More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1234 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1234  methionine-R-sulfoxide reductase  100 
 
 
290 aa  587  1e-167  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0160878 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2376  methionine sulfoxide reductase B  70.92 
 
 
187 aa  216  4e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3054  methionine-R-sulfoxide reductase  68.97 
 
 
155 aa  215  5e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000457549  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1009  methionine-R-sulfoxide reductase  68.31 
 
 
397 aa  214  9.999999999999999e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2424  methionine-R-sulfoxide reductase  67.59 
 
 
158 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.072868 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0557  peptide methionine sulfoxide reductase  63.64 
 
 
394 aa  211  9e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.921771  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1541  methionine-R-sulfoxide reductase  67.13 
 
 
353 aa  208  1e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000985069  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3626  methionine-R-sulfoxide reductase  69.29 
 
 
212 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0190524 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2611  peptide methionine sulfoxide reductase  67.38 
 
 
368 aa  204  2e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06690  peptide methionine sulfoxide reductase  62.24 
 
 
380 aa  203  3e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000793  peptide methionine sulfoxide reductase  62.07 
 
 
380 aa  202  4e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0102  peptide methionine sulfoxide reductase  60.84 
 
 
381 aa  197  1.0000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1043  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  61.7 
 
 
416 aa  197  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.734062 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1104  methionine sulfoxide reductase B  62.77 
 
 
167 aa  196  3e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1104  methionine sulfoxide reductase B  62.77 
 
 
167 aa  196  3e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2264  methionine-R-sulfoxide reductase  63.5 
 
 
351 aa  195  7e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4211  methionine-R-sulfoxide reductase  68.61 
 
 
158 aa  194  1e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1630  methionine-R-sulfoxide reductase  60.99 
 
 
323 aa  194  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00819616  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1427  peptide methionine sulfoxide reductase  60.28 
 
 
416 aa  193  3e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.208524  normal  0.512662 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1955  peptide methionine sulfoxide reductase, putative  57.32 
 
 
202 aa  192  6e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.81622  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0704  methionine sulfoxide reductase B  58.6 
 
 
191 aa  192  7e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4592  methionine-R-sulfoxide reductase  61.7 
 
 
368 aa  191  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2088  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  60.96 
 
 
352 aa  189  2.9999999999999997e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3954  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  62.96 
 
 
321 aa  189  4e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5561  peptide methionine sulfoxide reductase  62.22 
 
 
321 aa  189  5e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2072  methionine sulfoxide reductase B  64.58 
 
 
152 aa  188  7e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.91893  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2286  methionine-R-sulfoxide reductase  61.27 
 
 
153 aa  188  8e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.734689  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5132  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  61.48 
 
 
321 aa  188  9e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0809549  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5531  peptide methionine sulfoxide reductase  61.48 
 
 
321 aa  188  9e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5569  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  61.48 
 
 
321 aa  187  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5290  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  61.48 
 
 
321 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5115  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  61.48 
 
 
321 aa  187  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2646  methionine-R-sulfoxide reductase  62.04 
 
 
320 aa  187  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00677049  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0985  protein-methionine-S-oxide reductase  56.64 
 
 
181 aa  187  1e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000265676  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5687  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  61.48 
 
 
321 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5388  peptide methionine sulfoxide reductase  61.48 
 
 
321 aa  187  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.52931  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5617  peptide methionine sulfoxide reductase  61.48 
 
 
321 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0373  methionine-R-sulfoxide reductase  60.56 
 
 
328 aa  186  3e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0222  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  62.68 
 
 
311 aa  186  4e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.763171  hitchhiker  3.90951e-21 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1045  methionine-R-sulfoxide reductase  52.32 
 
 
364 aa  184  1.0000000000000001e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3952  methionine-R-sulfoxide reductase  60.58 
 
 
141 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5230  methionine-R-sulfoxide reductase  60.74 
 
 
321 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5573  methionine sulfoxide reductase B  64.18 
 
 
147 aa  181  9.000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139871  normal  0.0985113 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0217  methionine-R-sulfoxide reductase  58.04 
 
 
148 aa  181  1e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.627751 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05500  methionine-R-sulfoxide reductase/methionine-S-sulfoxide reductase  57.64 
 
 
385 aa  180  2e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04460  methionine-R-sulfoxide reductase/methionine-S-sulfoxide reductase  56.03 
 
 
735 aa  178  1e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.361205  normal  0.714911 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1374  trifunctional thioredoxin/methionine sulfoxide reductase A/B protein  58.78 
 
 
590 aa  176  3e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0147038 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5350  methionine sulfoxide reductase B  63.24 
 
 
147 aa  175  6e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7199  methionine-R-sulfoxide reductase  61.31 
 
 
150 aa  175  8e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.929536  normal  0.310731 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1839  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/msrB  54.55 
 
 
348 aa  169  5e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.94451  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2948  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  58.27 
 
