More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1352 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1352  50S ribosomal protein L9  100 
 
 		 167 aa  326  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2028  50S ribosomal protein L9  78.29 
 
 		 167 aa  241  3e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.728229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2022  50S ribosomal protein L9  71.81 
 
 		 168 aa  215  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1410  50S ribosomal protein L9  69.8 
 
 		 171 aa  211  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000225617  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1828  50S ribosomal protein L9  57.23 
 
 		 168 aa  168  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1096  50S ribosomal protein L9  53.69 
 
 		 160 aa  163  9e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.547655  normal  0.0167988 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0161  50S ribosomal protein L9  50.34 
 
 		 148 aa  141  4e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0116  50S ribosomal protein L9  49.66 
 
 		 149 aa  134  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0123  50S ribosomal protein L9  49.66 
 
 		 149 aa  134  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0134  50S ribosomal protein L9  49.66 
 
 		 149 aa  134  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0150  50S ribosomal protein L9  45.03 
 
 		 151 aa  134  8e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157053  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  45.58 
 
 		 148 aa  134  8e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000317895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2509  50S ribosomal protein L9  44.9 
 
 		 151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000781135  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  44.9 
 
 		 159 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1210  50S ribosomal protein L9  44.44 
 
 		 209 aa  128  3e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0873917  normal  0.750153 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2610  50S ribosomal protein L9  44.52 
 
 		 147 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.196058  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4506  ribosomal protein L9  43.24 
 
 		 149 aa  126  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0117  50S ribosomal protein L9  44.22 
 
 		 151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1479  50S ribosomal protein L9  43.06 
 
 		 147 aa  125  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00653221 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2388  50S ribosomal protein L9  42.18 
 
 		 147 aa  124  5e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0097  50S ribosomal protein L9  44.22 
 
 		 151 aa  123  9e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2761  50S ribosomal protein L9  42.36 
 
 		 147 aa  123  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0110  50S ribosomal protein L9  40.82 
 
 		 151 aa  122  2e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000508651  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2510  50S ribosomal protein L9  45.14 
 
 		 194 aa  123  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.531472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0448  50S ribosomal protein L9  38.89 
 
 		 148 aa  122  2e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000315624  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0120  50S ribosomal protein L9  48.89 
 
 		 149 aa  122  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0927016  normal  0.199932 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1996  50S ribosomal protein L9  41.89 
 
 		 148 aa  120  6e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09988  ribosomal protein L9  41.61 
 
 		 149 aa  120  7e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536224  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1043  50S ribosomal protein L9  41.67 
 
 		 204 aa  120  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0955164 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2841  50S ribosomal protein L9  39.19 
 
 		 148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  hitchhiker  0.000000000000102152 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0761  50S ribosomal protein L9  42.47 
 
 		 151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3675  50S ribosomal protein L9  40.28 
 
 		 147 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0017578  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1112  ribosomal protein L9  39.04 
 
 		 147 aa  117  9e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.573323  normal  0.866168 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0397  hypothetical protein  38.26 
 
 		 149 aa  117  9.999999999999999e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  38.19 
 
 		 147 aa  116  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2780  50S ribosomal protein L9  42.95 
 
 		 149 aa  116  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000928974  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3558  50S ribosomal protein L9  42.18 
 
 		 148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.882223 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002335  LSU ribosomal protein L9p  42 
 
 		 150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.178305  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0889  50S ribosomal protein L9  44 
 
 		 194 aa  115  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.301047  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1692  50S ribosomal protein L9  38.93 
 
 		 149 aa  115  3e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0449  50S ribosomal protein L9  43.62 
 
 		 150 aa  114  3.9999999999999997e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00474942 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0668  50S ribosomal protein L9  40.97 
 
 		 148 aa  114  5e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00124479  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0597  50S ribosomal protein L9  36.81 
 
 		 179 aa  114  5e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3363  ribosomal protein L9  40.97 
 
 		 201 aa  114  5e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0210  ribosomal protein L9  37.13 
 
 		 172 aa  114  5e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000722973  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0777  50S ribosomal protein L9  43.62 
 
 		 149 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000131124  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3589  50S ribosomal protein L9  44.3 
 
 		 150 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.229017  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3281  50S ribosomal protein L9  44 
 
 		 150 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.134585  hitchhiker  0.000210385 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0760  50S ribosomal protein L9  44.67 
 
