More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1051 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1051  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 215 aa  442  1e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0668  TPR repeat-containing protein  61.27 
 
 		 209 aa  256  2e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.541497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1288  TPR repeat-containing protein  52.45 
 
 		 207 aa  226  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2362  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  44.83 
 
 		 256 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1897  TPR repeat-containing protein  40.5 
 
 		 214 aa  153  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1720  TPR repeat-containing protein  40.84 
 
 		 187 aa  135  5e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2431  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.54 
 
 		 190 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.232516  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2936  TPR repeat-containing protein  49.18 
 
 		 200 aa  132  6e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.196962 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2980  TPR repeat-containing protein  43.58 
 
 		 208 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.345499  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1786  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 		 190 aa  128  6e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0173384 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3178  TPR repeat-containing protein  42.78 
 
 		 211 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0335083  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3070  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.46 
 
 		 208 aa  125  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1796  TPR repeat-containing protein  36.87 
 
 		 216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2615  TPR domain-containing protein  42.96 
 
 		 196 aa  118  6e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2007  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.97 
 
 		 190 aa  114  7.999999999999999e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0856  sugar transporter superfamily protein  41.06 
 
 		 198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2192  TPR repeat-containing protein  37.93 
 
 		 319 aa  103  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000199858  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0757  TPR repeat-containing protein  32.28 
 
 		 222 aa  81.6  0.000000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.572611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0732  TPR repeat-containing protein  30.65 
 
 		 235 aa  79.7  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  32.76 
 
 		 878 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.58 
 
 		 586 aa  69.3  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.33 
 
 		 810 aa  68.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  35.24 
 
 		 265 aa  68.6  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  31.93 
 
 		 699 aa  68.2  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 		 3035 aa  68.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  32.2 
 
 		 375 aa  67.8  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  33.59 
 
 		 4489 aa  67.4  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 		 542 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  33.62 
 
 		 1694 aa  67  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2550  TPR repeat-containing protein  31.43 
 
 		 670 aa  66.2  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.507483  normal  0.0818134 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  31.97 
 
 		 267 aa  65.9  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  30.97 
 
 		 1276 aa  65.9  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  35.86 
 
 		 560 aa  65.5  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  31.93 
 
 		 374 aa  65.1  0.0000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  35.19 
 
 		 265 aa  64.7  0.0000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 3560 aa  64.3  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  33.94 
 
 		 265 aa  64.3  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4642  TPR repeat-containing protein  31.39 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0840  TPR repeat-containing protein  27.54 
 
 		 1371 aa  63.5  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  27.35 
 
 		 392 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  29.94 
 
 		 448 aa  63.9  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  28.46 
 
 		 1094 aa  63.5  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0927  TPR repeat-containing protein  30.51 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  36.19 
 
 		 1676 aa  63.2  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  36.96 
 
 		 837 aa  62.8  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  34.62 
 
 		 1827 aa  62.4  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.17 
 
 		 1056 aa  62  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 265 aa  61.6  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  28.93 
 
 		 1192 aa  61.2  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  27.1 
 
 		 1276 aa  60.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 		 265 aa  61.6  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0302  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 337 aa  60.8  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.642139  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  35 
 
 		 409 aa  60.8  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1755  TPR repeat-containing protein  30.09 
 
 		 647 aa  60.8  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0455441 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 409 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35 
 
 		 2240 aa  60.1  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  33.61 
 
 		 739 aa  60.8  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  27.83 
 
 		 649 aa  60.5  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  31.3 
 
 		 329 aa  60.1  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  30.84 
 
 		 968 aa  60.1  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 		 1297 aa  59.7  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  33.33 
 
 		 594 aa  60.1  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  33.61 
 
 		 564 aa  60.1  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  31.09 
 
 		 740 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  28.32 
 
 		 764 aa  59.7  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2204  TPR repeat-containing protein  25.6 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0332088  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  30.67 
 
 		 4079 aa  59.3  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  27.5 
 
 		 279 aa  58.9  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.45 
 
 		 836 aa  58.9  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  32.17 
 
 		 739 aa  58.5  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.72 
 
 		 632 aa  58.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 935 aa  58.5  0.00000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 792 aa  58.5  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1876  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.17 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0996  TPR repeat-containing protein  26.62 
 
 		 499 aa  58.5  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0468556 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  27.64 
 
 		 543 aa  58.2  0.00000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  36.19 
 
 		 936 aa  58.2  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 250 aa  58.2  0.00000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  30.63 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0035  TPR repeat-containing protein  26.89 
 
 		 402 aa  57.8  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.446314  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1206  hypothetical protein  28.93 
 
 		 436 aa  58.2  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1208  TPR repeat-containing protein  33.03 
 
 		 389 aa  58.2  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.675891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0564  TPR repeat-containing protein  28.32 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.151741 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  35.37 
 
 		 561 aa  57.4  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  30.89 
 
 		 685 aa  57  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  31.54 
 
 		 909 aa  57.4  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5618  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  33.33 
 
 		 739 aa  57.4  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.645263 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.26 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  26.55 
 
 		 661 aa  57.4  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.26 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  33.33 
 
 		 576 aa  57.4  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  35.37 
 
 		 561 aa  57.4  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  29.57 
 
 		 742 aa  57  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3428  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  28.7 
 
 		 820 aa  57  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.43 
 
 		 988 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  29.23 
 
 		 622 aa  56.6  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  29.75 
 
 		 1764 aa  56.6  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3472  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.23 
 
 		 916 aa  56.6  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00045069  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.7 
 
 		 1022 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>