 
322 aa  169  6e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0906  methionine-R-sulfoxide reductase  54.17 
 
 
375 aa  168  8e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1554  peptide methionine sulfoxide reductase domain-containing protein  57.14 
 
 
141 aa  168  8e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1088  trifunctional thioredoxin/methionine sulfoxide reductase A/B protein  48.66 
 
 
611 aa  166  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.541227 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0125  methionine sulfoxide reductase B  60.58 
 
 
147 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.155409  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5708  methionine-R-sulfoxide reductase  59.85 
 
 
154 aa  166  4e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.226554  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1893  methionine-R-sulfoxide reductase  60.14 
 
 
405 aa  166  5e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00784315  unclonable  2.29788e-16 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1519  peptide methionine sulfoxide reductase domain-containing protein  55.78 
 
 
147 aa  166  5e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3736  protein-methionine-S-oxide reductase  58.21 
 
 
151 aa  164  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1106  methionine-R-sulfoxide reductase  59.85 
 
 
157 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1279  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/msrB  52.11 
 
 
337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0446  methionine sulfoxide reductase B  59.15 
 
 
146 aa  163  3e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.342631  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0390  methionine sulfoxide reductase B  59.15 
 
 
146 aa  163  3e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.504869  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3364  methionine sulfoxide reductase B  61.19 
 
 
148 aa  163  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.516711  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5470  methionine-R-sulfoxide reductase  59.85 
 
 
153 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0709  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  52.11 
 
 
317 aa  162  5.0000000000000005e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00161368  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5179  methionine-R-sulfoxide reductase  59.85 
 
 
153 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2441  methionine sulfoxide reductase B  61.83 
 
 
148 aa  161  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.660981 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5091  protein-methionine-S-oxide reductase  59.85 
 
 
153 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1860  methionine sulfoxide reductase B  53.03 
 
 
147 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000145695  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1577  methionine sulfoxide reductase B  53.79 
 
 
147 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000000632227  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2966  methionine sulfoxide reductase B  58.02 
 
 
148 aa  160  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0195  methionine sulfoxide reductase B  57.81 
 
 
142 aa  160  3e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000568952  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0188  methionine-R-sulfoxide reductase  55.4 
 
 
142 aa  158  8e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1085  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/msrB  50.34 
 
 
332 aa  157  1e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2803  methionine sulfoxide reductase B  59.54 
 
 
149 aa  157  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.825598  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3070  methionine sulfoxide reductase B  57.36 
 
 
150 aa  157  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.364574  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1503  methionine-R-sulfoxide reductase  52.17 
 
 
144 aa  157  2e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000972578  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1003  methionine sulfoxide reductase B  54.55 
 
 
186 aa  157  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2143  methionine sulfoxide reductase B  58.09 
 
 
149 aa  157  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.113002  normal  0.387299 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0999  methionine sulfoxide reductase B  49.63 
 
 
142 aa  155  8e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.680503  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0910  methionine sulfoxide reductase B  52.82 
 
 
144 aa  154  1e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1385  methionine-R-sulfoxide reductase  50.97 
 
 
359 aa  154  1e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0249  methionine-R-sulfoxide reductase  45.33 
 
 
309 aa  154  1e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0863  methionine-R-sulfoxide reductase  60.16 
 
 
136 aa  155  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1314  peptide methionine sulfoxide reductase domain-containing protein  52.48 
 
 
316 aa  154  1e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.147945  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2840  methionine-R-sulfoxide reductase  55.56 
 
 
151 aa  153  4e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1643  methionine-R-sulfoxide reductase  57.72 
 
 
146 aa  152  4e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240011  normal  0.30587 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1512  methionine sulfoxide reductase B  50.37 
 
 
142 aa  152  5e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1483  methionine sulfoxide reductase B  50.37 
 
 
142 aa  152  5e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1633  peptide methionine sulfoxide reductase family protein  48.34 
 
 
346 aa  150  2e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00891353  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4326  methionine sulfoxide reductase B  57.36 
 
 
148 aa  149  4e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2451  PilB-related protein  55.2 
 
 
137 aa  148  9e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03241  putative methionine sulfoxide reductase family protein  56.56 
 
 
144 aa  147  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1363  peptide methionine sulfoxide reductase-like protein  57.14 
 
 
338 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.312066  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2319  methionine-R-sulfoxide reductase  56.8 
 
 
131 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.69896  normal  0.111888 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4070  methionine-R-sulfoxide reductase  53.54 
 
 
132 aa  147  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  unclonable  0.000043688 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0592  hypothetical protein  48.2 
 
 
329 aa  146  3e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000314472  hitchhiker  0.000621287 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1778  methionine-R-sulfoxide reductase  51.54 
 
 
206 aa  146  4.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1127  methionine sulfoxide reductase B  50.34 
 
 
151 aa  145  5e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.103826  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>