84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1076 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1076  dienelactone hydrolase-like protein  100 
 
 
476 aa  944    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0630  hypothetical protein  50.12 
 
 
410 aa  370  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1988  hypothetical protein  44.93 
 
 
376 aa  291  2e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.872973  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2566  dienelactone hydrolase-like  40.87 
 
 
439 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3002  hypothetical protein  35.14 
 
 
346 aa  179  9e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3135  hypothetical protein  33.79 
 
 
339 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0222063  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2607  hypothetical protein  33.53 
 
 
345 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.313351 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2838  hypothetical protein  34.57 
 
 
348 aa  167  5e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.540199  normal  0.173901 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2934  hypothetical protein  34.18 
 
 
348 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2757  hypothetical protein  34.18 
 
 
348 aa  163  7e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1024  hypothetical protein  32.83 
 
 
330 aa  150  7e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.401843  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5513  dienelactone hydrolase-like protein  32.28 
 
 
318 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.386349  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0593  hydrolase protein  29.82 
 
 
320 aa  140  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0076  hypothetical protein  33.44 
 
 
341 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15541  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3597  dienelactone hydrolase-like  31.7 
 
 
318 aa  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.477665  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4770  dienelactone hydrolase-like protein  31.7 
 
 
318 aa  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394941  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0944  dienelactone hydrolase-like  30.84 
 
 
318 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.287245 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4065  putative hydrolase, putative exported protein  29.39 
 
 
336 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263411  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5444  hypothetical protein  30.73 
 
 
327 aa  124  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0680915  normal  0.105622 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0856  putative hydrolase, putative exported protein  30.46 
 
 
337 aa  119  9e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0896455 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4713  putative lipoprotein signal peptide  29.07 
 
 
365 aa  114  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.405813 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0009  hypothetical protein  29.34 
 
 
298 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5358  putative lipoprotein signal peptide  31.86 
 
 
374 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03192  lipoprotein signal peptide  31.4 
 
 
372 aa  103  8e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3411  hypothetical protein  27.12 
 
 
347 aa  102  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0800  putative lipoprotein signal peptide  27.3 
 
 
373 aa  101  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0425  dienelactone hydrolase  27.65 
 
 
338 aa  94.7  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0555723  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1764  hypothetical protein  38.31 
 
 
340 aa  94.4  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.49495  normal  0.0945387 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1192  hypothetical protein  33.73 
 
 
316 aa  90.5  5e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.52379 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0878  hypothetical protein  26.11 
 
 
347 aa  89.7  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3340  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  27.74 
 
 
382 aa  85.9  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2487  putative lipoprotein signal peptide  30.27 
 
 
334 aa  86.3  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0877  hypothetical protein  29.45 
 
 
345 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2590  hypothetical protein  20.18 
 
 
341 aa  83.6  0.000000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0331  putative lipoprotein signal peptide  28.92 
 
 
343 aa  77.4  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.435973  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2964  hypothetical protein  23.16 
 
 
543 aa  73.9  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5818  hypothetical protein  36 
 
 
300 aa  72.8  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0309  putative lipoprotein signal peptide  28.37 
 
 
352 aa  73.2  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.45814 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2285  putative secreted lipase  34.81 
 
 
410 aa  71.2  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00039639  normal  0.79101 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0005  hypothetical protein  27.57 
 
 
380 aa  70.9  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0733  hypothetical protein  26.7 
 
 
342 aa  70.1  0.00000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.266553  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3713  hypothetical protein  31.3 
 
 
346 aa  68.2  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2716  hypothetical protein  24.54 
 
 
546 aa  67.4  0.0000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3583  protein of unknown function DUF1400  31.01 
 
 
572 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2145  protein of unknown function DUF1400  23.58 
 
 
570 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0494  protein of unknown function DUF1400  25.85 
 
 
569 aa  61.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0319024  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2117  hypothetical protein  23.44 
 
 
567 aa  61.2  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.383292  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2531  protein of unknown function DUF1400  31.01 
 
 
572 aa  61.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.732033  normal  0.144228 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0025  hypothetical protein  24.26 
 
 
568 aa  60.5  0.00000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.797513 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1441  hypothetical protein  23.93 
 
 
312 aa  58.9  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1136  protein of unknown function DUF1400  25.68 
 
 
600 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0371  putative lipoprotein signal peptide  31.67 
 
 
146 aa  58.2  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.797629 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4546  protein of unknown function DUF1400  24.56 
 
 
551 aa  58.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3825  protein of unknown function DUF1400  31.25 
 
 
547 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3930  protein of unknown function DUF1400  31.97 
 
 
607 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.200649 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2723  protein of unknown function DUF1400  23.48 
 
 
571 aa  57.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128578  hitchhiker  0.00368016 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1166  protein of unknown function DUF1400  25.68 
 
 
600 aa  58.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3241  protein of unknown function DUF1400  30.16 
 
 
567 aa  57.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4229  protein of unknown function DUF1400  31.4 
 
 
568 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3090  hypothetical protein  21.89 
 
 
545 aa  54.7  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000551056  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6835  putative lipoprotein signal peptide  27.89 
 
 
328 aa  54.3  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544443  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1926  dienelactone hydrolase-like protein  27.98 
 
 
464 aa  53.9  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0395074  normal  0.388214 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0787  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  28.23 
 
 
382 aa  52.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6097  hypothetical protein  24.74 
 
 
332 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2316  hypothetical protein  24.52 
 
 
498 aa  50.8  0.00005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3307  dienelactone hydrolase-like  28.1 
 
 
449 aa  50.4  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4384  protein of unknown function DUF1400  26.56 
 
 
605 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101972 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1800  protein of unknown function DUF1400  23.48 
 
 
542 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3689  platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  24.14 
 
 
430 aa  49.7  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4547  protein of unknown function DUF1400  29.37 
 
 
533 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2690  hypothetical protein  29.27 
 
 
498 aa  48.9  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.165896  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0990  hypothetical protein  26.62 
 
 
278 aa  47.8  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3976  hypothetical protein  23.42 
 
 
601 aa  47.8  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.671278  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4877  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  33.57 
 
 
396 aa  46.6  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300745  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1172  dienelactone hydrolase-like protein  27.63 
 
 
449 aa  46.2  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.22553  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1079  hypothetical protein  18.75 
 
 
369 aa  45.4  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000122089  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0545  esterase/lipase  33.61 
 
 
311 aa  45.4  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001493  hypothetical protein  22.7 
 
 
339 aa  44.7  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.271715  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1399  dienelactone hydrolase  32 
 
 
250 aa  44.3  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1117  dienelactone hydrolase-like protein  32.17 
 
 
313 aa  44.3  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.218404  normal  0.24228 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3848  hypothetical protein  24.05 
 
 
330 aa  44.3  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1295  hypothetical protein  22.31 
 
 
369 aa  43.9  0.007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.103756  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2032  hypothetical protein  20.69 
 
 
565 aa  43.5  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.347615  normal  0.0686681 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3493  dienelactone hydrolase-like protein  31.3 
 
 
433 aa  43.5  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.44711  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>