More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1036 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 202 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  71.36 
 
 		 242 aa  278  5e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1919  Lytic transglycosylase catalytic  52.12 
 
 		 199 aa  168  5e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0050  lytic transglycosylase, catalytic  49.43 
 
 		 211 aa  165  5e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  49.44 
 
 		 212 aa  157  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  46.52 
 
 		 202 aa  156  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2486  lytic transglycosylase, catalytic  47.95 
 
 		 198 aa  148  5e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000427479  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  47.43 
 
 		 203 aa  147  9e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000518233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  44.32 
 
 		 188 aa  144  8.000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  45.45 
 
 		 204 aa  144  9e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  45.99 
 
 		 204 aa  144  9e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  64.15 
 
 		 438 aa  144  1e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  55.74 
 
 		 235 aa  138  4.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0827  lytic transglycosylase, catalytic  45.64 
 
 		 206 aa  137  7.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  51.64 
 
 		 191 aa  136  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2404  Lytic transglycosylase catalytic  56.3 
 
 		 216 aa  135  5e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1173  lytic transglycosylase catalytic  42.86 
 
 		 195 aa  135  5e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.79573  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2744  lytic transglycosylase, catalytic  56.03 
 
 		 228 aa  135  6.0000000000000005e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1129  Lytic transglycosylase catalytic  42.37 
 
 		 200 aa  134  9e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  53.66 
 
 		 217 aa  132  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  52.38 
 
 		 283 aa  132  3.9999999999999996e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0748  lytic transglycosylase, catalytic  55.65 
 
 		 146 aa  132  3.9999999999999996e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00376609  normal  0.892869 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  54.55 
 
 		 196 aa  131  6.999999999999999e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  55 
 
 		 261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  58.88 
 
 		 291 aa  129  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  50.41 
 
 		 280 aa  129  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  52.07 
 
 		 207 aa  128  6e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  49.62 
 
 		 189 aa  127  9.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3650  lytic transglycosylase, catalytic  39.41 
 
 		 243 aa  125  5e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  62.96 
 
 		 199 aa  125  6e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2905  lytic transglycosylase, catalytic  43.45 
 
 		 237 aa  124  7e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.739036  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  57.52 
 
 		 318 aa  124  7e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  41.18 
 
 		 226 aa  124  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  51.26 
 
 		 206 aa  123  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  51.75 
 
 		 233 aa  123  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  53.1 
 
 		 174 aa  122  3e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0139  lytic transglycosylase catalytic  42.11 
 
 		 299 aa  122  4e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0159  lytic transglycosylase, catalytic  37.77 
 
 		 245 aa  122  5e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3830  lytic transglycosylase, catalytic  38.6 
 
 		 239 aa  121  7e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.582426 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3923  lytic transglycosylase, catalytic  38.6 
 
 		 239 aa  121  7e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4039  lytic transglycosylase, catalytic  38.6 
 
 		 239 aa  121  7e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0517  lytic transglycosylase, catalytic  41.88 
 
 		 208 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4660  transglycosylase SLT domain-containing protein  39.08 
 
 		 239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3686  lytic transglycosylase catalytic  42.78 
 
 		 209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  51.75 
 
 		 245 aa  119  3e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28610  lytic transglycosylase  57.02 
 
 		 201 aa  119  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1300  Lytic transglycosylase catalytic  40.72 
 
 		 218 aa  119  3e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0023245  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3705  Lytic transglycosylase catalytic  40.11 
 
 		 209 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3631  Lytic transglycosylase catalytic  40.11 
 
 		 209 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1332  Lytic transglycosylase catalytic  47.65 
 
 		 194 aa  118  4.9999999999999996e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0695277  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4244  lytic transglycosylase catalytic  38.6 
 
 		 251 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3860  lytic transglycosylase, catalytic  41.57 
 
 		 329 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4205  Lytic transglycosylase catalytic  38.6 
 
