More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0903 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0903  CinA domain protein  100 
 
 		 218 aa  422  1e-117  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00227133 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1960  CinA domain-containing protein  61.84 
 
 		 164 aa  185  4e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1522  hypothetical protein  59.35 
 
 		 168 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3016  CinA domain-containing protein  53.37 
 
 		 166 aa  160  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633216  hitchhiker  0.000000000145641 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3162  CinA domain protein  54.67 
 
 		 160 aa  159  3e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17520  hypothetical protein  58.06 
 
 		 168 aa  158  7e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0842  competence damage-inducible protein A  43.35 
 
 		 413 aa  157  8e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.89652  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4031  CinA domain-containing protein  60.54 
 
 		 160 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.306417  unclonable  0.0000000000000327829 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1458  CinA-like  53.37 
 
 		 161 aa  155  4e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0695046  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  52.63 
 
 		 420 aa  155  4e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3733  CinA domain-containing protein  52.17 
 
 		 166 aa  154  8e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000115453 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1628  CinA domain-containing protein  58.5 
 
 		 160 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122371  normal  0.187928 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  50.57 
 
 		 414 aa  153  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38570  CinA-related protein  56.69 
 
 		 164 aa  152  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  51.68 
 
 		 415 aa  152  4e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4089  CinA domain-containing protein  57.82 
 
 		 160 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0971  CinA domain protein  56.25 
 
 		 160 aa  151  5.9999999999999996e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00476179  hitchhiker  0.00000668573 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0354  CinA domain-containing protein  55.21 
 
 		 179 aa  151  5.9999999999999996e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3733  competence/damage-inducible protein CinA  52.41 
 
 		 414 aa  151  7e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0833  CinA domain protein  44.59 
 
 		 156 aa  150  2e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1230  CinA domain-containing protein  57.82 
 
 		 160 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000000125807 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2477  CinA domain protein  50.98 
 
 		 156 aa  148  8e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0225  competence/damage-inducible protein CinA  47.37 
 
 		 408 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02550  competence damage-inducible protein A  53.33 
 
 		 165 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0187741  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0989  CinA domain protein  53.33 
 
 		 165 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00650499  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2823  competence damage-inducible protein A  53.33 
 
 		 165 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0804324  hitchhiker  0.00000514203 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  54.74 
 
 		 420 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0227  competence/damage-inducible protein CinA  47.37 
 
 		 408 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2984  competence damage-inducible protein A  53.33 
 
 		 165 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0375437  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2836  competence damage-inducible protein A  53.33 
 
 		 165 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.193332  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1012  competence damage-inducible protein A  53.33 
 
 		 165 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000218203 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02515  hypothetical protein  53.33 
 
 		 165 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0457216  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4034  cinA domain protein  53.21 
 
 		 166 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.344001  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2981  competence damage-inducible protein A  53.33 
 
 		 165 aa  145  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355767  decreased coverage  0.0000723064 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3139  competence damage-inducible protein A  53.33 
 
 		 165 aa  145  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000242069 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3947  competence damage-inducible protein A  53.33 
 
 		 165 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.388392  normal  0.701681 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2949  competence damage-inducible protein A  53.33 
 
 		 165 aa  145  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1287  CinA-like  50.94 
 
 		 166 aa  145  5e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3032  competence damage-inducible protein A  52.67 
 
 		 165 aa  144  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.162361  hitchhiker  0.00262793 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1174  CinA-like  55.1 
 
 		 177 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348746 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03080  CinA-like protein  45.66 
 
 		 179 aa  144  8.000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.25785  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3016  competence damage-inducible protein A  52.67 
 
 		 165 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.047861  decreased coverage  0.0000000741829 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  40.22 
 
 		 413 aa  142  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2330  competence/damage-inducible protein CinA  46.67 
 
 		 418 aa  143  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.261185 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0143  competence/damage-inducible protein CinA  55.47 
 
 		 413 aa  142  4e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0995  competence damage-inducible protein A  51.7 
 
 		 172 aa  142  4e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108193  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3177  competence damage-inducible protein A  52 
 
 		 165 aa  142  4e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.266216  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3667  CinA domain-containing protein  54.86 
 
 		 173 aa  141  6e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  46.9 
 
 		 415 aa  141  7e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1285  CinA domain protein  53.42 
 
