More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1049 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1049  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 421 aa  824    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  51.9 
 
 		 474 aa  387  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  47.59 
 
 		 440 aa  319  7.999999999999999e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  46.19 
 
 		 441 aa  315  9.999999999999999e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  45.23 
 
 		 446 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  40.66 
 
 		 424 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  42.12 
 
 		 419 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  44.36 
 
 		 432 aa  297  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  41.6 
 
 		 447 aa  296  4e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  47.28 
 
 		 418 aa  293  4e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  41.84 
 
 		 413 aa  291  1e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  46.05 
 
 		 412 aa  288  9e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0181  major facilitator superfamily MFS_1  42.97 
 
 		 401 aa  288  2e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  40.94 
 
 		 418 aa  286  5.999999999999999e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  38 
 
 		 423 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0990  major facilitator transporter  47.75 
 
 		 414 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00457828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  41.22 
 
 		 428 aa  273  5.000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0950  hypothetical protein  45.29 
 
 		 414 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  39.22 
 
 		 421 aa  269  7e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  38.27 
 
 		 412 aa  268  1e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  42.71 
 
 		 426 aa  267  2.9999999999999995e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0651  major facilitator superfamily MFS_1  40.3 
 
 		 413 aa  267  2.9999999999999995e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  37.56 
 
 		 409 aa  266  5.999999999999999e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3626  major facilitator transporter  41.52 
 
 		 413 aa  265  8e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  36.22 
 
 		 430 aa  261  2e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  36.56 
 
 		 410 aa  260  3e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1281  major facilitator transporter  34.17 
 
 		 413 aa  259  8e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.835892  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5212  major facilitator superfamily MFS_1  42.71 
 
 		 408 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0948922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  41.35 
 
 		 474 aa  258  1e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  38.93 
 
 		 431 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1011  major facilitator superfamily MFS_1  46.92 
 
 		 414 aa  247  2e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1008  major facilitator superfamily MFS_1  46.65 
 
 		 414 aa  246  4e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4358  major facilitator transporter  42.78 
 
 		 426 aa  242  1e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.569485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0107  hypothetical protein  35.66 
 
 		 423 aa  241  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0053883 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1613  major facilitator superfamily MFS_1  35.51 
 
 		 418 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000260989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0823  major facilitator superfamily MFS_1  41.94 
 
 		 418 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  35.4 
 
 		 436 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  36.32 
 
 		 433 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2627  major facilitator transporter  37.88 
 
 		 410 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  36.94 
 
 		 442 aa  232  9e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  34.67 
 
 		 440 aa  231  2e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  39.09 
 
 		 461 aa  231  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  38.17 
 
 		 456 aa  230  3e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  37.76 
 
 		 441 aa  229  7e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6343  major facilitator superfamily MFS_1  40.37 
 
 		 435 aa  228  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  hitchhiker  0.000175269 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0242  putative integral membrane efflux protein  37.8 
 
 		 424 aa  228  2e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.305732  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7163  major facilitator superfamily MFS_1  37.11 
 
 		 414 aa  228  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.886054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1620  major facilitator superfamily MFS_1  33.17 
 
 		 417 aa  226  4e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1677  hypothetical protein  36.13 
 
 		 435 aa  225  1e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  34.72 
 
 		 429 aa  225  1e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  38.21 
 
 		 450 aa  223  6e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3035  MFS family transporter  37.72 
 
 		 425 aa  222  8e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3762  major facilitator transporter  37.41 
 
 		 425 aa  222  9e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0491  major facilitator superfamily MFS_1  36.92 
 
 		 424 aa  222  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  37.5 
 
 		 414 aa  221  3e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  38.54 
 
 		 413 aa  219  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  35.79 
 
 		 450 aa  218  2e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5797  hypothetical protein  41.15 
 
 		 419 aa  216  5e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30800  arabinose efflux permease family protein  38.25 
 
 		 452 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0844  major facilitator superfamily MFS_1  37.67 
 
 		 403 aa  211  2e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  35.04 
 
 		 431 aa  211  2e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3976  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 407 aa  211  3e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  38.42 
 
 		 417 aa  210  3e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7222  major facilitator transporter  35.23 
 
 		 441 aa  210  5e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1327  major facilitator superfamily MFS_1  36.65 
 
 		 433 aa  208  2e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0110  major facilitator transporter  37.08 
 
 		 429 aa  207  4e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4005  major facilitator superfamily MFS_1  36.39 
 
 		 442 aa  205  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  37.2 
 
 		 446 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2847  major facilitator superfamily MFS_1  36.96 
 
 		 432 aa  204  2e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2814  major facilitator superfamily MFS_1  37.27 
 
 		 402 aa  204  3e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2952  major facilitator transporter  36.07 
 
 		 405 aa  202  9e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  35.23 
 
 		 415 aa  201  1.9999999999999998e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1813  major facilitator superfamily permease  31.78 
 
 		 410 aa  201  1.9999999999999998e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  29.43 
 
 		 403 aa  200  3e-50  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3727  major facilitator transporter  35.6 
 
 		 416 aa  200  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5851  major facilitator superfamily MFS_1  35.32 
 
 		 425 aa  199  7.999999999999999e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.917844  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3542  major facilitator superfamily MFS_1  40.79 
 
 		 405 aa  199  7.999999999999999e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00114528  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0746  hypothetical protein  30.81 
 
 		 431 aa  199  9e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0165656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2848  major facilitator superfamily MFS_1  37.63 
 
 		 426 aa  198  1.0000000000000001e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3288  major facilitator superfamily protein  38.35 
 
 		 405 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.234831 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  33.08 
 
 		 426 aa  197  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1700  hypothetical protein  35.86 
 
 		 412 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0819  major facilitator superfamily MFS_1  39.57 
 
 		 452 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2022  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  35.37 
 
 		 446 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384962  normal  0.0286256 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4177  major facilitator superfamily MFS_1  35.34 
 
 		 476 aa  196  5.000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4296  major facilitator transporter  35.08 
 
 		 416 aa  195  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970953 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0506  major facilitator transporter  35.16 
 
 		 426 aa  194  3e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.204304  hitchhiker  0.00963798 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0792  major facilitator transporter  37 
 
 		 450 aa  194  3e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4055  major facilitator transporter  35.08 
 
 		 413 aa  193  6e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4311  major facilitator transporter  35.08 
 
 		 413 aa  193  6e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3206  major facilitator transporter  35.08 
 
 		 413 aa  192  8e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130501  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  35.31 
 
 		 457 aa  192  8e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1259  major facilitator transporter  35.85 
 
 		 491 aa  192  8e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0884652  normal  0.0333983 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  35.7 
 
 		 428 aa  192  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0418  major facilitator transporter  35.75 
 
 		 426 aa  192  1e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0331  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 412 aa  191  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0786  major facilitator transporter  34.64 
 
 		 418 aa  189  7e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1250  major facilitator superfamily MFS_1  36.89 
 
 		 378 aa  189  7e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5002  MFS family membrane efflux protein  35 
 
 		 441 aa  188  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  35.71 
 
 		 453 aa  187  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>