  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0479  50S ribosomal protein L10  37.29 
 
 		 179 aa  105  3e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.488036  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  36.84 
 
 		 174 aa  104  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000383704 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2722  50S ribosomal protein L10P  35.33 
 
 		 178 aa  102  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314918  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  35.5 
 
 		 176 aa  102  4e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0183  ribosomal protein L10  32.75 
 
 		 176 aa  101  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000324199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2344  ribosomal protein L10  35.29 
 
 		 173 aa  101  5e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.032292  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0205  50S ribosomal protein L10  33.53 
 
 		 181 aa  99.8  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000665859  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3477  50S ribosomal protein L10  40.4 
 
 		 171 aa  99.8  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.232416  hitchhiker  0.0000717521 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  33.13 
 
 		 174 aa  99.4  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2164  50S ribosomal protein L10P  36.99 
 
 		 174 aa  99  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0596262  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_863  ribosomal protein L10  38.04 
 
 		 176 aa  98.2  4e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130926  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1072  LSU ribosomal protein L10P  35.19 
 
 		 174 aa  98.2  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2724  50S ribosomal protein L10  35.06 
 
 		 166 aa  98.2  5e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000159716  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2410  50S ribosomal protein L10  35.06 
 
 		 166 aa  98.2  5e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000332682  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0991  50S ribosomal protein L10  38.65 
 
 		 176 aa  97.8  7e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000204805  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4318  50S ribosomal protein L10  37.5 
 
 		 187 aa  97.4  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.561909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1372  50S ribosomal protein L10  33.53 
 
 		 178 aa  97.4  8e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2681  50S ribosomal protein L10  33.92 
 
 		 172 aa  96.7  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000132453  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0882  50S ribosomal protein L10  41.1 
 
 		 176 aa  97.4  1e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.629984  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2697  50S ribosomal protein L10P  37.67 
 
 		 172 aa  96.7  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.561782  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1954  50S ribosomal protein L10  38.82 
 
 		 174 aa  95.5  4e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.262202  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  32.96 
 
 		 174 aa  95.1  4e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0355  50S ribosomal protein L10  32.16 
 
 		 172 aa  94.7  6e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000413063  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1302  50S ribosomal protein L10  35.93 
 
 		 166 aa  94  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000076628  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0385  50S ribosomal protein L10  32.16 
 
 		 177 aa  93.2  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0360  50S ribosomal protein L10  32.16 
 
 		 177 aa  93.2  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0571  50S ribosomal protein L10  35.95 
 
 		 187 aa  93.6  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6059  50S ribosomal protein L10  35.8 
 
 		 182 aa  93.2  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.749447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  34.97 
 
 		 166 aa  92.4  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1106  ribosomal protein L10  34.29 
 
 		 176 aa  91.7  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0567771  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0297  50S ribosomal protein L10  38.56 
 
 		 172 aa  92  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0231  50S ribosomal protein L10  31.58 
 
 		 172 aa  91.7  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0103356  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0396  50S ribosomal protein L10  35.86 
 
 		 173 aa  91.7  5e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.252363  hitchhiker  0.00709296 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4018  ribosomal protein L10  35.57 
 
 		 174 aa  91.3  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3328  50S ribosomal protein L10  35.8 
 
 		 186 aa  91.3  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211537 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0140  50S ribosomal protein L10  33.14 
 
 		 174 aa  91.3  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000236563  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0310  50S ribosomal protein L10  36.24 
 
 		 165 aa  91.3  7e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0746923  normal  0.0249908 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  31.18 
 
 		 170 aa  90.9  8e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  34.97 
 
 		 166 aa  90.9  8e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2423  50S ribosomal protein L10  32.9 
 
 		 205 aa  90.1  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0300  ribosomal protein L10  33.93 
 
 		 181 aa  90.1  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000817286  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3453  50S ribosomal protein L10  34.62 
 
 		 174 aa  89.4  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0925685  normal  0.446601 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1964  50S ribosomal protein L10  29.65 
 
 		 172 aa  89.7  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4521  ribosomal protein L10  32.56 
 
 		 200 aa  89.7  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23960  LSU ribosomal protein L10P  42.86 
 
 		 172 aa  89.4  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4444  50S ribosomal protein L10  39.44 
 
 		 176 aa  89.7  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.651473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0915  ribosomal protein L10  34.66 
 
 		 174 aa  89.4  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.690445  normal  0.23712 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3594  50S ribosomal protein L10  38.89 
 
 		 178 aa  88.6  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.196569  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1387  50S ribosomal protein L10  37.82 
 
 		 171 aa  88.6  4e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000123079  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3642  50S ribosomal protein L10  40.14 
 
 		 183 aa  88.6  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.279713 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4771  50S ribosomal protein L10  37.59 
 
 		 164 aa  88.2  6e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.709091  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0389  ribosomal protein L10  31.18 
 
 		 174 aa  87.8  6e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0179  50S ribosomal protein L10  36.42 
 
 		 161 aa  87.8  7e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.215322  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1018  50S ribosomal protein L10  34.15 
 
 		 178 aa  87.8  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00251564 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03861  50S ribosomal protein L10  35.92 
 
 		 165 aa  87.4  8e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000311393  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4010  ribosomal protein L10  35.92 
 
 		 165 aa  87.4  8e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000237202  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5450  50S ribosomal protein L10  35.92 
 
 		 165 aa  87.4  8e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000850473  hitchhiker  0.000626343 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4218  50S ribosomal protein L10  35.92 
 
 		 165 aa  87.4  8e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.4618e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4525  50S ribosomal protein L10  35.92 
 
 		 165 aa  87.4  8e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111294  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4433  50S ribosomal protein L10  35.92 
 
 		 165 aa  87.4  8e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000818528  hitchhiker  0.00000264015 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0195  50S ribosomal protein L10  35.92 
 
 		 165 aa  87.4  8e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000187486  normal  0.229046 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03814  hypothetical protein  35.92 
 
 		 165 aa  87.4  8e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360524  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4473  50S ribosomal protein L10  35.92 
 
 		 165 aa  87.4  8e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000239877  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4040  50S ribosomal protein L10  35.92 
 
 		 165 aa  87.4  8e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00830699  hitchhiker  0.000887574 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0286  50S ribosomal protein L10  29.82 
 
 		 172 aa  87.4  9e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000520195  hitchhiker  0.00386218 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3191  50S ribosomal protein L10  35.95 
 
 		 173 aa  87.4  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579756  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4011  ribosomal protein L10  33.14 
 
 		 175 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0274883  hitchhiker  0.0000000471613 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0232  50S ribosomal protein L10  32.37 
 
 		 172 aa  87  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0685965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0044  50S ribosomal protein L10  35.66 
 
 		 215 aa  86.7  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000127438  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0275  50S ribosomal protein L10  35.46 
 
 		 165 aa  86.7  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000206065  normal  0.0858323 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1043  ribosomal protein L10  33.72 
 
 		 167 aa  87  1e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.144449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4533  50S ribosomal protein L10  37.57 
 
 		 168 aa  86.7  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>