259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1319 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1319  Lipocalin  100 
 
 		 260 aa  525  1e-148  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00248779 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0475  hypothetical protein  58.19 
 
 		 227 aa  270  2e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0149122 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1764  hypothetical protein  54.74 
 
 		 232 aa  250  2e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2955  hypothetical protein  53.85 
 
 		 237 aa  244  9e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0919903  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3232  Methyltransferase type 11  46.32 
 
 		 218 aa  185  7e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.74588  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0211  Methyltransferase type 12  41.28 
 
 		 214 aa  156  4e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.873381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1760  hypothetical protein  40.36 
 
 		 229 aa  117  9.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0562  methyltransferase type 12  40.82 
 
 		 239 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0580  Methyltransferase type 12  35.03 
 
 		 233 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.260933 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1626  hypothetical protein  36.54 
 
 		 231 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.220792 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0686  Methyltransferase type 12  36.99 
 
 		 236 aa  111  9e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0515  Methyltransferase type 12  32.2 
 
 		 235 aa  105  5e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0609  Methyltransferase type 12  37.42 
 
 		 235 aa  99.8  4e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0824  methyltransferase type 12  37.7 
 
 		 200 aa  94.7  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1383  Methyltransferase type 12  34.21 
 
 		 249 aa  79.3  0.00000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.413132  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0452  methyltransferase type 12  32.56 
 
 		 244 aa  78.6  0.00000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1098  methyltransferase small  27.21 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1914  histidine kinase  29.05 
 
 		 221 aa  75.9  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.116894  normal  0.357859 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2589  hypothetical protein  24.79 
 
 		 240 aa  72  0.000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92077  predicted protein  28.26 
 
 		 215 aa  70.9  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00026919  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4036  histidine kinase  22.4 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2848  histidine kinase  26.53 
 
 		 217 aa  68.9  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.531025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01421  hypothetical protein  32.11 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.232872  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0005  methyltransferase small  30.84 
 
 		 264 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.125741 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3014  hypothetical protein  23.27 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1029  methyltransferase small  31.94 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0573  hypothetical protein  34.85 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2961  hypothetical protein  32.58 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.210334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3445  histidine kinase  23.75 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303754 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1100  histidine kinase  23.75 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000104684 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3309  histidine kinase  23.75 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3267  histidine kinase  23.75 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2861  histidine kinase  22.01 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4015  putative methyltransferase protein  33.83 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.232 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06680  hypothetical protein  32.89 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3694  putative methyltransferase protein  33.83 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0043  hypothetical protein  31.58 
 
 		 232 aa  58.9  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0687  hypothetical protein  33.91 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2435  hypothetical protein  26.26 
 
 		 237 aa  58.2  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.77423 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0363  hypothetical protein  32.59 
 
 		 223 aa  58.2  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1737  Methyltransferase-16, putative  27.34 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.762946 
 
 
-
 
NC_004310  BR1892  hypothetical protein  30.3 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2163  hypothetical protein  32.33 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5047  hypothetical protein  34.78 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1002  methyltransferase small  30.47 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1927  hypothetical protein  32.12 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.383798  normal  0.0886446 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0640  hypothetical protein  29.32 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25153  predicted protein  36.05 
 
 		 338 aa  55.1  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00188354  hitchhiker  0.00255191 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1972  hypothetical protein  32.33 
 
 		 216 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2248  hypothetical protein  31.58 
 
 		 220 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00723109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0253  hypothetical protein  31.62 
 
 		 220 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0638202  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00173  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.98 
 
 		 295 aa  53.5  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1820  hypothetical protein  29.55 
 
 		 218 aa  53.5  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.385222  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0557  hypothetical protein  33.33 
 
 		 218 aa  53.5  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.417048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5022  hypothetical protein  30.4 
 
 		 218 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5354  hypothetical protein  30.34 
 
 		 216 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190586  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1878  methyltransferase-like protein  30.3 
 
 		 214 aa  52.8  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.627264  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0759  hypothetical protein  28.41 
 
 		 219 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.580871 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4465  hypothetical protein  32.03 
 
 		 217 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0970  hypothetical protein  26.52 
 
 		 218 aa  51.6  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2687  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.56 
 
 		 295 aa  51.6  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000011349  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002195  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.74 
 
 		 295 aa  51.6  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00271176  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45331  predicted protein  38.46 
 
 		 340 aa  50.4  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0689578  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1210  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.77 
 
 		 306 aa  50.4  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000191055  normal  0.886421 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2236  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  45.28 
 
 		 253 aa  50.1  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0596269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2837  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.86 
 
 		 294 aa  50.1  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104112  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0388  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.77 
 
 		 293 aa  50.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000022526  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0454  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.77 
 
 		 293 aa  50.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.281322  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1719  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  43.28 
 
 		 234 aa  50.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.815395  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0217  methyltransferase  46.94 
 
 		 200 aa  50.1  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0239  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.61 
 
 		 295 aa  49.7  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3687  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.31 
 
 		 295 aa  49.7  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.768619  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0243  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.61 
 
 		 295 aa  49.7  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4749  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  51.72 
 
 		 295 aa  49.3  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3208  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.96 
 
 		 300 aa  49.3  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0770215  decreased coverage  0.00369905 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3033  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.66 
 
 		 298 aa  48.9  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_92828  predicted protein  29.38 
 
 		 566 aa  48.5  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3845  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.04 
 
 		 295 aa  48.5  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.393013  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  34.18 
 
 		 251 aa  48.1  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0914  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  44.12 
 
 		 232 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.497259  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2623  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.66 
 
 		 298 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.906319 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0918  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  44.12 
 
 		 232 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0317965 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4421  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.04 
 
 		 293 aa  47.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00260494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0946  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  40.91 
 
 		 232 aa  47.4  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0331  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.04 
 
 		 293 aa  47.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0201798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2246  hypothetical protein  29.32 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0818704 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2867  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.66 
 
 		 297 aa  47.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712304  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0810  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.69 
 
 		 292 aa  47  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0997  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  40.58 
 
 		 232 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0559  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  40.58 
 
 		 232 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830783  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4139  hypothetical protein  24.44 
 
 		 219 aa  47.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1038  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  40.58 
 
 		 232 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  35.62 
 
 		 266 aa  47  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2788  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.36 
 
 		 298 aa  46.6  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4151  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  41.18 
 
 		 232 aa  46.6  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0736  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  41.18 
 
 		 232 aa  46.6  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.421351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1435  ribosomal L11 methyltransferase  39.62 
 
 		 276 aa  46.6  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3686  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.33 
 
 		 300 aa  46.2  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4502  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.03 
 
 		 244 aa  46.2  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1042  hypothetical protein  33.61 
 
 		 220 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>