23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0895 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0895  hypothetical protein  100 
 
 
289 aa  566  1e-160  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00169761 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1922  hypothetical protein  51.15 
 
 
220 aa  206  3e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0722012 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1472  hypothetical protein  35.43 
 
 
266 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1191  hypothetical protein  32.26 
 
 
215 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000156419  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0757  hypothetical protein  31.22 
 
 
205 aa  100  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.321867  normal  0.794251 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3137  hypothetical protein  34.6 
 
 
202 aa  89.7  6e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3948  putative CbiL protein  34.6 
 
 
197 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3208  putative CbiL protein  34.47 
 
 
197 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.487085  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2021  hypothetical protein  31.56 
 
 
232 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000158905  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1322  hypothetical protein  34.65 
 
 
210 aa  79.3  0.00000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1366  hypothetical protein  34.21 
 
 
208 aa  77.4  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2094  hypothetical protein  26.64 
 
 
186 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0202879  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3110  hypothetical protein  35.42 
 
 
112 aa  60.5  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000231374  normal  0.507258 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1347  hypothetical protein  32.73 
 
 
150 aa  57  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0331737  hitchhiker  0.0000160464 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3499  hypothetical protein  30.05 
 
 
175 aa  51.6  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.128517  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1955  hypothetical protein  30.84 
 
 
147 aa  47.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.436822  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08901  hypothetical protein  29.77 
 
 
168 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1132  hypothetical protein  27.38 
 
 
148 aa  46.6  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.553572 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3140  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  28.36 
 
 
430 aa  46.2  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00188953  normal  0.574819 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3435  ABC-type Co2+ transport system permease component-like protein  27.01 
 
 
190 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.700435  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1960  hypothetical protein  40 
 
 
210 aa  42.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0172  hypothetical protein  29.29 
 
 
138 aa  42.4  0.009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0706  hypothetical protein  31.73 
 
 
135 aa  42.4  0.01  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>