 		 150 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.242158  hitchhiker  0.000000266441 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1414  50S ribosomal protein L9  42.76 
 
 		 199 aa  113  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2332  ribosomal protein L9  38.31 
 
 		 170 aa  112  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.640711  hitchhiker  0.00706783 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3185  ribosomal protein L9  41.22 
 
 		 148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.564436  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1547  50S ribosomal protein L9  39.46 
 
 		 149 aa  112  3e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1436  50S ribosomal protein L9  40.41 
 
 		 149 aa  112  3e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3040  50S ribosomal protein L9  40.48 
 
 		 188 aa  112  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.186174 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0534  ribosomal protein L9  44.59 
 
 		 149 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00020  50S ribosomal protein L9  40 
 
 		 150 aa  111  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0741  ribosomal protein L9  36.05 
 
 		 147 aa  111  5e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0681469  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3432  50S ribosomal protein L9  45.64 
 
 		 150 aa  110  6e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0102132  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4672  50S ribosomal protein L9  42.95 
 
 		 149 aa  110  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00136692  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4662  50S ribosomal protein L9  42.95 
 
 		 149 aa  110  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0630658  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04070  50S ribosomal protein L9  42.95 
 
 		 149 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3790  ribosomal protein L9  42.95 
 
 		 149 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00574678  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0418  ribosomal protein L9  42.28 
 
 		 150 aa  110  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.291311  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4764  50S ribosomal protein L9  42.95 
 
 		 149 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4447  50S ribosomal protein L9  42.95 
 
 		 149 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1361  ribosomal protein L9  41.33 
 
 		 150 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4736  50S ribosomal protein L9  42.95 
 
 		 149 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.257928  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3810  50S ribosomal protein L9  42.95 
 
 		 149 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0581092 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04032  hypothetical protein  42.95 
 
 		 149 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2131  50S ribosomal protein L9  41.38 
 
 		 149 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.103333  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2050  50S ribosomal protein L9  41.38 
 
 		 149 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3666  50S ribosomal protein L9  42.95 
 
 		 149 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.006093  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2458  50S ribosomal protein L9P  41.67 
 
 		 149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.174518 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5718  50S ribosomal protein L9  42.95 
 
 		 149 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.595872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4673  50S ribosomal protein L9  42.95 
 
 		 149 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00744  50S ribosomal protein L9  40.94 
 
 		 149 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.73532  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3636  50S ribosomal protein L9  43.71 
 
 		 150 aa  109  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4209  50S ribosomal protein L9  43.33 
 
 		 150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.828057  hitchhiker  0.000279421 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1435  50S ribosomal protein L9  39.6 
 
 		 149 aa  109  2.0000000000000002e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0986557  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3781  50S ribosomal protein L9  43.71 
 
 		 150 aa  109  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0681  50S ribosomal protein L9  43.71 
 
 		 150 aa  109  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0491  ribosomal protein L9  37.5 
 
 		 179 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4812  50S ribosomal protein L9  42.28 
 
 		 149 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0162172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4790  50S ribosomal protein L9  42.28 
 
 		 149 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.131212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0901  50S ribosomal protein L9  40.97 
 
 		 189 aa  108  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0476125 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4754  50S ribosomal protein L9  42.28 
 
 		 149 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0190714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2587  50S ribosomal protein L9  41.91 
 
 		 150 aa  108  4.0000000000000004e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.800649 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2306  50S ribosomal protein L9  40.97 
 
 		 189 aa  108  4.0000000000000004e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.891012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2188  50S ribosomal protein L9  39.33 
 
 		 209 aa  107  5e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0851  50S ribosomal protein L9P  40.54 
 
 		 149 aa  107  8.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11530  ribosomal protein L9  43.66 
 
 		 191 aa  107  1e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0446546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9354  50S ribosomal protein L9P  39.46 
 
 		 148 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1350  50S ribosomal protein L9  40.28 
 
 		 189 aa  106  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0676227  normal  0.268494 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0141  50S ribosomal protein L9  40.97 
 
 		 189 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0648  50S ribosomal protein L9  42.18 
 
 		 148 aa  106  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000594391 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27890  ribosomal protein L9  41.78 
 
 		 181 aa  106  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00233062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1774  50S ribosomal protein L9  40.97 
 
 		 189 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4931  50S ribosomal protein L9  43.38 
 
 		 148 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000100703 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4665  50S ribosomal protein L9  43.38 
 
 		 148 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0656931 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>