156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1389 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1389  ATP synthase F0, C subunit  100 
 
 		 109 aa  206  9e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2067  ATP synthase F0, C subunit  93.58 
 
 		 109 aa  175  2e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.107619 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2701  ATP synthase F0, C subunit  81.37 
 
 		 101 aa  131  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.025291  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2255  ATP synthase F0, C subunit  67.29 
 
 		 107 aa  123  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.139541  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2086  ATP synthase F0, C subunit  70.37 
 
 		 106 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000184566  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2794  ATP synthase F0, C subunit  64.22 
 
 		 107 aa  98.2  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.196475  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4016  ATP synthase F0, C subunit  64.29 
 
 		 91 aa  89.7  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.64478e-25 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1501  ATP synthase F0, C subunit  64.29 
 
 		 91 aa  89.7  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.766921  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3932  ATP synthase F0, C subunit  64.29 
 
 		 91 aa  89.7  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000044416  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4249  ATP synthase F0, C subunit  62.86 
 
 		 91 aa  87.4  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000950029  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0600  ATP synthase F0, C subunit  66.18 
 
 		 91 aa  87.4  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3360  ATP synthase F0, C subunit  62.86 
 
 		 91 aa  86.7  9e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000392065  hitchhiker  0.00459127 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3143  ATP synthase F0, C subunit  62.86 
 
 		 91 aa  86.7  9e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00841289  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0333  ATP synthase F0, C subunit  62.86 
 
 		 91 aa  85.5  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000631431  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0952  ATP synthase F0, C subunit  58.57 
 
 		 88 aa  85.1  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.146117  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0631  ATP synthase F0, C subunit  73.21 
 
 		 96 aa  84.3  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000562654  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1604  ATP synthase F0, C subunit  67.86 
 
 		 90 aa  84  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0016  ATP synthase F0, C subunit  53.52 
 
 		 88 aa  82  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229893  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0985  F0F1 ATP synthase subunit C  52.44 
 
 		 82 aa  79  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18531  F0F1 ATP synthase subunit C  52.44 
 
 		 82 aa  79  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.504611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15741  F0F1 ATP synthase subunit C  52.44 
 
 		 111 aa  79.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1548  F0F1 ATP synthase subunit C  53.75 
 
 		 81 aa  77.8  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16571  F0F1 ATP synthase subunit C  53.75 
 
 		 81 aa  77.8  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.95353  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16341  F0F1 ATP synthase subunit C  53.75 
 
 		 81 aa  77.8  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.504345  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16451  F0F1 ATP synthase subunit C  53.75 
 
 		 81 aa  77.8  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.421264  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04791  F0F1 ATP synthase subunit C  52.44 
 
 		 122 aa  77  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1281  F0F1 ATP synthase subunit C  45.87 
 
 		 100 aa  75.5  0.0000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2192  F0F1 ATP synthase subunit C  63.33 
 
 		 82 aa  72.8  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1201  ATP synthase F0 sector, C subunit  45.87 
 
 		 107 aa  72  0.000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.539498  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0484  F0F1 ATP synthase subunit C  63.79 
 
 		 81 aa  71.2  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2203  F0F1 ATP synthase subunit C  62.07 
 
 		 81 aa  69.7  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0392559  normal  0.227618 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0332  F0F1 ATP synthase subunit C  62.07 
 
 		 81 aa  68.9  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.708113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2615  F0F1 ATP synthase subunit C  62.07 
 
 		 81 aa  68.6  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.632926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1488  F0F1 ATP synthase subunit C  62.07 
 
 		 82 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300994  normal  0.898049 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2623  F0F1 ATP synthase subunit C  60.34 
 
 		 81 aa  68.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.989267 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3334  ATP synthase F0 subunit C  62.5 
 
 		 81 aa  67  0.00000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2716  F0F1 ATP synthase subunit C  60.34 
 
 		 81 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3387  F0F1 ATP synthase subunit C  60.34 
 
 		 81 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000140393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0601  ATP synthase F0, C subunit  47.3 
 
 		 100 aa  63.2  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.112186  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1068  F0F1 ATP synthase subunit C  42.47 
 
 		 93 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0045  F0F1 ATP synthase subunit C  50 
 
 		 82 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0943976 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1656  F0F1 ATP synthase subunit C  43.84 
 
 		 93 aa  60.8  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0957  F0F1 ATP synthase subunit C  46.88 
 
 		 100 aa  60.8  0.000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2700  ATP synthase F0, C subunit  54.39 
 
 		 88 aa  59.7  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4101  F0F1 ATP synthase subunit C  50 
 
 		 83 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00000110269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1959  F0F1 ATP synthase subunit C  43.84 
 
 		 93 aa  59.7  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2777  F0F1 ATP synthase subunit C  44.05 
 
 		 86 aa  59.7  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.787943  normal  0.376194 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0068  ATP synthase F0, C subunit  47.69 
 
