36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1386 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1386  ATP synthase protein I  100 
 
 
91 aa  184  4e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2064  ATP synthase protein I  63.74 
 
 
92 aa  130  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.109834 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2698  ATP synthase protein I  59.34 
 
 
91 aa  116  9e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2089  ATP synthase protein I  48.84 
 
 
101 aa  88.2  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0218096  normal  0.87278 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2797  ATP synthase protein I  40 
 
 
87 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0200156  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1583  ATP synthase protein I  45.16 
 
 
71 aa  78.2  0.00000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0022057  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0013  hypothetical protein  42.86 
 
 
82 aa  76.6  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000501969  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2252  hypothetical protein  43.18 
 
 
118 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00019318  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3140  hypothetical protein  40.58 
 
 
80 aa  60.5  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000379803  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1509  hypothetical protein  36.99 
 
 
79 aa  57.4  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2667  hypothetical protein  35.14 
 
 
78 aa  55.1  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000715899  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4013  hypothetical protein  32.47 
 
 
80 aa  53.9  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.49788e-30 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3929  hypothetical protein  32.47 
 
 
80 aa  54.3  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000115703  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1894  putative ATP synthase  49.15 
 
 
108 aa  53.9  0.0000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0232779 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1607  hypothetical protein  35.9 
 
 
79 aa  52.8  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4246  hypothetical protein  35.21 
 
 
93 aa  52  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000585685  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3357  hypothetical protein  35.44 
 
 
89 aa  51.6  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000003044  hitchhiker  0.0072657 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0628  hypothetical protein  38.46 
 
 
79 aa  52  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000380142  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0336  hypothetical protein  38.16 
 
 
81 aa  50.4  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00273364  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4482  hypothetical protein  42.11 
 
 
106 aa  48.9  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.597175 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3673  hypothetical protein  53.66 
 
 
111 aa  48.9  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000387976  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0695  hypothetical protein  44.44 
 
 
143 aa  45.4  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2595  ATP synthase F0, subunit I  38.46 
 
 
113 aa  46.2  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00463887 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0553  ATP synthase protein, subunit I  39.34 
 
 
112 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1281  hypothetical protein  41.54 
 
 
95 aa  43.9  0.0009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0902065  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6943  hypothetical protein  51.11 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0327018 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0499  ATP sythase I  36.25 
 
 
132 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.417293  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0511  ATP synthase protein, subunit I  36.07 
 
 
110 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.277873  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3247  hypothetical protein  40.35 
 
 
123 aa  42.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7656  hypothetical protein  43.33 
 
 
126 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.120785  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4474  hypothetical protein  36.25 
 
 
83 aa  42.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3823  hypothetical protein  49.12 
 
 
144 aa  40.8  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0442976 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0698  hypothetical protein  34.33 
 
 
141 aa  40.8  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0393  putative ATP sythase protein I  34.29 
 
 
132 aa  40.8  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0831  FoF1 ATP synthase, subunit I  38.1 
 
 
128 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.101619 
 
 
-
 
NC_004310  BR0381  ATP sythase protein I, putative  34.29 
 
 
132 aa  40.4  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>