26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1284 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1284  protein of unknown function DUF935  100 
 
 		 524 aa  1056    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02991e-32 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3373  hypothetical protein  46.07 
 
 		 523 aa  438  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2932  hypothetical protein  32.13 
 
 		 496 aa  226  1e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.163033  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0433  protein of unknown function DUF935  33.05 
 
 		 510 aa  170  6e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3783  hypothetical protein  30.35 
 
 		 537 aa  133  7.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.690842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2089  hypothetical protein  29.5 
 
 		 528 aa  113  9e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00551419  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2136  hypothetical protein  29.5 
 
 		 538 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0667  hypothetical protein  26.92 
 
 		 533 aa  111  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0250  hypothetical protein  22.25 
 
 		 456 aa  96.7  9e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1877  hypothetical protein  26.65 
 
 		 582 aa  96.7  9e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2248  hypothetical protein  29.13 
 
 		 584 aa  94.7  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4502  hypothetical protein  27.41 
 
 		 544 aa  91.7  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.221715 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1641  hypothetical protein  26.83 
 
 		 523 aa  90.9  5e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1002  Mu-like prophage protein  23.58 
 
 		 505 aa  88.2  4e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291607 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3047  hypothetical protein  31.09 
 
 		 517 aa  87.4  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88762  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2101  hypothetical protein  25.66 
 
 		 543 aa  84.7  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0242078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1299  hypothetical protein  25.66 
 
 		 543 aa  84.7  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3006  hypothetical protein  28.41 
 
 		 517 aa  84  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.357056  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3393  protein of unknown function DUF935  24.25 
 
 		 543 aa  84  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.219922  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0729  protein of unknown function DUF935  27.41 
 
 		 552 aa  82  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0671  protein of unknown function DUF935  25.57 
 
 		 530 aa  77  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1968  hypothetical protein  23.17 
 
 		 523 aa  77  0.0000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.418273 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0763  hypothetical protein  27.73 
 
 		 519 aa  73.2  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0674  hypothetical protein  27.73 
 
 		 519 aa  73.2  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2680  hypothetical protein  27.59 
 
 		 521 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1912  protein of unknown function DUF935  24.1 
 
 		 511 aa  72.8  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.6802 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>