200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0899 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0899  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 		 258 aa  500  1e-140  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000526315 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1957  hypothetical protein  59.09 
 
 		 238 aa  238  1e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1462  hypothetical protein  55.09 
 
 		 233 aa  234  7e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.376963  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3558  SNARE associated Golgi protein  59.13 
 
 		 722 aa  226  3e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.626844  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003943  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.09 
 
 		 228 aa  209  2e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2552  SNARE associated Golgi protein  47.98 
 
 		 231 aa  209  5e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1042  SNARE associated Golgi protein  47.51 
 
 		 236 aa  208  7e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.406672 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01787  mercuric reductase (Hg(II) reductase)  44.07 
 
 		 717 aa  208  7e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0589  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component and related enzyme  48.12 
 
 		 738 aa  207  1e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1392  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.07 
 
 		 722 aa  205  5e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0176  SNARE associated Golgi protein  48.42 
 
 		 716 aa  204  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2701  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  53.59 
 
 		 717 aa  202  3e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418324  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0977  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  43.64 
 
 		 722 aa  201  8e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0805308 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01579  hypothetical protein  43.3 
 
 		 229 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0395  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  41.35 
 
 		 713 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1621  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation protein  52.22 
 
 		 716 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143809  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2957  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  41.95 
 
 		 717 aa  195  6e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1326  hypothetical protein  45.41 
 
 		 229 aa  193  3e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0497167  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  51.49 
 
 		 746 aa  192  4e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0784754  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1709  SNARE associated Golgi protein  51.74 
 
 		 720 aa  180  2.9999999999999997e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794028 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3219  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  46.22 
 
 		 712 aa  178  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3750  hypothetical protein  41.23 
 
 		 239 aa  177  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1981  membrane protein  40.58 
 
 		 225 aa  177  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1694  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  49.71 
 
 		 214 aa  174  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1314  hypothetical protein  43.11 
 
 		 226 aa  170  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2456  hypothetical protein  43.52 
 
 		 224 aa  167  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00843119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1530  membrane protein  40.19 
 
 		 227 aa  167  1e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.221932  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2767  mercuric reductase, membrane-associated  40.78 
 
 		 713 aa  162  6e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.412379 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0910  SNARE associated Golgi protein-related protein  46.94 
 
 		 232 aa  159  4e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3653  mercuric reductase, membrane-associated  38.57 
 
 		 704 aa  159  4e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0190427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0458  SNARE associated Golgi protein  41.43 
 
 		 224 aa  157  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0474  SNARE associated Golgi protein  41.9 
 
 		 224 aa  157  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000739697 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1984  SNARE associated Golgi protein  41.04 
 
 		 228 aa  155  4e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1919  hypothetical protein  43.93 
 
 		 238 aa  137  2e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0193  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  43.18 
 
 		 705 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0303  SNARE associated Golgi protein  37.71 
 
 		 246 aa  115  5e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3384  hypothetical protein  36.15 
 
 		 252 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1788  SNARE associated Golgi protein  37.34 
 
 		 314 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.249086 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0389  SNARE associated Golgi protein  37.29 
 
 		 245 aa  108  8.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0929  SNARE associated Golgi protein  35.95 
 
 		 246 aa  105  6e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000396402 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0083  SNARE associated Golgi protein  39.53 
 
 		 266 aa  102  9e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1464  hypothetical protein  32.14 
 
 		 714 aa  100  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1519  hypothetical protein  31.63 
 
 		 714 aa  99  7e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0336  SNARE associated Golgi protein  36.7 
 
 		 243 aa  95.5  7e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.100106  normal  0.720347 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2726  SNARE associated Golgi protein  38.41 
 
 		 227 aa  91.7  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0192571  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1515  SNARE associated Golgi protein  32.86 
 
 		 220 aa  91.7  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.12103 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1109  SNARE associated Golgi protein  39.35 
 
 		 242 aa  90.1  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1058  hypothetical protein  33.33 
 
 		 242 aa  88.6  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.616769  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0644  hypothetical protein  31.92 
 