 		 251 aa  118  6e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4378  lytic transglycosylase catalytic  38.6 
 
 		 251 aa  118  6e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2008  transglycosylase SLT domain-containing protein  38.76 
 
 		 214 aa  118  7e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2464  lytic transglycosylase, catalytic  50 
 
 		 442 aa  118  7e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329237 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0370  Lytic transglycosylase catalytic  42.11 
 
 		 216 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.149841 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6404  lytic transglycosylase catalytic  50.83 
 
 		 362 aa  117  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0649822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  38.07 
 
 		 247 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00442  soluble lytic murein transglycosylase  54.46 
 
 		 328 aa  116  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.129314  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0046  Lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 		 244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0192  transglycosylase, putative  42.11 
 
 		 221 aa  115  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0931975  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1946  soluble lytic murein transglycosylase precursor  40.84 
 
 		 297 aa  115  3e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.378225  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0393  lytic transglycosylase, catalytic  48.7 
 
 		 305 aa  115  3e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.168274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0096  lytic transglycosylase, catalytic  36.47 
 
 		 249 aa  115  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0352  lytic transglycosylase  47.83 
 
 		 273 aa  115  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0512  Lytic transglycosylase catalytic  48.06 
 
 		 154 aa  114  7.999999999999999e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.318275 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  52.03 
 
 		 282 aa  114  7.999999999999999e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1881  lytic transglycosylase catalytic  40.31 
 
 		 297 aa  114  7.999999999999999e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.520099  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  55.65 
 
 		 327 aa  114  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3565  lytic transglycosylase, catalytic  38.98 
 
 		 209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6881  Lytic transglycosylase catalytic  58.88 
 
 		 271 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987079  normal  0.0912273 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2410  lytic transglycosylase, catalytic  42.68 
 
 		 208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4758  transglycosylase SLT domain-containing protein  37.91 
 
 		 217 aa  112  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4016  lytic transglycosylase, catalytic  49.14 
 
 		 239 aa  112  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0926261  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9819  type IV system transglycosylase  49.17 
 
 		 362 aa  112  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2827  Lytic transglycosylase catalytic  50.45 
 
 		 263 aa  112  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1632  Lytic transglycosylase catalytic  51.28 
 
 		 222 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0239259  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  48.41 
 
 		 260 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  53.33 
 
 		 368 aa  112  6e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  47.69 
 
 		 260 aa  111  6e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3565  Lytic transglycosylase catalytic  47.15 
 
 		 158 aa  111  6e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1605  lytic murein transglycosylase  49.57 
 
 		 202 aa  111  6e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.914455  normal  0.613396 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1360  Lytic transglycosylase catalytic  55.77 
 
 		 304 aa  111  8.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2291  putative transglycosylase protein  41.34 
 
 		 198 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3220  lytic transglycosylase, catalytic  42.63 
 
 		 212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1974  lytic transglycosylase, catalytic  55.14 
 
 		 203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  48.67 
 
 		 197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2357  lytic transglycosylase, catalytic  37.44 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500098  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0307  lytic transglycosylase, catalytic  47.93 
 
 		 332 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0367  lytic transglycosylase, catalytic  37.57 
 
 		 215 aa  109  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  38.14 
 
 		 197 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2342  lytic transglycosylase, catalytic  48.55 
 
 		 272 aa  109  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2340  lytic transglycosylase, catalytic  38.14 
 
 		 218 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0348  lytic transglycosylase, catalytic  40.22 
 
 		 204 aa  108  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2926  putative transglycolase  58.88 
 
 		 278 aa  108  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2520  lytic transglycosylase, catalytic  38.5 
 
 		 280 aa  108  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  47.54 
 
 		 251 aa  108  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  48.72 
 
 		 241 aa  108  7.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1871  lytic transglycosylase, catalytic  44.35 
 
 		 281 aa  108  7.000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000100876  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>