 		 165 aa  141  8e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.982148  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1563  CinA domain protein  46.7 
 
 		 196 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  49.01 
 
 		 413 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2757  CinA domain-containing protein  48.98 
 
 		 166 aa  139  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.439876  normal  0.642955 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0708  CinA domain-containing protein  52.98 
 
 		 163 aa  139  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5905  competence/damage-inducible protein CinA  52.35 
 
 		 437 aa  139  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0429  CinA domain-containing protein  52.32 
 
 		 156 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.962415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1377  CinA, C-terminal  53.06 
 
 		 192 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.368331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1052  competence/damage-inducible protein CinA  47.89 
 
 		 413 aa  137  8.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000170345  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0196  competence/damage-inducible protein cinA  53.28 
 
 		 413 aa  137  8.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47995  normal  0.513575 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3175  competence damage-inducible protein A  50 
 
 		 166 aa  137  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.618843  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0483  CinA domain protein  58.16 
 
 		 184 aa  137  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0840  competence damage-inducible protein A  54 
 
 		 162 aa  137  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0987514  hitchhiker  0.00000024761 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3105  competence damage-inducible protein A  48 
 
 		 420 aa  137  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000208181  normal  0.532071 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0553  CinA domain-containing protein  48.3 
 
 		 166 aa  136  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0980  competence damage-inducible protein A  50.65 
 
 		 162 aa  136  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1113  competence damage-inducible protein A  52.6 
 
 		 164 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.383683  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0529  CinA domain-containing protein  48.3 
 
 		 184 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1471  competence/damage-inducible protein CinA  49.68 
 
 		 432 aa  135  4e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000360064  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0456  competence/damage-inducible protein CinA  46.1 
 
 		 423 aa  135  5e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0385  competence/damage inducible protein CinA  54.48 
 
 		 159 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3214  competence damage-inducible protein A  52.38 
 
 		 164 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3710  CinA-like  47.62 
 
 		 166 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.909582  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3921  CinA domain-containing protein  51.97 
 
 		 169 aa  135  6.0000000000000005e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0581  CinA domain-containing protein  50.69 
 
 		 175 aa  134  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1870  CinA-like  52.05 
 
 		 203 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4476  CinA-like  49.02 
 
 		 168 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1118  CinA domain protein  48.17 
 
 		 181 aa  134  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.43976  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0783  competence/damage-inducible protein CinA  45.45 
 
 		 401 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0596  CinA domain-containing protein  47.62 
 
 		 166 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.774081  normal  0.307484 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0055  CinA domain-containing protein  47.2 
 
 		 162 aa  133  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0067  competence/damage inducible protein CinA  47.2 
 
 		 162 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0145  CinA-like  47.62 
 
 		 166 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.774466  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0628  CinA domain-containing protein  47.62 
 
 		 166 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1922  competence damage-inducible protein A  47.4 
 
 		 411 aa  132  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0155904  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10710  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  49.38 
 
 		 371 aa  132  3e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00012453  unclonable  0.00000000162574 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0246  competence-damaged protein  49.67 
 
 		 424 aa  133  3e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00153  competence/damage-inducible protein CinA domain protein  53.02 
 
 		 164 aa  132  3e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1357  competence/damage-inducible protein CinA  45.45 
 
 		 417 aa  132  6e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03514  hypothetical protein  49.66 
 
 		 160 aa  131  6.999999999999999e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0902  competence damage-inducible protein A  48.63 
 
 		 184 aa  131  7.999999999999999e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3376  competence damage-inducible protein A  48.63 
 
 		 162 aa  131  9e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3241  competence damage-inducible protein A  48.63 
 
 		 162 aa  131  9e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.450801  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1257  hypothetical protein  44.29 
 
 		 419 aa  131  9e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.16075  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0279  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.7 
 
 		 365 aa  130  1.0000000000000001e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.374497  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0975  competence/damage-inducible domain-containing protein  46.21 
 
 		 365 aa  130  1.0000000000000001e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2526  competence/damage-inducible protein cinA  45.64 
 
 		 418 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  45 
 
 		 411 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1586  competence/damage-inducible protein CinA  44.37 
 
 		 408 aa  129  3e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105098  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07490  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  49.66 
 
 		 436 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.042487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0880  competence/damage-inducible protein CinA  46.71 
 
 		 166 aa  129  4.0000000000000003e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.630467  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>