 		 244 aa  87.8  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.21783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4466  SNARE associated Golgi protein  32.97 
 
 		 282 aa  87  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0127359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2719  putative transmemebrane protein  33.33 
 
 		 238 aa  87.4  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.934003  normal  0.0999716 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4098  SNARE associated Golgi protein  32.97 
 
 		 282 aa  87  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.128977 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2230  SNARE associated Golgi protein  32.9 
 
 		 231 aa  85.5  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.571978 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1944  SNARE associated Golgi protein  36.05 
 
 		 223 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0795121  normal  0.25437 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  37.36 
 
 		 320 aa  81.6  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4579  SNARE associated Golgi protein  32.28 
 
 		 265 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.300931  normal  0.641108 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4073  SNARE associated Golgi protein  34.15 
 
 		 209 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0752  hypothetical protein  36.16 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4112  SNARE associated Golgi protein  34.15 
 
 		 209 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00687322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1993  hypothetical protein  37.76 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0939  hypothetical protein  40 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592056 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2090  hypothetical protein  37.59 
 
 		 238 aa  77.8  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2229  SNARE associated Golgi protein  37.32 
 
 		 264 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403746 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1971  transmembrane phospholipase protein  35.71 
 
 		 728 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1562  hypothetical protein  33.77 
 
 		 623 aa  77  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2775  hypothetical protein  33.12 
 
 		 250 aa  76.3  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6313  SNARE associated Golgi protein  36.46 
 
 		 739 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.250858 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5587  phospholipase D/transphosphatidylase  36.46 
 
 		 739 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.752263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0308  SNARE associated Golgi protein  37.84 
 
 		 229 aa  74.7  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4229  hypothetical protein  39.13 
 
 		 239 aa  75.1  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.713657 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5065  SNARE associated Golgi protein  32.72 
 
 		 267 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0698288 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4669  SNARE associated Golgi protein  41.67 
 
 		 240 aa  74.3  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1105  rhodanese domain-containing protein  36.51 
 
 		 325 aa  73.9  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0153774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24030  hypothetical protein  31.58 
 
 		 232 aa  73.2  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0199252 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1139  SNARE associated Golgi protein  31.37 
 
 		 724 aa  73.2  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1879  phospholipase D domain-containing protein  35.12 
 
 		 728 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.426352  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0071  ribosomal protein S16  33.7 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2072  integral membrane protein  37.16 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.721344  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0620  SNARE associated Golgi protein  32.8 
 
 		 224 aa  72.8  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  33.83 
 
 		 732 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670027  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6502  phospholipase D/transphosphatidylase  33.83 
 
 		 732 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2752  hypothetical protein  32.7 
 
 		 239 aa  72  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.599109 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6091  SNARE associated Golgi protein  34.33 
 
 		 732 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1912  phospholipase D/transphosphatidylase  31.4 
 
 		 714 aa  70.5  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02677  hypothetical protein  32.29 
 
 		 225 aa  70.9  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2554  hypothetical protein  34.72 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2175  SNARE associated Golgi protein  31.98 
 
 		 220 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5494  SNARE associated Golgi protein  34.54 
 
 		 746 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268451  hitchhiker  0.00450262 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29081  hypothetical protein  35.17 
 
 		 199 aa  67.8  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41130  predicted protein  33.11 
 
 		 304 aa  67  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.156284  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_31234  predicted protein  33.59 
 
 		 174 aa  67  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.066629  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2345  hypothetical protein  36.73 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  30.32 
 
 		 735 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2217  SNARE associated Golgi protein-related protein  29.38 
 
 		 713 aa  65.9  0.0000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107501  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4133  SNARE associated Golgi protein  34.27 
 
 		 230 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.341541 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0646  hypothetical protein  31.36 
 
 		 227 aa  64.7  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0353  hypothetical protein  32.04 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.534909  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4094  SNARE associated Golgi protein  34.27 
 
 		 230 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0630  hypothetical protein  31.36 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1523  phospholipase D/transphosphatidylase  29.84 
 
 		 717 aa  63.9  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>