More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0938 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1984  putative oxidoreductase  71.22 
 
 
473 aa  660    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.292785  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1250  putative oxidoreductase  75.43 
 
 
476 aa  711    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3635  putative oxidoreductase  74.15 
 
 
476 aa  705    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000713283  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0938  putative oxidoreductase  100 
 
 
481 aa  970    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0766  putative oxidoreductase  82.01 
 
 
476 aa  758    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0956688 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0313  putative oxidoreductase  68.75 
 
 
473 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0651  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  57.63 
 
 
466 aa  524  1e-147  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.990694  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0489  putative oxidoreductase  56.38 
 
 
482 aa  518  1.0000000000000001e-145  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0617  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  58.75 
 
 
466 aa  518  1.0000000000000001e-145  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.268237  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06470  glutamate synthase (NADPH) small subunit  55.53 
 
 
476 aa  513  1e-144  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000571005  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2002  putative oxidoreductase  55.93 
 
 
480 aa  514  1e-144  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.14117  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0372  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  56.13 
 
 
464 aa  508  1e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.63559  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2545  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  57.02 
 
 
464 aa  506  9.999999999999999e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000029955  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0317  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  56.33 
 
 
469 aa  503  1e-141  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000287651  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0537  putative oxidoreductase  54.45 
 
 
480 aa  503  1e-141  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0493  putative oxidoreductase  55.32 
 
 
477 aa  503  1e-141  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0661627  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0436  putative oxidoreductase  55.11 
 
 
482 aa  503  1e-141  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.259877  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1163  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  57.73 
 
 
457 aa  503  1e-141  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1693  putative oxidoreductase  56.29 
 
 
483 aa  500  1e-140  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.195871  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3501  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  59.78 
 
 
463 aa  501  1e-140  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.860483  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1068  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  56.09 
 
 
461 aa  496  1e-139  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000664223  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_36  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  54.88 
 
 
465 aa  497  1e-139  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.800256  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1517  putative oxidoreductase  58.06 
 
 
463 aa  497  1e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0035  putative oxidoreductase  55.41 
 
 
465 aa  498  1e-139  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0177614  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0038  putative oxidoreductase  54.98 
 
 
465 aa  492  9.999999999999999e-139  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.237423  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0283  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  54.53 
 
 
464 aa  489  1e-137  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0227  putative oxidoreductase  57.2 
 
 
469 aa  487  1e-136  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.967797 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2781  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  54.94 
 
 
497 aa  486  1e-136  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.662826  normal  0.751178 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1071  putative oxidoreductase  56.75 
 
 
468 aa  484  1e-135  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.188657  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1607  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  54.16 
 
 
467 aa  483  1e-135  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1463  putative oxidoreductase  53.98 
 
 
468 aa  484  1e-135  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1263  putative oxidoreductase  53.86 
 
 
468 aa  484  1e-135  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00449905  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1328  putative oxidoreductase  55 
 
 
455 aa  479  1e-134  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.100001  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2150  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  53.96 
 
 
480 aa  478  1e-134  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60175  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1151  putative oxidoreductase  55.19 
 
 
468 aa  475  1e-133  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0551  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  54.91 
 
 
479 aa  472  1e-132  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0793  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  54.25 
 
 
761 aa  474  1e-132  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.272826  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1304  putative oxidoreductase  54.55 
 
 
468 aa  467  9.999999999999999e-131  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0752  putative oxidoreductase  56.36 
 
 
470 aa  465  9.999999999999999e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000025302  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2596  putative oxidoreductase  53.77 
 
 
469 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.712045  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2830  putative oxidoreductase  55.65 
 
 
469 aa  458  9.999999999999999e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00165731  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0337  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  52.37 
 
 
467 aa  460  9.999999999999999e-129  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1111  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  54.16 
 
 
469 aa  457  1e-127  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1900  putative bifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta  54.13 
 
 
747 aa  457  1e-127  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.22072  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1138  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  51.23 
 
 
458 aa  456  1e-127  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2033  glutamate synthase, small subunit  50.86 
 
 
462 aa  452  1.0000000000000001e-126  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000276272 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0407  putative oxidoreductase  52.03 
 
 
503 aa  454  1.0000000000000001e-126  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0863164  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0644  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  52.7 
 
 
474 aa  453  1.0000000000000001e-126  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000739676  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2934  putative oxidoreductase  53.57 
 
