224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0978 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0978  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 254 aa  495  1e-139  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.114884 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0713  MerR family transcriptional regulator  85.71 
 
 		 127 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.245561  normal  0.461713 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2633  MerR family transcriptional regulator  77.03 
 
 		 123 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0483  transcriptional regulator, MerR family  62.89 
 
 		 141 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0051  transcriptional regulator, MerR family  57.89 
 
 		 113 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1782  MerR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 266 aa  82.4  0.000000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.139972 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1722  hypothetical protein  36.13 
 
 		 245 aa  82  0.000000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.22489 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3922  MerR family transcriptional regulator  54.93 
 
 		 144 aa  81.3  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.856583  normal  0.167239 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0650  transcriptional regulator, MerR family  46.91 
 
 		 172 aa  80.5  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00809015 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1881  putative transcriptional regulator  47.44 
 
 		 157 aa  80.1  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.027165 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1889  transcriptional regulator, MerR family  48 
 
 		 116 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000504717  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0291  hypothetical protein  42.22 
 
 		 109 aa  79.3  0.00000000000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2991  transcriptional regulator, MerR family  54.93 
 
 		 108 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.950452  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1752  MerR family transcriptional regulator  49.33 
 
 		 161 aa  78.2  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0206721 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1521  MerR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 150 aa  78.2  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0401274  normal  0.779885 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1268  MerR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 272 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.194356 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3377  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.680996  normal  0.153202 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2610  MerR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 281 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1366  MerR family transcriptional regulator  45 
 
 		 137 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1406  MerR family transcriptional regulator  45 
 
 		 137 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3096  MerR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 140 aa  77.4  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0714876 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1914  MerR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 282 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.346124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0108  MerR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 124 aa  77  0.0000000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1167  MerR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.354578  normal  0.670626 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1551  MerR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 132 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.724017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3038  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 125 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0025515  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2678  MerR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 252 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00961924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1996  MerR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 141 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000181748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1588  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 195 aa  76.3  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1147  MerR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 118 aa  75.9  0.0000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0571667  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2223  transcriptional regulator, MerR family  43.18 
 
 		 112 aa  75.9  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000299442 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1970  transcriptional regulator, MerR family  47.3 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.858434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1997  transcriptional regulator, MerR family  43.18 
 
 		 112 aa  75.5  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1089  MerR family transcriptional regulator  45 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1898  MerR family regulatory protein  45 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1418  MerR family transcriptional regulator  48.19 
 
 		 116 aa  75.5  0.0000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000205103  normal  0.491097 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1532  MerR family transcriptional regulator  45 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.591284  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0434  MerR family transcriptional regulator  48.61 
 
 		 120 aa  75.9  0.0000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0196  MerR family transcriptional regulator  45 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.196176  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1719  MerR family transcriptional regulator  45 
 
 		 134 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1742  MerR family transcriptional regulator  45 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.405254  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1416  MerR family transcriptional regulator  51.43 
 
 		 130 aa  75.5  0.0000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0849625  normal  0.242004 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1772  MerR family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 136 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.328935  normal  0.318397 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0970  MerR family transcriptional regulator  45 
 
 		 126 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01390  transcription regulator protein  40.66 
 
 		 118 aa  75.1  0.0000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.249906  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1640  transcriptional regulator, MerR family  47.3 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.402978  normal  0.373133 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1000  MerR family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 137 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.861508  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1482  MerR family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 137 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.858746  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1457  transcriptional regulator, MerR family  41.11 
 
 		 118 aa  75.1  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2621  MerR family transcriptional regulator  50.72 
 
 		 117 aa  75.1  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.361193  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4609  MerR family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 136 aa  75.1  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.401376  normal  0.0601167 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1409  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 206 aa  75.1  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.783915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4622  MerR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 137 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.206932  normal  0.899334 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1378  MerR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 137 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0815083  normal  0.541754 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0761  MerR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 118 aa  74.7  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0874748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1459  MerR family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 137 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2301  MerR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 122 aa  75.1  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2852  MerR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 130 aa  74.7  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.164617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4387  MerR family transcriptional regulator  48.61 
 
 		 757 aa  74.7  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1584  putative transcription regulator protein  47.3 
 
 		 146 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1282  MerR family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 143 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1014  MerR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 121 aa  74.3  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00986669 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0912  MerR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 840 aa  73.9  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0919  transcriptional regulator, MerR family  47.22 
 
 		 118 aa  74.3  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2092  MerR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 118 aa  73.9  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.681298  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2393  MerR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 142 aa  73.9  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.161279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1455  transcriptional regulator, MerR family  45.95 
 
 		 142 aa  73.9  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4629  MerR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 187 aa  73.9  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00782953  normal  0.030329 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1313  transcriptional regulator, MerR family  43.04 
 
 		 173 aa  74.3  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3558  MerR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 136 aa  73.6  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.994671 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3018  transcriptional regulator, MerR family  44.87 
 
 		 126 aa  73.6  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.438934  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2588  MerR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 134 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2013  MerR family transcriptional regulator  50.72 
 
 		 120 aa  73.2  0.000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.065719  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0494  MerR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 121 aa  73.2  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0739492  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3741  transcriptional regulator, MerR family  51.43 
 
 		 112 aa  72.8  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.274926  normal  0.767741 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2652  MerR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 227 aa  72.4  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00282985  normal  0.0609514 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2054  MerR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 121 aa  72.4  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1522  transcriptional regulator, putative  52.17 
 
 		 117 aa  72.4  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0919543  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2749  transcriptional regulator, MerR family  47.22 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2670  regulatory protein, MerR  39.56 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.988026 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1633  hypothetical protein  40 
 
 		 181 aa  72.4  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2236  transcriptional regulator, MerR family  37.07 
 
 		 150 aa  72  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.039823 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2109  MerR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 159 aa  72  0.000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.208629  normal  0.127157 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2607  transcriptional regulator, MerR family  37.07 
 
 		 150 aa  72  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2688  regulatory protein, MerR  42.5 
 
 		 229 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.539161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1471  transcriptional regulator domain-containing protein  43.24 
 
 		 126 aa  71.6  0.00000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.22835  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1408  transcriptional regulator, MerR family  43.24 
 
 		 126 aa  71.6  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00332069  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0640  MerR family transcriptional regulator  49.3 
 
 		 168 aa  71.2  0.00000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0836  MerR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 116 aa  71.6  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1983  MerR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 118 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00884217  normal  0.359201 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2511  hypothetical protein  44.44 
 
 		 118 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1288  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 179 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.287887  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2385  transcriptional regulator, putative  39.18 
 
 		 118 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.170009  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2169  regulatory protein, MerR  39.18 
 
 		 118 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1938  MerR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 118 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.24556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2364  MerR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 151 aa  70.9  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0163  MerR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 126 aa  70.5  0.00000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1343  MerR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 149 aa  71.2  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28730  putative transcriptional regulator  44.44 
 
 		 118 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000134436  hitchhiker  0.00000000749265 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2798  transcriptional regulator, MerR family  47.83 
 
 		 118 aa  70.9  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>