 		 103 aa  58.9  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19720  F0F1 ATP synthase subunit C  45.68 
 
 		 82 aa  58.9  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00460397  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2383  ATP synthase F0, C subunit  48.39 
 
 		 74 aa  58.5  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0446652 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3054  F0F1 ATP synthase subunit C  42.47 
 
 		 93 aa  58.5  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1502  F0F1 ATP synthase subunit C  44.79 
 
 		 100 aa  58.5  0.00000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0893  alternate F1F0 ATPase, F0 subunit C  38.1 
 
 		 95 aa  57.8  0.00000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.716211  normal  0.154695 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf042  ATP synthase C chain  47.22 
 
 		 90 aa  57.8  0.00000005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3101  F0F1 ATP synthase subunit C  48.21 
 
 		 91 aa  57  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00136484  normal  0.204805 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0943  F0F1 ATP synthase subunit C  48.65 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0878  F0F1 ATP synthase subunit C  48.65 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00312668  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1014  F0F1 ATP synthase subunit C  48.65 
 
 		 112 aa  57  0.00000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2673  F0F1 ATP synthase subunit C  41.46 
 
 		 92 aa  57  0.00000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.920382  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5555  F0F1 ATP synthase subunit C  47.14 
 
 		 82 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0972976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0134  H+transporting two-sector ATPase C subunit  40.54 
 
 		 85 aa  55.5  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.331941  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0152  ATP synthase, C subunit  44.44 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2332  hypothetical protein  48.33 
 
 		 91 aa  55.1  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1883  F0F1 ATP synthase subunit C  46.38 
 
 		 82 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.099934  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0847  ATP synthase F0, C subunit  45.07 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0947  F0F1 ATP synthase subunit C  46.55 
 
 		 93 aa  54.3  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0801028  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0440  F0F1 ATP synthase subunit C  41.1 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.100541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1300  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  41.35 
 
 		 104 aa  54.3  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1166  F0F1 ATP synthase subunit C  44.83 
 
 		 93 aa  53.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.214234  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2850  ATP synthase F0, C subunit  41.67 
 
 		 185 aa  53.5  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0959232 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0429  F0F1 ATP synthase subunit C  43.75 
 
 		 104 aa  52.4  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  unclonable  0.00000000000398633  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2501  ATP synthase F0, C subunit  44.93 
 
 		 78 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17860  ATP synthase F0, C subunit  44.78 
 
 		 83 aa  52.8  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0559  ATP synthase F0, C subunit  42.65 
 
 		 76 aa  51.6  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0247806  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0128  F0F1 ATP synthase subunit C  50 
 
 		 82 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1051  F0F1 ATP synthase subunit C  50 
 
 		 82 aa  51.6  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0424  F0F1 ATP synthase subunit C  50 
 
 		 82 aa  51.6  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.173635  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2789  F0F1 ATP synthase subunit C  50 
 
 		 82 aa  51.6  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2647  F0F1 ATP synthase subunit C  50 
 
 		 82 aa  51.6  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0152  F0F1 ATP synthase subunit C  50 
 
 		 82 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0463692  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0533  ATP synthase F0, C subunit  42.65 
 
 		 76 aa  51.6  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274514  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1435  F0F1 ATP synthase subunit C  46.58 
 
 		 80 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.213661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_498  ATP synthase F0, C subunit  42.65 
 
 		 76 aa  51.6  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00034769  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1270  ATP synthase F0, C subunit  41.18 
 
 		 77 aa  51.6  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4471  H+transporting two-sector ATPase C subunit  52.08 
 
 		 114 aa  51.2  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0468  F0F1 ATP synthase subunit C  48.28 
 
 		 93 aa  50.1  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.160143 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0800  ATP synthase F0, C subunit  36.92 
 
 		 321 aa  49.7  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2849  F0F1 ATP synthase subunit C  48.94 
 
 		 86 aa  49.7  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0859343 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2994  F0F1 ATP synthase subunit C  43.06 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0879  ATP synthase F0, C subunit  41.18 
 
 		 115 aa  48.9  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1295  F0F1 ATP synthase subunit C  46.48 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.490401  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2331  F0F1 ATP synthase subunit C  55 
 
 		 93 aa  48.1  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2142  ATP synthase F0, C subunit  44.12 
 
 		 76 aa  48.1  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2453  ATP synthase F0, C subunit  44.64 
 
 		 76 aa  48.1  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl110  ATP synthase subunit C  42.11 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0312  ATP synthase F0, C subunit  42.03 
 
 		 75 aa  47.8  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103627  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1714  F0F1 ATP synthase subunit C  36.51 
 
 		 70 aa  47.4  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2144  F0F1 ATP synthase subunit C  36.51 
 
 		 70 aa  47.4  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2182  F0F1 ATP synthase subunit C  36.51 
 
 		 70 aa  47.4  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.383564  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4486  ATP synthase F0, C subunit  42.03 
 
 		 79 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.862141  normal  0.124516 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>