 
459 aa  451  1.0000000000000001e-126  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.912851  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0550  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  50.86 
 
 
463 aa  451  1e-125  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0820  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  52.48 
 
 
466 aa  446  1.0000000000000001e-124  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3057  putative oxidoreductase  52.81 
 
 
470 aa  433  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2411  putative oxidoreductase  52.3 
 
 
471 aa  432  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000146466  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0167  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  49.89 
 
 
465 aa  433  1e-120  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.609581  normal  0.315729 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0021  putative oxidoreductase  52.6 
 
 
469 aa  432  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0084  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  51.72 
 
 
476 aa  429  1e-119  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0715068  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2748  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  49.68 
 
 
1005 aa  430  1e-119  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.036886  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0020  putative oxidoreductase  52.6 
 
 
469 aa  431  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1828  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  51.86 
 
 
448 aa  421  1e-116  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.756124 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2977  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  49.05 
 
 
1011 aa  415  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.118712  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2791  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  49.57 
 
 
1008 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1006  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  48.93 
 
 
994 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2885  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  49.68 
 
 
1011 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1282  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  50.87 
 
 
447 aa  415  1e-114  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2796  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  47.79 
 
 
477 aa  410  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144083  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1112  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  50.66 
 
 
446 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0745  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  49.14 
 
 
994 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.375637  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1117  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  49.33 
 
 
447 aa  392  1e-108  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0703  putative bifunctional glutamate synthase subunit beta/2-polyprenylphenol hydroxylase  45.3 
 
 
944 aa  352  7e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0958  putative bifunctional glutamate synthase subunit beta/2-polyprenylphenol hydroxylase  44.05 
 
 
944 aa  350  3e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0850  putative bifunctional glutamate synthase subunit beta/2-polyprenylphenol hydroxylase  43.42 
 
 
942 aa  347  3e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5203  putative bifunctional glutamate synthase subunit beta/2-polyprenylphenol hydroxylase  43.63 
 
 
944 aa  345  1e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1069  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  43.47 
 
 
465 aa  340  2.9999999999999998e-92  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000858078  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3208  putative bifunctional glutamate synthase subunit beta/2-polyprenylphenol hydroxylase  43.42 
 
 
947 aa  335  1e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.950859  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4566  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.11 
 
 
438 aa  306  5.0000000000000004e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000191225  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0824  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45.05 
 
 
1126 aa  303  4.0000000000000003e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2212  putative oxidoreductase  40.49 
 
 
465 aa  301  2e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0539  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  37.66 
 
 
483 aa  296  5e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000497626  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2825  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  41.45 
 
 
699 aa  291  2e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0659  putative oxidoreductase  39.39 
 
 
485 aa  290  4e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.247758  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2822  putative oxidoreductase  38.33 
 
 
480 aa  287  2e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.289366  normal  0.925781 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2963  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  38.18 
 
 
658 aa  284  2.0000000000000002e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.594165 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1057  glutamate synthase subunit beta  40 
 
 
469 aa  281  1e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3792  glutamate synthase subunit beta  36.97 
 
 
472 aa  280  3e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0271  glutamate synthase, small subunit  39.27 
 
 
467 aa  280  3e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0925346 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02719  fused predicted oxidoreductase: Fe-S subunit/nucleotide-binding subunit  37.68 
 
 
639 aa  280  4e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.645613  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3046  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  37.68 
 
 
639 aa  280  4e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0331  putative oxidoreductase  39.01 
 
 
484 aa  279  9e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.452529  normal  0.32183 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2614  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  37.39 
 
 
659 aa  279  9e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4951  putative oxidoreductase  40.43 
 
 
481 aa  278  1e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.279273  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4176  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  37.82 
 
 
641 aa  278  1e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.623364  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02359  fused predicted oxidoreductase: FeS binding subunit/NAD/FAD-binding subunit  37.39 
 
 
659 aa  278  2e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1202  glutamate synthase, small subunit  37.39 
 
 
659 aa  278  2e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3212  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  37.82 
 
 
639 aa  278  2e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.845239  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2747  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  37.17 
 
 
659 aa  278  2e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2597  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  37.39 
 
 
659 aa  278  2e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2138  putative oxidoreductase  38.02 
 
 
480 aa  278  2e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02321  hypothetical protein  37.39 
 
 
659 aa  278  2e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1209  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  37.39 
 
 
659 aa  278  2e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5075  glutamate synthase subunit beta  38.36 
 
 
472 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>